| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 6041484 | 96 (1.120) | 4 (0.050) | 4/338 | NT | 4.0% | coding (440/723 nt) | rph | Ribonuclease PH |
| ? | AE015451 | = 6041615 | 103 (1.260) | coding (309/723 nt) | rph | Ribonuclease PH | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GTCCAGGTCGAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCG > AE015451/6041390‑6041841 | gTCCAGGTCGAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCagcgcggc < 1:65464‑M2/234‑9 (MQ=255) gAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCAGCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCCGCGaa > 1:1418733/1‑235 (MQ=255) gAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCagcgcggc < 2:1441409‑M2/225‑9 (MQ=255) aGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACg > 1:350349/1‑236 (MQ=255) aCCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGc > 2:1071236/1‑235 (MQ=255) ccGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCagcgc < 1:1236930‑M2/217‑6 (MQ=255) ttCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATc < 1:1230730/235‑1 (MQ=255) tCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCa < 1:999253/235‑1 (MQ=255) cGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGCACGGCCGATCa > 2:887746/1‑234 (MQ=255) tACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATTGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCagcg > 1:1127303‑M2/1‑190 (MQ=255) tACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAggg > 1:171037/1‑236 (MQ=255) tACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAgg > 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aGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGt > 1:151279/1‑225 (MQ=255) aGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCatc > 1:616568/1‑232 (MQ=255) aGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCt > 1:49551/1‑236 (MQ=255) cGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCAccc > 2:637032/1‑233 (MQ=255) aTCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCtt < 1:1038532/236‑1 (MQ=255) tGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCa < 2:627589/207‑1 (MQ=255) agAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACggctg < 2:1406464/235‑1 (MQ=255) gCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACggctggct > 1:944028/1‑236 (MQ=255) cGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGgcg > 2:1275412/1‑192 (MQ=255) gggTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGgcg > 1:61382/1‑191 (MQ=255) ggTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTc < 1:518912/235‑1 (MQ=255) 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cGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGTCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTacac > 2:1198851/1‑213 (MQ=255) cGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCg > 2:1025979/1‑231 (MQ=255) gCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCTTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCg > 1:297305/1‑139 (MQ=255) gCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGc > 2:1279403/1‑233 (MQ=255) cGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACt > 1:365358/1‑236 (MQ=255) ccGTACAGGTGGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGcgcg < 2:344174/141‑1 (MQ=255) cGTACAGGGTGATGTCACCGGGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAg < 2:875130/190‑1 (MQ=255) gTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTg > 1:1502187/1‑235 (MQ=255) gTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGGcagc > 2:329847/1‑166 (MQ=255) aCAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGcgcg < 2:1142527/138‑1 (MQ=255) tGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCCGCCAGCCTTGGCCCTGGGCTTTGAGGAAGCGCGGTACCACGTTTTCAACCCTGCCCGTGc > 2:468335/1‑216 (MQ=255) tGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCg < 1:938657/236‑1 (MQ=255) tGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCg < 1:1071239/236‑1 (MQ=255) gATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGTCACGGCTGGCtt < 2:700311/101‑1 (MQ=255) gATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGTCACGGCTGGCtt > 1:700313/1‑101 (MQ=255) tGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCg < 2:1151661/233‑1 (MQ=255) tGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCg < 2:753619/233‑1 (MQ=255) gTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACt > 1:545733/1‑236 (MQ=255) tCACCGAGCTTGCTCATGTCCagcgcggcggcctcaagggcggcaacccgctcaagcacatgatcgctgccgtgtcggtaggcatgtatca > 2:496956‑M2/1‑21 (MQ=255) cGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGAc > 1:1059448/1‑235 (MQ=255) ggCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGACCGGCCGATCAGGCGCTGGATGTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTc < 1:50627/229‑1 (MQ=255) aGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGgtgt < 2:860661/220‑1 (MQ=255) aGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGgtgt > 1:860663/1‑220 (MQ=255) aGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAg > 1:1325183/1‑236 (MQ=255) aGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAg > 1:121071/1‑236 (MQ=255) cTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGAcc > 2:1313822/1‑232 (MQ=255) tGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCg > 2:503311/1‑221 (MQ=255) tGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCg < 1:503313/221‑1 (MQ=255) cctggaaatCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTAcc > 1:1414445/9‑236 (MQ=255) gCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCCGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTg > 1:211065/1‑199 (MQ=255) cTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTcagccag < 2:171036/144‑1 (MQ=255) cTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTgg < 2:867995/150‑1 (MQ=255) tCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGcgcg < 2:880834/114‑1 (MQ=255) aTGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTgg > 1:373324/1‑147 (MQ=255) aTGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTgg < 2:373322/147‑1 (MQ=255) aTGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCa > 2:578797/1‑197 (MQ=255) cAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGCGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGCGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGCAGCGCGGGACACCGTTTTCAACCCTGAc > 2:212154/1‑186 (MQ=255) | GTCCAGGTCGAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCG > AE015451/6041390‑6041841 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |