| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | AE015451 | 2639792 = | 80 (0.930) | 4 (0.050) | 4/340 | NT | 5.2% | coding (865/1479 nt) | PP_2310 | Methyl‑accepting chemotaxis transducer |
| ? | AE015451 | 2639812 = | 69 (0.840) | coding (845/1479 nt) | PP_2310 | Methyl‑accepting chemotaxis transducer | |||||
ACGGCAAAGCCACGGCCTAGGTCGCCGGCGCGCGCGGCTTCGATGGCAGCGTTAAGCGCCAGCAAGTTGGTCTGTTCGGCAATACTGTGGATCACACTGACTACACCGTTGATCTTCTGGCTGTCCTCGGCTAGTTGTCGAATCATCTCGGCAGTTTGTTGCACGCCGCTGGAAAGCCCGGAAATCGAATCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGCCTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGAGCATGCCATGGCGTACGTCGCTCATGCTGGCGGCCAGGCGTGCAGCGCCCGAGTCCAGCTGTGCTGCGCTGTGGGCGACGGTGCTGACCACGCGGTGATAGGTGGACTGCATGGCG > AE015451/2639581‑2640045 | acGGCAAAGCCACGGCCTAGGTCGCCGGCGCGCGCGGCTTCGATGGCAGCGTTAAGCGCCAGCAAGTTGGTCTGTTCGGCAATACTGTGGATCACACTGACTACACCGTTGATCTTCTGGCTGTCCTCGGCTAGTTGTCGAATCATCTCGGCAGTTTGTTGCACGCCGCTGGAAAGCCCGGAAATCGAATCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTc > 1:1025228/1‑236 (MQ=255) cgcgcgcgGCTTCGATGGCAGCGTTAAGCGCCAGCAAGTTGGTCTGTTCGGCAATACTGTGGATCACACTGACTACACCGTTGATCTTCTGGCTGTCCTCGGCTAGTTGTCGAATCATCTCGGCAGTTTGTTGCACGCCGCTGGAAAGCCCGGAAATCGAATCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTgg > 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tCGATGGCAGCGTTAAGCGCCAGCAAGTTGGTCTGTTCGGCAATACTGTGGATCACCCTGACTACACCGTTGATCTTCTGGCTGTCCTCGGCTAGTTGTCGAATCATCTCGGCAGTTTGTTGCACGCCGCTGGAAAGCCCGGAAATCGAATCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCa < 1:1420291/225‑1 (MQ=255) gATGGCAGCGTTAAGCGCCAGCAAGTTGGTCTGTTCGGCAATACTGTGGATCACACTGACTACACCGTTGATCTTCTGGCTGTCCTCGGCTAGTTGTCGAATCATCTCGGCAGTTTGTTGCACGCCGCTGGAAAGCCCGGAAATCGAATCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTgg < 1:5941/235‑1 (MQ=255) ttAAGCGCCAGCAAGTTGGTCTGTTCGGCAATACTGTGGATCACACTGACTACACCGTTGATCTTCTGGCTGTCCTCGGCTAGTTGTCGAATCATCTCGGCAGTTTGTTGCACGCCGCTGGAAAGCCCGGAAATCGAATCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATgtggt < 1:596207/235‑1 (MQ=255) cAAGTTGGTCTGTTCGGCAATACTGTGGATCACACTGACTACACCGTTGATCTTCTGGCTGTCCTCGGCTAGTTGTCGAATCATCTCGGCAGTTTGTTGCACGCCGCTGGAAAGCCCGGAAATCGAATCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGcc > 1:1383861/1‑235 (MQ=255) aGTTGGTCTGTTCGGCAATACTGTGGATCACACTGACTACACCGTTGATCTTCTGGCTGTCCTCGGCTAGTTGTCGAATCATCTCGGCAGTTTGTTGCACGCCGCTGGAAAGCCCGGAAATCGAATCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCa < 2:910716/215‑1 (MQ=255) ttCGGCAATACTGTGGATCACACTGACTACACCGTTGATCTTCTGGCTGTCCTCGGCTAGTTGTCGAATCATCTCGGCAGTTTGTTGCACGCCGCTGGAAAGCCCGGAAATCGAATCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATgtggt < 2:1416550/212‑1 (MQ=255) ggCAATACTTTGGATCACACTGACTACACCGTTGATCTTCTGGCTGTCCTCGGCTAGTTGTCGAATCATCTCGGCAGTTTGTTGCACGCCGCTGGAAAGCCCGGAAATCGAATCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCa < 2:536906/202‑1 (MQ=255) 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gccgcTGGAAAGCCCGGAAATCGAATCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGCCTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGAGCATGCCATGGCGTACGTCGCTCATGCTGGCGGCCAGGCGTGCAGCGccc < 2:700434/235‑1 (MQ=255) gccggtgccacccgcgatttgtcacaaaccgccgacacCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGCCTGGGCGGTTTCa < 1:963798‑M1/125‑1 (MQ=255) acgcgcGGAATTCGAATCCTGCCCTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATgtggt < 2:482742/108‑1 (MQ=255) aGCCCGGAAATCGAATCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGCCTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGAGCATGCCATGGCGTACGTCGCTCATGCTGGCGGCCAGGCGTGCAGCGCCCGAGTcc > 2:888663/1‑231 (MQ=255) aGCCCGGAAATCGAATCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGCGTCACCGGCGTGCGGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTc > 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tCGACTCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGCCTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGa < 2:175645/165‑1 (MQ=255) aaTCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGCCTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGAGCATGCCATGGCGTACGTCGCTCATGCTGGCGGCCAGGCGTGCAGCGCCCGAGTCCAGCTGTGCTGCGCTGTgg < 1:1328488/236‑1 (MQ=255) cTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGCCTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGAGCATGCCATGGCGTACGTCGCTCATGCTGGCGGCCAGGCGTGCAGCGCCCGAGTCCAGCTGTGCTGCGCTGTggg < 2:1199058/233‑1 (MQ=255) aCTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGCCTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGAGCATGCCATGGCGTACGTCGCTCATGCTGGCGGCCAGGCGTGCAGCGCCCGa < 2:1194332/206‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGCCTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGAGCATGCCATGGCCTACGTCGCt > 2:86467/1‑152 (MQ=255) gCCGGACAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGTTGGGTAATTTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGACTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGAGCAt < 2:1146354/132‑1 (MQ=255) ccGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCAACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGCCTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGAGCATGCCATGGCGTACGTCGCTCATGCTGGCGGCCAGGCGTGCAGCGCCCGAGTCCAg > 2:1387805/1‑185 (MQ=255) cggccaagGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGTGGCCTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGAGCATGCCATGGCGTACGTCGCTCATGCTGGCGGCCAGGCg < 1:349191‑M2/158‑1 (MQ=255) cggccaagGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGCCTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGAGCATGCCATGGCGTACGTCGCTCATGCTGGCGGCCAGGCGTGCAGCGCCCGAGTc < 1:656730‑M2/173‑1 (MQ=255) cggccaagGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGCCTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGAGCATGCCATGGCGTACGTCGCTCATGCTGGCGGCCAGGCGTGCAGCGCCCGAGTCCAGCTGTGCTGCGCTGTGGGCGACGGTGCTGACCACGCGGTGATAGGTGGACTGc < 1:504039‑M2/228‑1 (MQ=255) agGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGCCTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGAGCATGCCATGGCGTACGTCGCTCATGCTGGCGGCCAGGCGTGCAGCGCCCGAGTCCAGCTGTGCTGCGCTGTGGGCGACGGTGCTGACCACGCGGTGATAGGTGGACTGCATGGCg < 1:262103‑M2/234‑1 (MQ=255) | ACGGCAAAGCCACGGCCTAGGTCGCCGGCGCGCGCGGCTTCGATGGCAGCGTTAAGCGCCAGCAAGTTGGTCTGTTCGGCAATACTGTGGATCACACTGACTACACCGTTGATCTTCTGGCTGTCCTCGGCTAGTTGTCGAATCATCTCGGCAGTTTGTTGCACGCCGCTGGAAAGCCCGGAAATCGAATCCTGCACTCGGCTGACTACCGCTTGGCCGCTGCCGGCCAAGGTGTCGGCGGTTTGTGACAAATCGCGGGTGGCACCGGCGTGCTGGGCAATGTGGTGCACGGTCGCCGACATTTCGTTGATGGCAGTGGCGGCCTGGTCGGTTTCACTCTGCTGGCCGAGCATGCCATGGCGTACGTCGCTCATGCTGGCGGCCAGGCGTGCAGCGCCCGAGTCCAGCTGTGCTGCGCTGTGGGCGACGGTGCTGACCACGCGGTGATAGGTGGACTGCATGGCG > AE015451/2639581‑2640045 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |