| New junction evidence | |||||||||||
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cgccTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGaa < 2:1093150/228‑1 (MQ=255) gaacacgCTCCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGa < 2:705305/202‑1 (MQ=255) aCCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTCAAGGTATGGTCAGCATCg < 2:677857/229‑1 (MQ=255) cGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGt > 1:209475/1‑222 (MQ=255) 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(MQ=255) aCCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAgcgc < 1:364480/218‑1 (MQ=255) cGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGTGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATcac < 2:1074951/144‑1 (MQ=255) gCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCctgctg < 2:23040/98‑1 (MQ=255) gCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCctgctg > 1:23040/1‑98 (MQ=255) cgcgctcgtagtccgggaatttgccgtccaccagcttggaggtaaaggtgaactcaccagtagtggcgcggatgtgatgctggcccagcacgaTGCTGACCGATCCTg < 1:400161‑M1/15‑1 (MQ=255) cgcgctcgtagtccgggaatttgccgtccaccagcttggaggtaaaggtgaactcaccagtagtggcgcggatgtgatgctggcccagcacgaTGCTGACCGATCCTg > 2:400158‑M1/94‑108 (MQ=255) tGGCGCCTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAATGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCg < 2:848765/123‑1 (MQ=255) gcgcTTTGCTCGATGAGCGGGCCGATCGAGAAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGAGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACg < 2:416654/187‑1 (MQ=255) tCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCACAAAGGCGGt > 1:77720/1‑219 (MQ=255) cgcCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTAc > 1:942160/1‑195 (MQ=255) cGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAg > 2:387183/1‑185 (MQ=255) gATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCg < 2:906398/98‑1 (MQ=255) gaggaTCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACg < 2:139056/172‑1 (MQ=255) gACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAg < 1:845245/76‑1 (MQ=255) gACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAg > 2:845242/1‑76 (MQ=255) ccAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAg < 2:739027/231‑1 (MQ=255) aGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcg > 2:517161/1‑97 (MQ=255) aGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcg < 1:517164/97‑1 (MQ=255) aGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTa < 2:1073838/234‑1 (MQ=255) gTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACGACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGCCggaa > 2:103152/1‑140 (MQ=255) cATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGTCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAg > 2:664652/1‑233 (MQ=255) tCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGc < 1:1190284/217‑1 (MQ=255) gtagtggcgcggatgtgatgctggcccagcacgaTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAAt > 1:1229618‑M1/35‑139 (MQ=255) gtagtggcgcggatgtgatgctggcccagcacgaTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAAt < 2:1229615‑M1/105‑1 (MQ=255) gTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCaa > 1:1206021/1‑235 (MQ=255) cggatgtgatgctggcccagcacgaTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGa < 1:575745‑M1/211‑1 (MQ=255) aaaGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAgcgc < 2:1219968/147‑1 (MQ=255) gatgtgatgctggcccagcacgaTGCTGACCGATCCTGAAGGGATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCact < 1:288278‑M1/62‑1 (MQ=255) tGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAGTACcgc > 1:547321/1‑236 (MQ=255) tGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAGTACcg > 1:1243136/1‑235 (MQ=255) tGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTACCAACGaaa > 1:61545/1‑228 (MQ=255) ccagcacgaTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAACAGTa < 1:1059390‑M1/217‑1 (MQ=255) gcgcgcCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCgg < 2:534660/164‑1 (MQ=255) gcgcCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGa > 2:1251853/1‑216 (MQ=255) gcgcCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAg < 2:619113/220‑1 (MQ=255) gcCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAGTa < 1:745938/220‑1 (MQ=255) | GAGCAGAGCAAGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAGTACCGC > AE015451/11493‑11942 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |