New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 11722 = | 71 (1.030) | 7 (0.110) | 7/322 | NT | 10.3% | coding (620/1104 nt) | dnaN | DNA polymerase III subunit beta |
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ACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAGTACCGCGGTATTCGCCTGCAGCTGGCAGCCGGTCAACTGAAGAT > AE015451/11526‑11980 | aCCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTCAAGGTATGGTCAGCATCg < 2:677857/229‑1 (MQ=255) cGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGt > 1:209475/1‑222 (MQ=255) tactgttcgttggaaagaatcgctgtacggctgaaggcttcacgcagcgcctggcggtctccgacgaccagcttgtcaccgcctttgggcagtacgcgctcgtagtccgggaatttgccgtccaccagcttggaggtaaaggtgaactcaccagtagtggcgcggatgtgatgctggcccagcacgatgctgaccataccttcaggatcggtcagcaTCGTGCTgg < 1:1059390‑M2/9‑1 (MQ=255) tcgttggaaagaatcgctgtacggctgaaggcttcacgcagcgcctggcggtctccgacgaccagcttgtcaccgcctttgggcagtacgcgctcgtagtccgggaatttgccgtccaccagcttggaggtaaaggtgaactcaccagtagtggcgcggatgtgatgctggcccagcacgatgctgaccataccttcaggatcggtcagcaTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcg < 1:575745‑M2/25‑1 (MQ=255) ccAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCAt > 2:414645/1‑210 (MQ=255) ccAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcgcg > 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> 1:77720/1‑219 (MQ=255) atttgccgtccaccagcttggaggtaaaggtgaactcaccagtagtggcgcggatgtgatgctggcccagcacgatgctgaccataccttcaggatcggtcagcaTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCactac > 1:1229618‑M2/106‑139 (MQ=255) atttgccgtccaccagcttggaggtaaaggtgaactcaccagtagtggcgcggatgtgatgctggcccagcacgatgctgaccataccttcaggatcggtcagcaTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCactac < 2:1229615‑M2/34‑1 (MQ=255) cgcCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTAc > 1:942160/1‑195 (MQ=255) cGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAg > 2:387183/1‑185 (MQ=255) gATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCg < 2:906398/98‑1 (MQ=255) 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tGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAGTACcgc > 1:547321/1‑236 (MQ=255) tGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAGTACcg > 1:1243136/1‑235 (MQ=255) tGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTACCAACGaaa > 1:61545/1‑228 (MQ=255) ccagcacgaTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAACAGTa < 1:1059390‑M1/217‑1 (MQ=255) gcgcgcCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCgg < 2:534660/164‑1 (MQ=255) gcgcCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGa > 2:1251853/1‑216 (MQ=255) gcgcCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAg < 2:619113/220‑1 (MQ=255) gcCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAGTa < 1:745938/220‑1 (MQ=255) gATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCTGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGaa > 1:14753/1‑204 (MQ=255) cTGAAGGTATGGTCAGCGTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGTTGAGTTCACCTTTGCCTCCAAGCTGGTGGACGGCCACTTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAg < 1:558331/123‑1 (MQ=255) gAAGGTATGGTCAGCATCGGGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAACTGGTGGACGGCAAATCCCCGGCCTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAAc < 1:442044/195‑1 (MQ=255) caggatcggtcagcaTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGcgcg < 1:400161‑M2/93‑1 (MQ=255) caggatcggtcagcaTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGcgcg > 2:400158‑M2/16‑108 (MQ=255) aaGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAGTACCGCGGTATTCGCCTGCAGCTGGCAGCCGGTCaa < 1:1139648/236‑1 (MQ=255) ggtcagcaTCGTGCTGGGCCAGAATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGc < 2:262490‑M2/151‑1 (MQ=255) gtcatcaTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAAGTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGa > 2:952637‑M2/8‑155 (MQ=255) gtcagcaTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGAc > 1:782518‑M2/8‑138 (MQ=255) gtcagcaTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGAc < 2:782515‑M2/131‑1 (MQ=255) gtcagcaTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCttt < 1:781754‑M2/174‑1 (MQ=255) gtcagcaTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCttt > 2:781751‑M2/8‑181 (MQ=255) gtcagcaTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAGTACCGCGGTATTCGCCTGCAGCTGGCAGCCGGTCAacg > 1:1146567‑M2/8‑229 (MQ=255) gtcagcaTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAGTACCGCGGTATTCGCCTGCAGCTGGCAGCCGGTCAACTGAAGAt > 1:735530‑M2/8‑236 (MQ=255) gtcagcaTCGTGCTGGGCCAGCACCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGc < 2:308438‑M2/144‑1 (MQ=255) tcagcaTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGgtcgtc > 2:178836‑M2/7‑131 (MQ=255) tcagcaTCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAGTACCGCGGTATTCGCCTGCAGCTGGCAGCCGGTCAACTGAAg > 2:795486‑M2/7‑233 (MQ=255) | ACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTACCTCCAAGCTGGTGGACGGCAAATTCCCGGACTACGAGCGCGTACTGCCCAAAGGCGGTGACAAGCTGGTCGTCGGAGACCGCCAGGCGCTGCGTGAAGCCTTCAGCCGTACAGCGATTCTTTCCAACGAAAAGTACCGCGGTATTCGCCTGCAGCTGGCAGCCGGTCAACTGAAGAT > AE015451/11526‑11980 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |