| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 1260043 = | 56 (0.820) | 4 (0.060) | 4/320 | NT | 7.0% | coding (1408/2451 nt) | PP_1103 | ATP‑dependent helicase, DEAD box family |
| ? | AE015451 | 1260090 = | 53 (0.820) | coding (1361/2451 nt) | PP_1103 | ATP‑dependent helicase, DEAD box family | |||||
CAGCCTTGCGCGCCGTGCTGCGACGCACATAGGCCGTCATGTTTTCCACGCGTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGACCAGATGCTGTACCAGCACGT > AE015451/1259821‑1260276 | catcgaagcccgctttttaccgcgcctgtgcatggacgtgctggtacagcatctggtcagcatggccttgggcagcggttttcgcccggagcaactgctcgccgaagtgcgcagcacctgggcttttcgccagttgcgcgacagccaatggcaatgggcgctggacttcgtctgccacggcggcagctcattgaccgcctacccggactaccagcgtgtcgagcgc < 2:787364‑M1/4‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCTGCGACGCACATAGGCCGTCATGTTTTCCACGCGTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTa < 1:144696/236‑1 (MQ=255) gcgcgcCGTGCTGCGACGCACATAGGCCGTCATGTTTTCCACGCGTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGgcgccg < 1:635590/216‑1 (MQ=255) gctgcGACGCACATAGGCCGTCATGTTTTCCACGCGTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTaaa > 1:912903/1‑236 (MQ=255) aTAGGCCGTCATGTTTTCCACGCGTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGcc > 1:805784/1‑235 (MQ=255) cGTCATGTTTTCCACGCGTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGgcgcg < 1:39062/236‑2 (MQ=255) cATGTTTTCCACGCGTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCg < 1:1011853/235‑1 (MQ=255) aTGTTTTCCACGCGTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTc > 2:1107753/1‑233 (MQ=255) gcgTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCCGCCTGGCCCt > 2:833968/1‑221 (MQ=255) ccAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGgcgccgcgcc > 2:696280/1‑173 (MQ=255) ccAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGgcgccgcgcc < 1:696283/173‑1 (MQ=255) aGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTa < 1:921925/236‑1 (MQ=255) cccgcccgGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAAt > 1:1240498/1‑236 (MQ=255) cccgcccgGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAAt > 1:1162471/1‑236 (MQ=255) cccgcccgGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCACTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCa > 2:679756/1‑234 (MQ=255) tgggcagcggttttcgcccggagcaactgctcgccgaagtgcgcagcacctgggcttttcgccagttgcgcgacagccaatggcaatgggcgctggacttcgtctgccacggcggcagctcattgaccgcctacccggactaccagcgtgtcgag < 1:608632‑M1/1‑1 (MQ=255) cgGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGCGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTaaa > 2:993655/1‑180 (MQ=255) gCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAgg > 2:854903/1‑156 (MQ=255) gCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGgcgcggcg > 2:798179/1‑195 (MQ=255) gCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGgcgcggcg < 1:798182/199‑5 (MQ=255) ccacCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTGTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTg < 2:20097/160‑1 (MQ=255) cAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTgg < 1:396301/235‑1 (MQ=255) cGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTc > 1:698126/1‑235 (MQ=255) cgcAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGCAGt > 2:994088/1‑229 (MQ=255) cgcAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCACCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCa > 1:693897/1‑232 (MQ=255) cAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCCGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTgg > 2:608629/1‑140 (MQ=255) ggcgATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGGTGACGCCGTGGCAGACGAAg > 2:462750/1‑220 (MQ=255) agacagcttcAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTCTTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGCTGCCGATGCCCATGCGGTGGTGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCACTGCCATTGGCTg < 1:1210837/230‑1 (MQ=255) tcttcAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTcgcg < 1:637879/236‑1 (MQ=255) cttcAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTcg > 2:1162102/1‑233 (MQ=255) acacTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTc < 2:470006/203‑1 (MQ=255) ccAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGgcg > 2:1153943/1‑136 (MQ=255) 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ttCCCGCCGCCGGCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAATCTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAg < 1:663539/234‑1 (MQ=255) tCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTg < 1:476224/220‑1 (MQ=255) cgccgccgcCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGgcg > 2:16126/1‑124 (MQ=255) cTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAg < 1:570939/236‑1 (MQ=255) gacttcgtctgccacggcggcagctcattgaccgcctacccggactaccagcgtgtcgaGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTCGTCCGGGTAGGCGGGCAATGAGCggccgccgcg < 1:426003‑M1/94‑3 (MQ=255) tttCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGt < 2:938028/210‑1 (MQ=255) tttCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTg > 2:659356/1‑234 (MQ=255) cAGTTGCAGGTTGGCAGCGCTGACGGTGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCg < 2:215789/103‑1 (MQ=255) acggcggcagctcattgaccgcctacccggactaccagcgtgtcgaGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGc < 1:1195084‑M1/56‑1 (MQ=255) 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tGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCAGGGCGaa > 1:92180/1‑231 (MQ=255) aCGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCccattgccatt < 2:687227/154‑1 (MQ=255) tacccggactaccagcgtgtcgaGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGt < 2:648271‑M1/36‑1 (MQ=255) ccGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCt < 2:805781/218‑1 (MQ=255) ccGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGa < 1:663170/235‑1 (MQ=255) gATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGAcc > 1:1118127/1‑235 (MQ=255) tGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGGGCAGTTGCTcc > 1:17073/1‑200 (MQ=255) tGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGACCAg > 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gTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGACCAGATGCTGTACCa < 1:1227879/236‑1 (MQ=255) gTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGACCAGATGCTGTACCa < 1:918692/236‑1 (MQ=255) tGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAgcgc < 1:714187/119‑1 (MQ=255) gtgtcgaGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAg < 2:1268745‑M1/172‑1 (MQ=255) gcgccgcgccAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGACCAGATGCTGTACCAGCa < 1:750982/236‑1 (MQ=255) ccgcgccAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGACCAGATGCTGTACCAGCACGt > 1:1159756/1‑236 (MQ=255) cgcgccAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGACCAg < 2:445818/218‑1 (MQ=255) | CAGCCTTGCGCGCCGTGCTGCGACGCACATAGGCCGTCATGTTTTCCACGCGTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGACCAGATGCTGTACCAGCACGT > AE015451/1259821‑1260276 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |