New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | 1260043 = | 56 (0.820) | 4 (0.060) | 4/320 | NT | 7.0% | coding (1408/2451 nt) | PP_1103 | ATP‑dependent helicase, DEAD box family |
? | AE015451 | 1260090 = | 53 (0.820) | coding (1361/2451 nt) | PP_1103 | ATP‑dependent helicase, DEAD box family |
CATGTTTTCCACGCGTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGACCAGATGCTGTACCAGCACGTCCATGCACAGGCGCGGTGAAAAGCGGGCTTCGATG > AE015451/1259858‑1260311 | cATGTTTTCCACGCGTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCg < 1:1011853/235‑1 (MQ=255) aTGTTTTCCACGCGTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTc > 2:1107753/1‑233 (MQ=255) gcgTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCCGCCTGGCCCt > 2:833968/1‑221 (MQ=255) aGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTa < 1:921925/236‑1 (MQ=255) cccgcccgGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAAt > 1:1162471/1‑236 (MQ=255) cccgcccgGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAAt > 1:1240498/1‑236 (MQ=255) cccgcccgGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCACTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCa > 2:679756/1‑234 (MQ=255) cAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTgg < 1:396301/235‑1 (MQ=255) 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cttcAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTcg > 2:1162102/1‑233 (MQ=255) acacTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTc < 2:470006/203‑1 (MQ=255) aGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGt > 2:372864/1‑157 (MQ=255) aGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGc > 1:940179/1‑236 (MQ=255) 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cTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAg < 1:570939/236‑1 (MQ=255) gacttcgtctgccacggcggcagctcattgaccgcctacccggactaccagcgtgtcgaGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTCGTCCGGGTAGGCGGGCAATGAGCggccgccgcg < 1:426003‑M1/94‑3 (MQ=255) tttCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGt < 2:938028/210‑1 (MQ=255) tttCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTg > 2:659356/1‑234 (MQ=255) 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ccGGGAAGCTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCg < 2:267905/120‑1 (MQ=255) gaaaCTCCGCCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGc < 2:931408/159‑1 (MQ=255) aaCTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAg > 1:132464/1‑70 (MQ=255) aaCTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAg < 2:132464/70‑1 (MQ=255) aaCTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGACCAg < 1:666079/189‑1 (MQ=255) aCTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTg < 2:589797/183‑1 (MQ=255) cGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCTTGCTGACCAGATGCTGTACCAGCACGTCCATGCACAGGCGCGGTGAAAAGCGGGCTTCGAtg < 1:679759/236‑1 (MQ=255) cGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGACCAGATGCTGTACCAGCACGTCCATGCACAGGCGCGGTGAAAAGCGGGCTTCGAtg < 1:807702/236‑1 (MQ=255) tCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGGCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCgcgc > 2:374717/1‑99 (MQ=255) cGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGACCa > 1:91315/1‑180 (MQ=255) gcgcTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGACCAGATGCTGTACCAGCACGTCCATGCACAGGCGCGGTAAAAAGCGGGCTTCGAtg < 2:787364‑M2/222‑1 (MQ=255) cTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCa < 1:608632‑M2/154‑1 (MQ=255) | CATGTTTTCCACGCGTACCAGCTCTAGTACCCGCCCGGCAAACACCAGGGTATCGCCGGGGCGCAGGCGGGCGATGAACGCTTCTTCAACACTGCCCAGCGTTTTCCCGCCGCCGCCCTTGCTCCAGTATTTCAGTTGCAGGTTGGCATCGCTGACGATGGTGCCGATGCCCATGCGGTGGCGCCGCGCCAGGCGTTCGCTGGTAACCCGGTAAACTCCGTCGGCCTGGCGCTCGACACGCTGGTAGTCCGGGTAGGCGGTCAATGAGCTGCCGCCGTGGCAGACGAAGTCCAGCGCCCATTGCCATTGGCTGTCGCGCAACTGGCGAAAAGCCCAGGTGCTGCGCACTTCGGCGAGCAGTTGCTCCGGGCGAAAACCGCTGCCCAAGGCCATGCTGACCAGATGCTGTACCAGCACGTCCATGCACAGGCGCGGTGAAAAGCGGGCTTCGATG > AE015451/1259858‑1260311 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |