New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 3862642 | 69 (1.010) | 4 (0.060) | 4/318 | NT | 5.3% | coding (1565/3282 nt) | PP_3413 | Sensor histidine kinase/response regulator |
? | AE015451 | = 3862691 | 77 (1.190) | coding (1614/3282 nt) | PP_3413 | Sensor histidine kinase/response regulator |
GAGCAGCCATATCAATGCTGCCTATTACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGACCAAAAGC > AE015451/3862436‑3862877 | gcgcagccaTATCAATGCTGCCTATTACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACctgcaaagccagggtgcggt < 2:973331‑M1/225‑21 (MQ=255) ccATATCAATGCTGCCTATTACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGc < 1:325102/235‑1 (MQ=255) tatCAATGCTGCCTATTACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCg > 2:571374/1‑209 (MQ=255) tatCAATGCTGCCTATTACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAg > 2:969085/1‑213 (MQ=255) tCAATGCTGCCTATTACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGAc < 1:1006611/224‑1 (MQ=255) aTGCTGCCTATTACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGc > 2:1068120/1‑203 (MQ=255) ccTATTACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCg > 2:1078412/1‑198 (MQ=255) aTTACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTg > 1:875182/1‑224 (MQ=255) aTTACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACAACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTgg < 1:1210158/206‑1 (MQ=255) tACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGgtgct > 1:250468‑M2/1‑231 (MQ=255) cAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTgg > 2:439157/1‑182 (MQ=255) gCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGc < 2:691198/217‑1 (MQ=255) ccATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGCCGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGt < 1:291895/236‑1 (MQ=255) ccATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGt > 1:284972/1‑236 (MQ=255) aTGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCTGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCt > 1:659929/1‑215 (MQ=255) aTGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTc > 2:621931/1‑235 (MQ=255) ttCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCCGGTGCTGGTGCTGTCgg > 2:991206/1‑232 (MQ=255) ttCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGcc > 2:1126870/1‑234 (MQ=255) aaGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACctgcaaagccagggtgcggtagtcgcgccaggggctgtcgctca > 2:1130544‑M1/1‑164 (MQ=255) aaGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACctgcaaagccagggtgcggtagtcgcgccaggggctgtcgctca < 1:1130547‑M1/208‑45 (MQ=255) gACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTg > 1:365296/1‑207 (MQ=255) tGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCg > 2:819418/1‑187 (MQ=255) tGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGcc > 2:652258/1‑233 (MQ=255) tGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCggg < 1:571377/236‑1 (MQ=255) tGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCggg < 1:652261/236‑1 (MQ=255) cgcATCGCCAACAAGCTCGACGACGCTCCGACCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCgggg < 1:972450/235‑1 (MQ=255) gCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCctg < 2:1147702/216‑1 (MQ=255) tGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAg < 2:24389/148‑1 (MQ=255) tCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGt < 1:242408/236‑1 (MQ=255) tCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGt < 1:1164603/236‑1 (MQ=255) gacgccGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCgggg < 2:1094133/217‑1 (MQ=255) cTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCa > 2:591994/1‑175 (MQ=255) tCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGggtg > 2:826906/1‑211 (MQ=255) ttGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGCCCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCg < 2:172287/198‑1 (MQ=255) ccgccTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTGGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCggg < 1:298993/197‑1 (MQ=255) gccTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCa < 1:1233119/236‑1 (MQ=255) cGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCAc > 2:1090425/1‑234 (MQ=255) gACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCa < 1:819421/236‑1 (MQ=255) cAATTGCATGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCa < 1:888090/236‑1 (MQ=255) aTTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAg < 1:621934/235‑1 (MQ=255) tGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCa < 1:932038/205‑1 (MQ=255) gCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGAACCCTGGCTTTGCAGGTCCTGGTGCTGTCGGACCAGCCGCTTGCCg > 2:1283127/1‑161 (MQ=255) ggCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCCCCTGAAGACCTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGCCAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGcac < 1:259238/233‑1 (MQ=255) ccATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACctgcaaagccagggtgcggtagtcgcgccaggggctgtcgctcaccagtgtgcaggtgcgccagtggttgatcaactggt > 2:526890‑M1/1‑76 (MQ=255) ccATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTAcc > 2:490013/1‑180 (MQ=255) cATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTgg > 2:724405/1‑169 (MQ=255) cATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTcg > 1:488466/1‑236 (MQ=255) tcGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCa < 1:1247964/220‑1 (MQ=255) aaGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGcc < 1:1126873/235‑1 (MQ=255) cggCGCTGCTAAGCATTCCCCCTGAAGAACTGGACCAGTTGAGCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTTCCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCggg < 2:131288/145‑1 (MQ=255) aGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGcaca > 2:471522/1‑220 (MQ=255) gctgctAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAg > 2:141981/1‑193 (MQ=255) gctgctAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCt > 2:123991/1‑219 (MQ=255) gctgctAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCggg < 1:1090428/235‑1 (MQ=255) gctgctAAGAATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCg > 2:111709/1‑140 (MQ=255) gaaGCATGCCCCCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACCGTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGtt < 2:45943/144‑1 (MQ=255) ttCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGcaca < 1:1241160/187‑1 (MQ=255) tCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAg > 1:1109104/1‑97 (MQ=255) tCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAg < 2:1109101/97‑1 (MQ=255) aCCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTa > 2:982453/1‑235 (MQ=255) aCCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTAc < 1:141981/236‑1 (MQ=255) cTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAgg > 1:162746/1‑177 (MQ=255) cTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGc > 1:1242903/1‑236 (MQ=255) tGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCa < 2:921300/175‑1 (MQ=255) gACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAgg > 1:1220257/1‑235 (MQ=255) aCCAGTTGATCAACCACTGGCGCACCTGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGgtgctggtgcgccagcggttgatcaactggtccagttcttcaggtggaatgcttagcagcgccttgtcgagaatgg > 2:526890‑M2/1‑80 (MQ=255) ttGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGc < 1:123991/236‑1 (MQ=255) gATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGaa > 2:47558/1‑120 (MQ=255) tCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGgctgct < 2:488463/202‑1 (MQ=255) ccGCGGGCGAACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCaa < 1:17907/219‑1 (MQ=255) tGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGTCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGgcca < 1:768767/235‑1 (MQ=255) ggCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACTGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCCTCAGGcaca > 2:318191/1‑169 (MQ=255) ggCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGggcggt > 2:278526/1‑100 (MQ=255) gcACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCgg < 2:1037994/75‑1 (MQ=255) gcACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCgg > 1:1037997/1‑75 (MQ=255) aCCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGAc < 1:982456/236‑1 (MQ=255) cAGCACctgcaaagccagggtgcggtagtcgcgccaggggctgtcgctcacca < 1:228575‑M1/53‑48 (MQ=255) aGCACctgcaaagccagggtgcggtagtcgcgccaggggctgtcgctcaccagtgtgctggtgcgccagcggttgatcaactggtccagttcttcaggtggaatgcttagcagcgccttgtcgagaatggcctgcaattggggctggtcggcggctacggcaaaggcggcaatggccggagcgtcgtcgagcatgttggcgatgcgcaaacggtccttgaacacatggctgatgta > 1:250468‑M1/1‑5 (MQ=255) aGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCCAGGACGATGc > 2:953619/1‑215 (MQ=255) cacTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGACCAAAAGc < 1:826909/236‑1 (MQ=255) | GAGCAGCCATATCAATGCTGCCTATTACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGACCAAAAGC > AE015451/3862436‑3862877 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |