| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 3862642 | 69 (1.010) | 4 (0.060) | 4/318 | NT | 5.3% | coding (1565/3282 nt) | PP_3413 | Sensor histidine kinase/response regulator |
| ? | AE015451 | = 3862691 | 77 (1.190) | coding (1614/3282 nt) | PP_3413 | Sensor histidine kinase/response regulator | |||||
TACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGACCAAAAGCACCTTCCTGGCCACCATGAGCCATGAGATCCGC > AE015451/3862461‑3862910 | tACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGgtgct > 1:250468‑M2/1‑231 (MQ=255) ccATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGCCGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGt < 1:291895/236‑1 (MQ=255) ccATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGt > 1:284972/1‑236 (MQ=255) aTGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTc > 2:621931/1‑235 (MQ=255) ttCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCCGGTGCTGGTGCTGTCgg > 2:991206/1‑232 (MQ=255) ttCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGcc > 2:1126870/1‑234 (MQ=255) tGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGcc > 2:652258/1‑233 (MQ=255) tGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCggg < 1:571377/236‑1 (MQ=255) tGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCggg < 1:652261/236‑1 (MQ=255) cgcATCGCCAACAAGCTCGACGACGCTCCGACCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCgggg < 1:972450/235‑1 (MQ=255) gCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCctg < 2:1147702/216‑1 (MQ=255) tCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGt < 1:1164603/236‑1 (MQ=255) tCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGt < 1:242408/236‑1 (MQ=255) gacgccGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCgggg < 2:1094133/217‑1 (MQ=255) tCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGggtg > 2:826906/1‑211 (MQ=255) ttGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGCCCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCg < 2:172287/198‑1 (MQ=255) ccgccTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTGGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCggg < 1:298993/197‑1 (MQ=255) gccTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCa < 1:1233119/236‑1 (MQ=255) cGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCAc > 2:1090425/1‑234 (MQ=255) gACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCa < 1:819421/236‑1 (MQ=255) cAATTGCATGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCa < 1:888090/236‑1 (MQ=255) aTTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAg < 1:621934/235‑1 (MQ=255) tGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCa < 1:932038/205‑1 (MQ=255) gCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGAACCCTGGCTTTGCAGGTCCTGGTGCTGTCGGACCAGCCGCTTGCCg > 2:1283127/1‑161 (MQ=255) ggCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCCCCTGAAGACCTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGCCAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGcac < 1:259238/233‑1 (MQ=255) ccATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTAcc > 2:490013/1‑180 (MQ=255) cATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTgg > 2:724405/1‑169 (MQ=255) cATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTcg > 1:488466/1‑236 (MQ=255) tcGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCa < 1:1247964/220‑1 (MQ=255) aaGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGcc < 1:1126873/235‑1 (MQ=255) cggCGCTGCTAAGCATTCCCCCTGAAGAACTGGACCAGTTGAGCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTTCCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCggg < 2:131288/145‑1 (MQ=255) aGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGcaca > 2:471522/1‑220 (MQ=255) gctgctAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAg > 2:141981/1‑193 (MQ=255) gctgctAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCt > 2:123991/1‑219 (MQ=255) gctgctAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCggg < 1:1090428/235‑1 (MQ=255) gctgctAAGAATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCg > 2:111709/1‑140 (MQ=255) gaaGCATGCCCCCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACCGTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGtt < 2:45943/144‑1 (MQ=255) ttCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGcaca < 1:1241160/187‑1 (MQ=255) tCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAg > 1:1109104/1‑97 (MQ=255) tCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAg < 2:1109101/97‑1 (MQ=255) aCCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTa > 2:982453/1‑235 (MQ=255) aCCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTAc < 1:141981/236‑1 (MQ=255) cTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAgg > 1:162746/1‑177 (MQ=255) cTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGc > 1:1242903/1‑236 (MQ=255) 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tGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGgtgctggtgcgccagcggttgatcaactggtccagttcttcaggtggaatgcttagcagcgccttgtcgagaatggcctgcaattggggctggtcggcggctacggcaaaggcggcaatggccggagcgtcgtcgagcatgttggcgatgcgcaaacggtcctt > 2:1130544‑M2/1‑44 (MQ=255) tGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGgtgctggtgcgccagcggttgatcaactggtccagttcttcaggtggaatgcttagcagcgccttgtcgagaatggcctgcaattggggctggtcggcggctacggcaaaggcggcaatggccggagcgtcgtcgagcatgttggcgatgcgcaaacggtcctt < 1:1130547‑M2/208‑165 (MQ=255) tGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCctt > 2:50789/1‑64 (MQ=255) tGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCa > 2:747502/1‑136 (MQ=255) aGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGcc > 1:155555/1‑187 (MQ=255) cGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTAc < 2:1009575/182‑1 (MQ=255) cGACAGCCCCGGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCaa < 1:216671/192‑1 (MQ=255) gACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCATAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCATGCCAAGGACGATg > 1:644710/1‑199 (MQ=255) gCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGACCAAAAGCACCTTCCTGGccac < 1:927552/235‑1 (MQ=255) gCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGACCAAAAGCACCTTCCTGGccac < 1:528774/235‑1 (MQ=255) ccccTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGACCAGTTACGCCAg > 1:106496/1‑181 (MQ=255) ccTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCa < 2:597565/124‑1 (MQ=255) ccTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGACCAAAAGCACCTTGCTGGCCAccat > 1:668419/1‑235 (MQ=255) gcgcGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCt < 2:1164268/144‑1 (MQ=255) gcgACTACCGCACCGTGGCTTGGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGc < 2:974654/187‑1 (MQ=255) aCTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTa < 2:1081524/164‑1 (MQ=255) tACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGACCAAAAGCACCTTc < 1:1198133/213‑1 (MQ=255) aCCGCACCCTGGCTTTGCAGgtgctggtgcgccagcggttgatcaactggtccagttcttcaggtggaatgcttagcagcgccttgtcgagaatggcctgcaattggggctggtcggcggctacggcaaaggcggcaatggccggagcgtcgtcgagcatgttggcgatgcgcaaacggtccttgaacacatggctgatgtaataggcagcattgatatggctgcgc < 2:973331‑M2/227‑208 (MQ=255) aCCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGACCAAAAGCAACTTCCTGGCCACCATGAGCCATGAGATc > 1:1262365/1‑236 (MQ=255) cGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCgg < 2:151069/50‑1 (MQ=255) cGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGACCaa < 2:284971/200‑1 (MQ=255) aCCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGCGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCACGCTGATCAACCAgcgcc > 2:161408/1‑93 (MQ=255) ggCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGACCAAAAGCACCTTCCTGGCCACCATGAGCCATGAGATCCGc > 1:821047/1‑229 (MQ=255) ggCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGACCAAAAGCACCTTCCTGGCCACCATGAGCCATGAGATCCGc < 2:821044/229‑1 (MQ=255) ttGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTCCCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGACCAAAAGCACCTTCCTGGCCACCATGAGCCATgaga < 1:302590/220‑1 (MQ=255) ttGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCa > 2:24578/1‑98 (MQ=255) | TACATCAGCCATGTGTTCAAGGACCGTTTGCGCATCGCCAACATGCTCGACGACGCTCCGGCCATTGCCGCCTTTGCCGTAGCCGCCGACCAGCCCCAATTGCAGGCCATTCTCGACAAGGCGCTGCTAAGCATTCCACCTGAAGAACTGGACCAGTTGATCAACCGCTGGCGCACCAGCACACTGGTGAGCGACAGCCCCTGGCGCGACTACCGCACCCTGGCTTTGCAGGTGCTGGTGCTGTCGGCCCTGCTGCTGGCCGGGGTGGTGTTCTGGAACAGTTACCTGCGCAAGCTGATCAACCAGCGCACCGAGGCACAGCACGCGCTTCAGGCACAGCTCGCGCTGAGCCGCGGGCTGCTGGAACAGTTACGCCAGGCCAAGGACGATGCCGAACAGGCCAGCCAGACCAAAAGCACCTTCCTGGCCACCATGAGCCATGAGATCCGC > AE015451/3862461‑3862910 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |