| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 3914323 | 71 (1.030) | 5 (0.080) | 3/324 | NT | 7.2% | coding (464/702 nt) | PP_3454 | putative transcriptional regulatory protein |
| ? | AE015451 | = 3914401 | 61 (0.930) | coding (386/702 nt) | PP_3454 | putative transcriptional regulatory protein | |||||
GCCCTTGCCCCACACGGTCTTGATCTTGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCCAGCAGCACGCGTGGCTCACAGGGTTTGGTCACGTAGTCGTCGGCCCCCATTTCCAGGCCTAGCACCTGGTCATGGCTATCGTCGCGGGCCGTCAG > AE015451/3914118‑3914552 | gCCCTTGCCCCACACGGTCTTGATCTTGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTcct > 1:563926/1‑232 (MQ=255)gCCCTTGCCCCACACGGTCTTGATCTTGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCAcc > 1:782072/1‑235 (MQ=255)gCCCTTGCCCCACACGGTCTTGATCTTGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCAc > 2:622262/1‑234 (MQ=255) ccTTGCCCCACACGGTCTTGATCTTGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTg > 1:897762/1‑236 (MQ=255) ccccACACGGTCTTGATCTTGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTc > 1:814995/1‑236 (MQ=255) cccACACGGTCTTGATCTTGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCg > 1:727257/1‑236 (MQ=255) ggTCTTGATCTTGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCCCCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGt > 1:90727/1‑236 (MQ=255) cgcTTGATCTTGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCAcctcct < 2:563923/200‑1 (MQ=255) ttGATCTTGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTc > 2:1191073/1‑233 (MQ=255) tGATCTTGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGt > 1:972507/1‑217 (MQ=255) ttGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCAcc > 2:429904/1‑210 (MQ=255) tGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAgg < 1:622265/236‑1 (MQ=255) tGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAg < 1:795780/235‑1 (MQ=255) cgcgcTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTgcg > 1:962397/1‑212 (MQ=255) gcgcTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTcgccgc < 2:972504/195‑1 (MQ=255) cgcTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGccac > 1:615263/1‑236 (MQ=255) cgcTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGccac > 1:1281369/1‑236 (MQ=255) cgcTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGccac > 1:1124124/1‑236 (MQ=255) cgcTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGccac > 1:579649/1‑236 (MQ=255) cgcTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGc > 2:1203053/1‑233 (MQ=255) tCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAacgacctgatcctgattggtggcctgcgtatcgacctggccgagcgcacggtgagttggcgcgg < 1:396962‑M1/236‑65 (MQ=255) ttGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGCTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCgg < 2:405101/202‑1 (MQ=255) ttGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGt < 2:109501/182‑1 (MQ=255) gcAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGgcg < 1:1016255/232‑1 (MQ=255) tGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTg < 1:59654/236‑1 (MQ=255) tGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGCGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCGCCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCgcgc < 2:244245/158‑1 (MQ=255) ggAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGt < 1:858789/233‑1 (MQ=255) 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aCGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGa > 1:358647/1‑175 (MQ=255) aCGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGccacc < 2:838647/188‑1 (MQ=255) aCGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGccacc > 1:838650/1‑188 (MQ=255) aCGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGACCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGt > 2:59654/1‑223 (MQ=255) 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tGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCcagcag < 1:472616/181‑1 (MQ=255) tGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCcagcag > 2:472613/1‑181 (MQ=255) cgcgcCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCCAGCAGCACGCGTGGCTCACAGGGTTTGGTCACGTAGTCGTCGGCCCCCATTTCCa > 1:563286/1‑229 (MQ=255) cgcgcCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCCAGCAGCACGCGTGGCTCACAGGGTTTGGTCACGTAGTCGTCGGCCCCCATTTCCAGGCCTAg > 1:52782/1‑236 (MQ=255) gcCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCCCTGGACAGCTCCACCTCCTcg > 2:758480/1‑51 (MQ=255) caccacCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGCTCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCTCACCCGGGCcagca > 2:520461/1‑170 (MQ=255) caccacCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCCAGCAGCACGCGTGGCTCACAGGGTTTGGTCACGTAGTCGTCGGCCCCCATTTCCAGGCCTAg < 2:727254/228‑1 (MQ=255) accaccAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGc > 2:997796/1‑164 (MQ=255) gcagGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCCAGCAGCACGCGTGGCTcacc > 1:167051/1‑177 (MQ=255) gcagGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCCAGCAGCACGCGTGGCTCACAGGGTTTGGTCAc > 1:167050/1‑190 (MQ=255) agGTTGTACTCACCGCCGGACAacgccctgatcctgattggtggcctgcgtatcgacctggccgagcgcacggtgagttggcgcgg < 2:1219850‑M1/86‑65 (MQ=255) tGTACTCTCCGCTGGACAGCTCCACCCCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTtgtcc > 1:378914‑M2/1‑96 (MQ=255) tACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCCAGCAGCACGCGTGGCTCACAGGGTTTGGTCACGTAGTCGTCGGCCCCCATTTCCAGGCCTAGCACCTGGTCATGGCTATCGTcgcg > 1:408324/1‑236 (MQ=255) tCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCCAGCAGCACGCGTGGCTCACAGGGTTTGGTCACGTAGTCGTCGGCCCCCATTTCCAGGCCt > 2:790278/1‑207 (MQ=255) aCCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCCAGCAGCACGCGTGGCTCACAGGGTTTGGTCACGTAGTCGTCGGCCCCCATTTCCAGGCCTAGCACCTGGTCATGGCTATCGTCGCGGGc < 2:897759/234‑1 (MQ=255) cGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCAACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCCAGCAGCACGCGTGGCTCACAGGGTTTGGTCACGTAGTCGTCGGCCCCCAt < 2:693763/193‑1 (MQ=255) cTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCCAGCAGCACGCGTGGCTCACAGGGTTTGGTCACGTAGTCGTCGGCCCCCATTTCCAGGCCTAGCACCTGGTCATGGCTATCGTcgc > 1:835053/1‑226 (MQ=255) tGGACAacgacctgatcctgattggtggcctgcgtatcgacctggccgagcgcacggtgagttggcgcggcgaggaggtggagctgtccagcggtgagtacaacctgctggtggtgctggcgcgcaatgctggtgaggtgatgaaccgcgaccgtatcctgcaacagctgcgtg < 2:1151875‑M1/174‑169 (MQ=255) tGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCCAGCAGCACGCGTGGCTCACAGGGTTTGGTCACGTAGTCGTCGGCCCCCATTTCCAGGCCTAGCACCTGGTCATGGCTATCGTCGCGGGCCGTCAg > 1:921128/1‑235 (MQ=255) ggACAacgacctgatcctgattggtggcctgcgtatcgacctggccgagcgcacggtgagttggcgcggcgagggggtggagctgtccagcggagagtaca > 1:378914‑M1/1‑5 (MQ=255) aacgacctgaagctgataggtggcctgcgtatcgacctggccgagcgcacggtgagttggcgcggcgaggaggtggagctgtccagcggtgagtacatcctgctggtggtgctggcgcgcaatgctggtgaggtgatgaaccgcgaccgtatcctgcaacagctgcgtggc < 1:273501‑M1/171‑171 (MQ=255) | GCCCTTGCCCCACACGGTCTTGATCTTGCGCGCTTCGCCGGCGTTGTCGTCGAACTTGCGCCGCAGTTTGGAAATGGCCACGTCAACGGAGCGATCGGTGCCATTGAACTCGATGCCACGCAGCTGTTGCAGGATACGGTCGCGGTTCATCACCTCACCAGCATTGCGCGCCAGCACCACCAGCAGGTTGTACTCACCGCTGGACAGCTCCACCTCCTCGCCGCGCCAACTCACCGTGCGCTCGGCCAGGTCGATACGCAGGCCACCAATCAGGATCAGGTCGTTGTCCAGGCGCGGTTCGTTGACACTGCTGCGGCGCAGCAGCGTGCGCACCCGGGCCAGCAGCACGCGTGGCTCACAGGGTTTGGTCACGTAGTCGTCGGCCCCCATTTCCAGGCCTAGCACCTGGTCATGGCTATCGTCGCGGGCCGTCAG > AE015451/3914118‑3914552 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |