New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | 4383136 = | 108 (1.570) | 5 (0.080) | 5/322 | NT | 5.0% | coding (719/804 nt) | PP_3858 | putative Tail fiber protein |
? | AE015451 | 4383173 = | 88 (1.350) | coding (682/804 nt) | PP_3858 | putative Tail fiber protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GGCGAGCTGTTTACCATTACGCAAAACGTCATCCATCAATGCTTCATGACGCTCATTCGTGAGCGGCCGAAGATCATCAGGTGCGTCATCGCACGGAACATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAG > AE015451/4382902‑4383370 | cgtacagtcgagcagagacctataccaaggtcgagactgaaagtcgcctgagcaccaagcaagatctcaatacggcggggttcggcagctcggcgtcgtgggagcgcgatggctcaaccggcgcagtccaacagtacggtgtgttcaacatggcggcaggccccaatgagcagactatccccttcccggtgagctttcctaccgcatgcaggtatgtggggctgaccaacctggag < 1:673143‑M1/2‑1 (MQ=255) gAGCTGTTTACCATTACGCAAAACGTCATCCATCAATGCTTCATGACGCTCATTCGTGAGCGGCCGAAGATCATCAGGTGCGTCATCGCACGGAACATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAg < 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tACGCAAAACGTCATCCATCAATGCTTCATGACGCTCATTCGTGAGCGGCCGAAGATCATCAGGTGCGTCATCGCACGGAACATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGc < 1:617864/236‑1 (MQ=255) gCAAAACGTCATCCATCAATGCTTCATGACGCTCATTCGTGAGCGGCCGAAGATCATCAGGTGCGTGATCGCACGGAACATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTAt > 2:673140/1‑230 (MQ=255) caaggtcgagactgaaagtcgcctgagcaccaagcaagatctcaatacggcggggttcggcagctcggcgtcgtgggagcgcgatggctcaaccggcgcagtccaacagtacggtgtgttcaacatggcggcaggccccaatgagcagactatccccttcccggtgagctttcctaccgcatgcaggtatgtggggctgaccaacctggag < 1:792172‑M1/2‑1 (MQ=255) ggcagccagcAATGCTTCATGACGCGCATGCGTGAGCGGCCGAAGATCATCAGGTGCGTCATCGCACGGAACACCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATg < 2:309797/208‑1 (MQ=255) 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ggTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGt > 1:1048664/1‑191 (MQ=255) aGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCt > 1:559514/1‑112 (MQ=255) aGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCt < 2:559511/112‑1 (MQ=255) aGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCggg > 2:712558/1‑137 (MQ=255) aGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGa > 1:990745/1‑232 (MQ=255) ggTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCCTCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACCTACCTCCCTGCGGt > 2:48372/1‑120 (MQ=255) ggTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCgg > 2:1280386/1‑203 (MQ=255) ggTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTAGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAg > 2:1098536/1‑232 (MQ=255) gtgtTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGa < 1:1169769/175‑1 (MQ=255) 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1:331816/1‑180 (MQ=255) cACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATcg < 1:1232348/171‑1 (MQ=255) gccGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAg < 2:160595/77‑1 (MQ=255) aCCGCAGGATGAGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCGCACCGGGAAg < 2:100745/95‑1 (MQ=255) cAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAg > 1:624712/1‑236 (MQ=255) AGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGa < 2:465579‑M1/228‑1 (MQ=255) | GGCGAGCTGTTTACCATTACGCAAAACGTCATCCATCAATGCTTCATGACGCTCATTCGTGAGCGGCCGAAGATCATCAGGTGCGTCATCGCACGGAACATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAG > AE015451/4382902‑4383370 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |