| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | AE015451 | 4383136 = | 108 (1.570) | 5 (0.080) | 5/322 | NT | 5.0% | coding (719/804 nt) | PP_3858 | putative Tail fiber protein |
| ? | AE015451 | 4383173 = | 88 (1.350) | coding (682/804 nt) | PP_3858 | putative Tail fiber protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TTCATGACGCTCATTCGTGAGCGGCCGAAGATCATCAGGTGCGTCATCGCACGGAACATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAGTCTCGACCTTGGTATAGGTCTCTGCTCGACTGTACG > AE015451/4382944‑4383406 | ttCATGACGCTCATTCGTGAGCGGCCGAAGATCATCAGGTGCGTCATCGCACGGAACATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGtt < 1:527102/236‑1 (MQ=255) cATGACGCTCATTCGTGAGCGGCCGAAGATCATCAGGTGCGTCATCGCACGGAACATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTg > 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tCATTCGTGAGCGGCCGAAGATCATCAGGTGCGTCATCGCACGGAACATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGcccc < 1:1171912/236‑1 (MQ=255) aTTCGTGAGCGGCCGAAGATCATCAGGTGCGTCATCGCACGGAACATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGcccc < 1:99815/234‑1 (MQ=255) gAGCGGCCGAAGATCATCAGGTGCGTCATCGCACGGACCATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTCCCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCt < 1:228312/236‑1 (MQ=255) 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1:756622/235‑1 (MQ=255) agttcctaccgcatgcaggtatgtggggctgaccaacctggAGGATGCGCACAGTATGGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAAcccc > 1:1153284‑M1/42‑236 (MQ=255) accCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAAcc > 2:534492/1‑233 (MQ=255) tGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGTACGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCTTCCTCCAg > 2:222651/1‑73 (MQ=255) tGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCCGCCCCACATa > 2:33063/1‑91 (MQ=255) gATGGTCGCCGAAGAGTCCGTCCCCCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTg < 2:215722/143‑1 (MQ=255) aggtatgtggggctgaccaacctggAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGaaccgc < 2:1153281‑M1/195‑3 (MQ=255) aCCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTCGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGa > 1:143152/1‑203 (MQ=255) cGAAGCGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGGATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCa < 2:107727/68‑1 (MQ=255) ttCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCacgacg < 2:820703/190‑1 (MQ=255) cGTCCCCCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCg < 2:177468/95‑1 (MQ=255) tCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAacaca > 2:17912/1‑140 (MQ=255) tCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAacaca < 1:17912/140‑1 (MQ=255) ccACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTCCGCCATCGCGCTCCCa > 1:331816/1‑180 (MQ=255) cACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATcg < 1:1232348/171‑1 (MQ=255) gccGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAg < 2:160595/77‑1 (MQ=255) aCCGCAGGATGAGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCGCACCGGGAAg < 2:100745/95‑1 (MQ=255) cAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAg > 1:624712/1‑236 (MQ=255) AGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGa < 2:465579‑M1/228‑1 (MQ=255) GATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCa > 1:58983‑M1/1‑221 (MQ=255) GCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGA‑AGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAGTCTCGa > 1:692714‑M1/1‑235 (MQ=255) CGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAacaca > 2:161386‑M1/1‑126 (MQ=255) acaGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCTCTCCCACGCCGCCGCGCTGCCGAACCccgccg > 2:284653/1‑190 (MQ=255) aTTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAGt < 1:807989/222‑1 (MQ=255) cccTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAGTCTCGACCTTGGtata < 2:780355/233‑1 (MQ=255) gccgccGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATCCCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCCCCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACCCCCCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAAcccc < 1:283613/171‑1 (MQ=255) ccgccgCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAacaca < 1:411191/107‑1 (MQ=255) ccgccgCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAacaca > 2:411188/1‑107 (MQ=255) cgccgcATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTc > 1:313349/1‑55 (MQ=255) cgccgcATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTc < 2:313348/55‑1 (MQ=255) cgccgcATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAgg > 1:1274683/1‑65 (MQ=255) cgccgcATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGc > 2:488620/1‑153 (MQ=255) cgccgcATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGcc > 2:1216149/1‑162 (MQ=255) cgccgcATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCccgcc > 2:223081/1‑172 (MQ=255) cgccgcATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGCCTTTCAGTCTCGACCTTGGTATAGGTCTCTGCTc > 1:190709/1‑236 (MQ=255) cgccgcATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAGtctc > 1:946522/1‑213 (MQ=255) cgccgcATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAGTCTCGACCTTGGtata > 2:892334/1‑225 (MQ=255) cgccgcATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAGTCTCGACCTTGGTATAGGTctctt > 1:804132/1‑232 (MQ=255) cgccgcATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAGTCTCGACCTTGGTATAGGTCTCTGCt > 1:851882/1‑235 (MQ=255) cgccgcATCCTCCAGGTTGGACAGCCCCACATACCTGCCTGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACAcc > 2:320108/1‑108 (MQ=255) gcgtcctCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAGtctc < 1:1212440‑M2/202‑1 (MQ=255) ctCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAGTCTCGACCTTg < 1:792172‑M2/209‑1 (MQ=255) | TTCATGACGCTCATTCGTGAGCGGCCGAAGATCATCAGGTGCGTCATCGCACGGAACATCGGAATGGAAGAACGCCAGTCGCGACGGGCTGAAGGAGTACCCCATGATCAGTTCCCTTTGGCATGCCAGGTGTAGGCGGTTGAGGTGTTACCACCCGAGTTGAGGATGGTCACCGAAGAGTTCGTCCACCGCAGGATGCGCACAGTATTGCCCTCGGCCGCCGCATCCTCCAGGTTGGTCAGCCCCACATACCTGCATGCGGTAGGAAAGCTCACCGGGAAGGGGATAGTCTGCTCATTGGGGCCTGCCGCCATGTTGAACACACCGTACTGTTGGACTGCGCCGGTTGAGCCATCGCGCTCCCACGACGCCGAGCTGCCGAACCCCGCCGTATTGAGATCTTGCTTGGTGCTCAGGCGACTTTCAGTCTCGACCTTGGTATAGGTCTCTGCTCGACTGTACG > AE015451/4382944‑4383406 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |