New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | 5910238 = | 77 (1.120) | 5 (0.080) | 4/320 | NT | 6.5% | coding (513/1362 nt) | spuC‑II | polyamine:pyruvate transaminase |
? | AE015451 | 5910270 = | 72 (1.110) | coding (481/1362 nt) | spuC‑II | polyamine:pyruvate transaminase |
CTCCTTCACCTTCGGCCAGTAGGTTTCCGGCGGGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGTGAG > AE015451/5910007‑5910473 | ctcCTTCACCTTCGGCCAGTAGGTTTCCGGCGGGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGc < 1:715151/235‑1 (MQ=255) cgtactacaacctgttcttccagaccgctcacccgcctgcgctcgagctggccaaggcgatcaccgacgtggcgccgaaaggtatgacccatgtgttcttcaccggctccggctccgaaggcaacgacactgtgctgcgcatggtgcgtcactactgggcgctgaagggcaaaccgcacaagcagaccatcatcggccgcatcaacggttaccacggctccaccttcgccgGTGc < 1:817930‑M1/4‑1 (MQ=255) tcCTTCACCTTCGGCCAGTAGGTTTCCGGCGGGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCAt > 1:1042720/1‑236 (MQ=255) cTTCACCTTCGGCCAGTAGGTGTCCGGCGGGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATg < 1:109456/235‑1 (MQ=255) aCCTTCGGCCAGTAGGTTTCCGGCGGGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTg < 1:715455/227‑1 (MQ=255) 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ggATGTTCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAac < 1:8343/209‑1 (MQ=255) ggATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATAcc < 1:546050/58‑1 (MQ=255) ggATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATAcc > 2:546047/1‑58 (MQ=255) tgtgCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGGGCCGGGGt > 2:323728/1‑90 (MQ=255) gCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGcac > 2:472107/1‑166 (MQ=255) gCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGCGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGgcgc > 1:852135/1‑226 (MQ=255) gCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCg > 2:1202573/1‑233 (MQ=255) gCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTg > 1:1195404/1‑236 (MQ=255) cACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTga < 1:241043/197‑1 (MQ=255) aCGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGGGCCGGTGAAGAACACATGGGTc > 2:30751/1‑210 (MQ=255) 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aTCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTg < 2:1230867/183‑1 (MQ=255) cAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTCGTGACGCACCATGCGCAGcaca > 2:967546/1‑148 (MQ=255) cAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATgcgc > 2:911718/1‑142 (MQ=255) cAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGGGAAGAac > 1:166669/1‑184 (MQ=255) ccACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAg < 2:1152683/233‑1 (MQ=255) cTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCa < 1:240522/104‑1 (MQ=255) cTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGt < 1:266944/236‑1 (MQ=255) GTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGTGAg > 1:410070‑M1/1‑236 (MQ=255) | CTCCTTCACCTTCGGCCAGTAGGTTTCCGGCGGGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGTGAG > AE015451/5910007‑5910473 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |