| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | AE015451 | 5910238 = | 77 (1.120) | 5 (0.080) | 4/320 | NT | 6.5% | coding (513/1362 nt) | spuC‑II | polyamine:pyruvate transaminase |
| ? | AE015451 | 5910270 = | 72 (1.110) | coding (481/1362 nt) | spuC‑II | polyamine:pyruvate transaminase | |||||
CACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGTGAGCGGTCTGGAAGAACAGGTTGTAGTACGGCAG > AE015451/5910051‑5910504 | caccaGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTg < 1:417913/230‑1 (MQ=255) atcctcgaagtcggcGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAAcc > 1:540031/11‑234 (MQ=255) ggctcggcGATGCAGGCCGCGCCGTTGTCTGCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCgg < 1:230695/205‑1 (MQ=255) ggctcggcGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGc < 1:816851/235‑1 (MQ=255) ggctcggcGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTGCTGCTCCAACTGCGCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGc < 1:390342/235‑1 (MQ=255) cggcGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGa > 2:898599/1‑204 (MQ=255) ggcGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCgg > 2:816848/1‑200 (MQ=255) ggcGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGcc > 2:410067/1‑234 (MQ=255) ggCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCt > 1:987672/1‑236 (MQ=255) ggtatgacccatgtgttcttcaccggctccggctccgaaggcaacgacactgtgctgcgcatggtgcgtcactactgggcgctgaagggcaaaccgcacaagcagaccatcatcggccgcatcaacggttaccacggctccaccttcgccggtgcatgcctgggcggtatgagcggcatgcacCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCtt > 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cGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGACGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGa > 1:1233392/1‑168 (MQ=255) gAGGATCTTCTTCTCGAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACGGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGcc < 1:1207897/235‑1 (MQ=255) gATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAgg < 2:164721/167‑1 (MQ=255) tcttctCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGc > 1:161998/1‑189 (MQ=255) 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caacggttaccacggctccaccttcgccgGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCagtagt < 1:17489‑M1/113‑1 (MQ=255) caacggttaccacggctccaccttcgccgGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCAc < 2:859209‑M1/120‑1 (MQ=255) aTCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTg < 2:1230867/183‑1 (MQ=255) cAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTCGTGACGCACCATGCGCAGcaca > 2:967546/1‑148 (MQ=255) cAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATgcgc > 2:911718/1‑142 (MQ=255) cAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGGGAAGAac > 1:166669/1‑184 (MQ=255) ccACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAg < 2:1152683/233‑1 (MQ=255) cTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCa < 1:240522/104‑1 (MQ=255) cTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGt < 1:266944/236‑1 (MQ=255) GTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGTGAg > 1:410070‑M1/1‑236 (MQ=255) TGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGt > 1:1068222‑M1/1‑232 (MQ=255) TGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGCTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTGTCGGCGCCACGTCGGTGATCGc < 2:279131‑M1/206‑1 (MQ=255) gCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGTGAGCGGTCTgg > 2:1201975/1‑235 (MQ=255) cTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAgcg > 2:817927/1‑214 (MQ=255) cTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGGAACCGTTGAt > 2:240522/1‑53 (MQ=255) cATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTcggagccgg < 2:788704/143‑1 (MQ=255) aTACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGcc > 1:1157302/1‑56 (MQ=255) aTACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGcc < 2:1157299/56‑1 (MQ=255) aTACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGCGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGCTGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCg > 2:139279/1‑126 (MQ=255) tACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGCGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCAc > 2:274148/1‑181 (MQ=255) cAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGc > 2:482000/1‑97 (MQ=255) cAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGc < 1:482003/97‑1 (MQ=255) aGGCATGCACCGGCGAAGTTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGCCGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCtt > 1:45498/1‑77 (MQ=255) gcacCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGTGAGCGGTCTGGAAGAACAGGTTGTAGTACg < 1:817930‑M2/231‑1 (MQ=255) 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CACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCC‑GCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGTGAGCGGTCTGGAAGAACAGGTTGTAGTACGGCAG > AE015451/5910051‑5910504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |