New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 1424647 = | 63 (0.920) | 5 (0.080) | 5/322 | NT | 8.3% | coding (720/768 nt) | PP_1248 | Transporter, LysE family |
? | AE015451 | 1424687 = | 51 (0.780) | coding (680/768 nt) | PP_1248 | Transporter, LysE family |
TGCGGCGTTGTTCGTGAGCAAGGCCTATCAGCTGGAAACCAATTGACTGGGTAATGGCTGAGTGAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGAAAAACGCCATGTAGAACATGATCGCCTTGGGGTTGAGCAGGGTGATCATCATGGTCTGGCGCAGGTACTGGCCGTTGTCCATGCGG > AE015451/1424453‑1424908 | tGCGGCGTTGTTCGTGAGCAAGGCCTATCAGCTGGAAACCAATTGACTGGGTAATGGCTGAGTGAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGgcgcg > 1:630258/1‑236 (MQ=255) ggCCTATCAGCTGGAAACCAATTGACTGGGTAATGGCTGAGTGAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGt < 2:839853/231‑1 (MQ=255) ccTATCAGCTGGAAACCAATTGACTGGGTAATGGCTGAGTGAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGgcgcg > 1:79612/1‑213 (MQ=255) ccTATCAGCTGGAAACCAATTGACTGGGTAATGGCTGAGTGAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATgg > 1:1199129/1‑235 (MQ=255) aaCCAATTGACTGGGTAATGGCTGAGTGAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACg > 2:407250/1‑234 (MQ=255) aCCAATTGACTGGGTAATGGCTGAGTGAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCa < 1:400772/236‑1 (MQ=255) aCCAATTGACTGGGTAATGGCTGAGTGAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCa < 1:1044876/236‑1 (MQ=255) aCCAATTGACTGGGTAATGGCTGAGTGAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTCGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACgg < 1:686863/234‑1 (MQ=255) aaTGGCTGAGTGAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGcaccac > 1:731/1‑217 (MQ=255) aaTGGCTGAGTGAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAg > 1:1174595/1‑235 (MQ=255) tGAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGt < 2:942315/190‑1 (MQ=255) gAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCGCCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCa > 1:1246959/1‑199 (MQ=255) gAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCa > 2:577711/1‑214 (MQ=255) gAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGcc > 2:555431/1‑217 (MQ=255) cgtcgacccggtgaagcaccaagggctggtgacgttcggtttcatggcggcgacagtggcggtggtgaccttcctgtatgggctgattgccgtggtgctgacccatcaactggccgagcgcatgcgcgccagcccgcgaattgccaatatgttcgagcggctggcgc < 2:1222133‑M2/1‑1 (MQ=255) tCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCAc < 1:879884/235‑1 (MQ=255) cgacccggtgaagcaccaagggctggtgacgttcggtttcatggcggcgacagtggcggtggtgaccttcctgtatgggctgattgccgtggtgctgacccatcaactggccgagcgcatgcgcgccagcccgcgaattgccaatatgttcgagcggctggcgCGCATGCGCTCgg < 2:800096‑M2/13‑1 (MQ=255) ccccGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCg > 1:924788/1‑175 (MQ=255) cccGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCCCCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGc < 1:287842/200‑1 (MQ=255) gggAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTAGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCg > 1:196017/1‑171 (MQ=255) ggAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCACATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTcg < 2:560286/234‑1 (MQ=255) aTGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAg < 1:1131064/196‑1 (MQ=255) gctggtgacgttcggtttcatggcggcgacagtggcggtggtgaccttcctgtatgggctgattgccgtggtgctgacccatcaactggccgagcgcatgcgcgccagcccgcgaattgccaatatgttcgagcggctggcgCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGc > 1:587223‑M2/143‑180 (MQ=255) tAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAg > 1:182461/1‑184 (MQ=255) tGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATAc > 1:678798/1‑176 (MQ=255) tGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATAc < 2:678795/176‑1 (MQ=255) gTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGAt > 2:1026209/1‑143 (MQ=255) gTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATa > 1:1196917/1‑171 (MQ=255) gTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGt < 1:74809/195‑1 (MQ=255) gTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCa > 1:892775/1‑236 (MQ=255) gTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCa > 1:153300/1‑236 (MQ=255) tCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACg < 2:1199126/214‑1 (MQ=255) gcgcCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGAAAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGt > 2:631923/1‑235 (MQ=255) agtggcggtggtgaccttcctgtatgggctgattgccgtggtgctgacccatcaactggccgagcgcatgcgcgccagcccgcgaattgccaatatgttcgagcggctggcgCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGt < 2:587220‑M2/26‑1 (MQ=255) ccGGACCCTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGc < 1:347202/148‑1 (MQ=255) acTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGt < 1:368932/122‑1 (MQ=255) ggCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGaaaa > 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gcATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGCCCa > 2:188180/1‑99 (MQ=255) gattgccgtggtgctgacccatcaactggccgagcgcatgcgCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGcaccac < 1:1204204‑M1/75‑1 (MQ=255) ctCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGAAAAACGCCATGTAGAACa < 2:892772/234‑1 (MQ=255) aTCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCgg < 2:123169/94‑1 (MQ=255) aTCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCCCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCCCGGCACTCAGCCCATa > 2:43701/1‑131 (MQ=255) gccgtggtgctgacccatcaactggccgagcgcatgcgCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGc > 1:587223‑M1/39‑180 (MQ=255) gtggtgctgacccatcaactggccgagcgcatgcgcgccagcccgcgaattgccaatatgttcgagcggctggcgCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATc < 1:1204204‑M2/42‑1 (MQ=255) acccatcaactggccgagcgcatgcgCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACt < 2:587220‑M1/112‑1 (MQ=255) ccaccgGGCACGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGc < 2:159062/94‑1 (MQ=255) caccaGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGAAAAACGCCATGTAGAACATGATCGCCTTGGGGTTGa < 1:577714/227‑1 (MQ=255) ccgagcgcatgcgCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTcg < 2:800096‑M1/163‑1 (MQ=255) aGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGAAAAACGCCATGTAGAACATGATCGCCTTGGGGTTGAGCAGGGTGATCATCATg < 1:897245/235‑1 (MQ=255) cccGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTg < 2:885959/149‑1 (MQ=255) gCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTcgacg < 2:1222133‑M1/166‑1 (MQ=255) GCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGAAAAACGCCATGTAGAACATGATCGCCTTGGGGTTGAGCAGGGTGATCATCATGGTCTGGCGCa < 1:395479‑M1/234‑1 (MQ=255) CGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGAAAAACGCCATGTAGAACATGATCGCCTTg > 2:1058539‑M1/1‑198 (MQ=255) gAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCGCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGAAAAACGCCATGTAGAACATGATCGCCTTGGGGTTGAGCAGGGTGATCATCATGGTCTGGCGCAGGTACTGGc > 1:1184054/1‑236 (MQ=255) aattgccaatatgttcgagcggctggcgCGCATGCGCTCGGCCAGt < 1:237480‑M2/18‑1 (MQ=255) aCATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCgg < 1:849592/160‑1 (MQ=255) ttGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGAAAAACGCCATGTAGAACATGATCGCCTTGGGGTTGAGCAGGGTGATCATCATgg < 2:1026439/211‑1 (MQ=255) tGGCAATTCGCGGGCTGGGGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAAc < 2:719854/108‑1 (MQ=255) cAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGAAAAACGCCATGTAGAACATGATCGCCTTGGGGTTGAGCAGGGTGATCATCATGGTCTGGCGCAGGTACTGGCCGTTGTCCATg < 1:549534/236‑1 (MQ=255) aaTTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGAAAAACGCCATGTAGAACATGATCGCCTTGGGGTTGAGCAGGGTGATCATCATGGTCTGGCGCAGGTACTGGCCGTTGTCCATg < 1:1241280/235‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGAAAAACGCCATGTAGAACATGATCGCCTTGGGGTTGAGCAGGGTGATCATCATGGTCTGGCGCAGGTACTGGCCGTTGTCCATGCgg < 1:854101/236‑1 (MQ=255) gggcgggcGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGAAAAACGCCATGTAGAACATGATCGCCTTg < 2:977723/174‑1 (MQ=255) gggCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGAAAAACGCCATGTAGAACATGATCGcc > 1:1249050/1‑171 (MQ=255) cgCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGcac < 2:1077843‑M2/32‑1 (MQ=255) | TGCGGCGTTGTTCGTGAGCAAGGCCTATCAGCTGGAAACCAATTGACTGGGTAATGGCTGAGTGAACAAGTCCCCGGGAACCATGAGTTGCCGGGGGCTTTTTTAGGGTTGCTGTCAGGCGCGCCCGGACACTGTCGGGCTTGGGATCAGCGCATCGCCGCCAGTTTGATGCCGAATCCCACCAGGCAAGCCCCCGCCAGCCGCTCGAACATATTGGCAATTCGCGGGCTGGCGCGCATGCGCTCGGCCAGTTGATGGGTCAGCACCACGGCAATCAGCCCATACAGGAAGGTCACCACCGCCACTGTCGCCGCCATGAAACCGAACGTCACCAGCCCTTGGTGCTTCACCGGGTCGACGAACAGCGGGAAAAACGCCATGTAGAACATGATCGCCTTGGGGTTGAGCAGGGTGATCATCATGGTCTGGCGCAGGTACTGGCCGTTGTCCATGCGG > AE015451/1424453‑1424908 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |