New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3662642 = | 66 (0.960) | 4 (0.060) | 4/328 | NT | 6.1% | coding (192/1143 nt) | PP_3226 | Acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein |
? | AE015451 | 3662663 = | 59 (0.890) | coding (171/1143 nt) | PP_3226 | Acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein |
AGGCCACCACGGGCCGGAGTACCCAGTTCAGGTTCGACGCGCAGTGCGTTGATCAGCGCGCCGTGCCGCACGGCATCGTAAGCCACGCGCTGGCGCAGGGGCTCGGGCCAGCGCGCTTCGTCCTGCAGGCGAAAATGCTGCAGGTATTGCATCACCAGGATCAGCGCGGTGGCCGGGTCACCTTTGCCGACCGCGCCGATCACCCGGCGGG‑CGCTGGCAAGGTCCGCGCCGCCTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGAGCAGCCCGTGGCGGTGCAGCAAGTGGAAGTTGTCCTGGGGGAACTGGGCGCTGCGGTCGTAGCGCTCGGCGTTTGCCGCGAGGGCCAGCGTCAGCTCGGCGAGAGCGCTGTCGGACGGTTGACTCATGAGGCTCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTT > AE015451/3662433‑3662896 | aGGCCACCACGGGCCGGAGTACCCAGTTCAGGTTCGACGCGCAGTGCGTTGATCAGCGCGCCGTGCCGCACGGCATCGTAAGCCACGCGCTGGCGCAGGGGCTCGGGCCAGCGCGCTTCGTCCTGCAGGCGAAAATGCTGCAGGTATTGCATCACCAGGATCAGCGCGGTGGCCGGGTCACCTTTGCCGACCGCGCCGATCACCCGGCGGG‑CGCTGGCCAGGTCCGCGCCGCCTc > 2:563543/1‑235 (MQ=255) cacGGGCCGGAGTACCCAGTTCAGGTTCGACGCGCAGTGCGTTGATCAGCGCGCCGTGCCGCACGGCATCGTAAGCCACGCGCTGGCGCAGGGGCTCGGGCCAGCGCGCTTCGTCCTGCAGGCGAAAATGCTGCAGGTATTGCATCACCAGGATCAGCGCGGTGGCCGGGTCACCTTTGCCGACCGCGCCGATCACCCGGCGGG‑CGCTGGCAAGGTCCGCGCCGCCTCCGCCGaa < 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ggAGTACCCAGTTCAGGTTCGACGCGCAGTGCGTTGATCAGCGCGCCGTGCCGCACGGCATCGTAAGCCACGCGCTGGCGCAGGGGCTCGGGCCAGCGCGCTTCGTCCTGCAGGCGAAAATGCTGCAGGTATTGCATCACCAGGATCAGCGCGGTGGCCGGGTCACCTTTGCCGACCGCGCCGATCACCCGGCGGG‑CGCTGGCAAGGTCCGCGCCGCCTCCGCCGAAGGCACggg > 1:979640/1‑235 (MQ=255) ttCGACGCGCAGTGCGTTGATCAGCGCGCCGTGCCGCACGGCATCGTAAGCCACGCGCTGGCGCAGGGGCTCGGGCCAGCGCGCTTCGTCCTGCAGGCGAAAATGCTGCAGGTATTGCATCACCAGGATCAGCGCGGTGGCCGGGTCACCTTTGCCGACCGCGCCGATCACCCGGCGGG‑CGCTGGCAAGGTCCGCGCCGCCTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGcgca > 1:21863/1‑236 (MQ=255) ttCGACGCGCAGTGCGTTGATCAGCGCGCCGTGCCGCACGGCATCGTAAGCCACGCGCTGGCGCAGGGGCTCGGGCCAGCGCGCTTCGTCCTGCAGGCGAAAATGCTGCAGGTATTGCATCACCAGGATCAGCGCGGTGGCCGGGTCACCTTTGCCGACCGCGCCGATCACCCGGCGGG‑CGCTGGCAAGGTCCGCGCCGCCTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGagca > 1:113796/1‑236 (MQ=255) cGACGCGCAGTGCGTTGATCAGCGCGCCGTGCCGCACGGCATCGTAAGCCACGCGCTGGCCCGAGCCCCTGCGCCAGCGCGCTTCGTCCTGCAGGCGAAAATGCTGCAGGTATTGCATCACCAGGATCAGCGCGGTGGCCGGGTCACCTTTGCCGACCGCGCCGCTCACCCGGCGGG‑CGCTGGCAAGGTCCGcgccg > 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1:1012450/236‑1 (MQ=255) cccgtgccttcggcggaggcGG‑CGCTGGCAAGGTCCGCGCCGCCTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTCAGGGc < 2:741461‑M1/54‑1 (MQ=255) cgtgccttcggcggaggcGGGCGCTGGCAAGGTCCGCGCCGCCTCCGCCGGAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGAGCAGCCCGTGGCGGTGCAGCAAGGGGGAGt < 1:159455‑M1/87‑1 (MQ=255) cgcgCCGATCACCCGGCGGG‑CGCTGGCAAGGTCCGCGCCGCCTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGAGCAGCCCGTGGCGGTGCAGCAAGTGGAAGTTGTCCTGGGGGAACTGGGCGCTGCGGTCGTAGCGCTCGGCGTTTGCCGCGAGGGCCAGCGTCAGCTCGGCGAGAGCGCTGTCGGACGGTTGACTCATGAGGCTCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTaa < 1:680899/235‑1 (MQ=255) cgcCGATCACCCGGCGGG‑CGCTGGCAAGGTCCGCGCCGCCTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGAGCAGCCCGTGGCGGTGCAGCAAGTGGAAGTTGTCCTGGGGGAACTGGGCGCTGCGGTCGTAGCGCTCGGCGTTTGCCGCGAGGGCCAGCGTCAGCTCGGCGAGAGCGCTGTCGGACGGTTGACTCATGAGGCTCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAg > 1:816867/1‑234 (MQ=255) ttcggcggaggcggcgcggaccttgccagcgccGCCTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGc < 1:284016‑M2/33‑1 (MQ=255) cACCCGGCGGG‑CGCTGGCAAGGTCCGCGCCGCCTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGAGCAGCCCGTGGCGGTGCAGCAAGTGGAAGTTGTCCTGGGGGAACTGGGCGCTGCGGTCGTAGCGCTCGGCGTTTGCCGCGAGGGCCAGCGTCAGCTCGGCGAGAGCGCTGTCGGACGGTTGACTCATGAGGCTCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGcc < 1:525018/223‑1 (MQ=255) GG‑CGCTGGCAAGGTCCGCGCCGCCTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGAGCAGCCCGTGGCGGTGCAGCAAGTGGAAGTTGTCCTGGGGGAACTGGGCGCTGCGGTCGTAGCGCTCGGCGTTTGCCGCGAGGGCCAGCGTCAGCTCGGCGAGAGCGCTGTCGGACGGTTGACTCATGAGGCTCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATg > 1:747138‑M1/1‑236 (MQ=255) G‑CGCTGGCAAGGTCCGCGCCGCCTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGAGCAGCCCGTGGCGGTGCAGCAAGTGGAAGTTGTCCTGGGGGAACTGGGCGCTGCGGTCGTAGCGCTCGGCGTTTGCCGCGAGGGCCAGCGTCAGCTCGGCGAGAGCGCTGTCGGACGGTTGACTCATGAGGCTCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGa > 1:904401‑M1/1‑236 (MQ=255) CTGGCAAGGTCCGCGTCGCCTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGAGCAGCCCGTGGCGGTGCAGCAAGTGGAAGTTGTCCTGGGGGAACTGGGCGCTGCGGTCGTAGCGCTCGGCGTTTGCCGCGAGGGCCAGCGTCAGCTCGGCGAGAGCGCTGTCGGACGGTTGACTCATGAg > 2:637824‑M1/1‑182 (MQ=255) tCCGCGCCGCATCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGAGCAGCCCGTGGCGGTGCAGCAAGTGGAAGTTGTCCTGGGGGAACTGGGCGCTGCGGTCGTAGCGCTCGGCGTTTGCCGCGAGGGCCAGCGTCAGCTCGGCGAGAGCGCTGTCGGACGGTTGACTCATGAGGCTCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGAcc < 1:553750/208‑1 (MQ=255) cGCCTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGAGCAGCCCGTGGCGGTGCAGCAAGTGGAAGTTGTCCTGGGGGAACTGGGCGCTGCGGTCGTAGCGCTCGGCGTTTGCcgcg > 1:225866‑M2/2‑116 (MQ=255) cGCCTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGAGCAGCCCGTGGCGGTGCAGCAAGTGGAAGTTGTCCTGGGGGAACTGGGCGCTGCGGTCGTAGCGCTCGGCGTTTGCCGCGAGGGCCAGCGTCAGCTCGGCGAGAGCGCTGTCGGACGGTTGACTCATGAGGCTCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCtttt < 1:1099144‑M2/234‑1 (MQ=255) gccTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGAGCAGCCCGTGGCGGTGCAGCAAGTGGAAGTTGTCCTGGGGGAACTGGGCGCTGCGGTCGTAGCGCACGGCGTTTGCCGCGAGGGCCAGCGTCAGCTCGGCGAGAGCGCTGTCGGACGGTTGACTCATGAGGCTCATCCCTGAATGACGGt < 1:993829/185‑1 (MQ=255) | AGGCCACCACGGGCCGGAGTACCCAGTTCAGGTTCGACGCGCAGTGCGTTGATCAGCGCGCCGTGCCGCACGGCATCGTAAGCCACGCGCTGGCGCAGGGGCTCGGGCCAGCGCGCTTCGTCCTGCAGGCGAAAATGCTGCAGGTATTGCATCACCAGGATCAGCGCGGTGGCCGGGTCACCTTTGCCGACCGCGCCGATCACCCGGCGGG‑CGCTGGCAAGGTCCGCGCCGCCTCCGCCGAAGGCACGGGGTACAGTGAGGGCGAGCAGCCCGTGGCGGTGCAGCAAGTGGAAGTTGTCCTGGGGGAACTGGGCGCTGCGGTCGTAGCGCTCGGCGTTTGCCGCGAGGGCCAGCGTCAGCTCGGCGAGAGCGCTGTCGGACGGTTGACTCATGAGGCTCATCCCTGAATGACGGTGCGTTGCCTAAGACCGTATTCGCATGGATGAAGGCTGTAAAAGGCTTTT > AE015451/3662433‑3662896 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |