| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 3718735 = | 64 (0.930) | 7 (0.110) | 6/320 | NT | 10.8% | coding (666/774 nt) | paaF | enoyl‑CoA hydratase‑isomerase |
| ? | AE015451 | 3718802 = | 55 (0.850) | coding (599/774 nt) | paaF | enoyl‑CoA hydratase‑isomerase | |||||
GTGCTGGAAAGTCATGACAGACTCGCTCCGTCAGTCGAGAGAATGAAGTTCAGCGCCCTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTGGGTGCCGCCAGCACCGGGGATGATGCCAAGGTTGATTTCCGGCTGGCCGAAACGGGCGTCGGT > AE015451/3718578‑3719034 | gtgCTGGAAAGTCATGACAGACTCGCTCCGTCAGTCGAGAGAATGAAGTTCAGCGCCCTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTggcggc > 1:826242/1‑235 (MQ=255) cTGGAAAGTCATGACAGACTCGCTCCGTCAGTCGAGAGAATGAAGTTCAGCGCCCTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGAt > 1:678382/1‑235 (MQ=255) gTCATGACAGACTCGCTCCGTCAGTCGAGAGAATGAAGTTCAGCGCCCTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGgcggcg > 1:609620/1‑226 (MQ=255) aCTCGCTCCGTCAGTCGAGAGAATGAAGTTCAGCGCCCTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCAGCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCAt < 1:1185935/236‑1 (MQ=255) atgcagatggtgctgacgggggaagccatcactgccctccgcgcccagcaggccggcctggtcagcgaaatcacccagcccgaactcaccgtagaacgcgccatgcaggttgcccgcagcatcgccgccaaagcgccgctggctgtgcgcctggccaaggaggcgttactgaaggccggtgataccgacctggccagcggcGCTTTGGCGGCGa > 2:1223319‑M2/202‑214 (MQ=255) gCTCCGTCAGTCGAGAGAATGAAGTTCAGCGCCCTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCAt < 2:979260/232‑1 (MQ=255) gCTCCGTCAGTCGAGAGAATGAAGTTCAGCGCCCTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGgc > 1:518138/1‑235 (MQ=255) tCCGTCAGTCGAGAGAATGAAGTTCAGCGCCCTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGcgcg < 1:1270129/236‑1 (MQ=255) cGTCAGTCGAGAGAATGAAGTTCAGCGCCCTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGt > 1:1070749/1‑235 (MQ=255) tCGAGAGAATGAAGTTCAGCGCCCTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTa < 2:826239/233‑1 (MQ=255) agagaATGAAGTTCAGCGCCCTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCAt < 2:526001/219‑1 (MQ=255) gTTCAGCGCCCTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCttt > 2:1145077/1‑182 (MQ=255) gcCCTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGAtt > 1:766358/1‑236 (MQ=255) cTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTc < 1:336077/220‑1 (MQ=255) ccTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAggccg > 1:877675/1‑236 (MQ=255) cTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAggcc > 2:685816/1‑234 (MQ=255) tGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAggccggc > 1:1248929/1‑236 (MQ=255) tggtcagcgaaatcacccagcccgaactcaccgtagaacgcgccatgcaggttgcccgcagcatcgccgccaaagcgccgctggctgtgcgcctggccaaggaggcgttactgaaggccggtgataccgacctggccagcggcGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCAt < 1:1223322‑M2/32‑1 (MQ=255) ggAAGGCGCGGATGCCGTCAGCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGgc < 1:793965/232‑1 (MQ=255) aaGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGAcc < 1:1282623/213‑1 (MQ=255) cgcgGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTGCGGTGAGTTCGGGCTgg > 1:160705/1‑194 (MQ=255) cgcgGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCa < 1:685819/236‑1 (MQ=255) cgGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGt < 1:415234/236‑1 (MQ=255) ttCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCtt < 1:692187/236‑1 (MQ=255) tCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCt < 2:850399/234‑1 (MQ=255) gtCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGAtgct < 1:149404/137‑1 (MQ=255) gtCGCGGGCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGAtg < 2:275745/135‑1 (MQ=255) gcgcgGTCGGCGTTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAggg < 1:144941/219‑1 (MQ=255) aactcaccgtagaacgcgccatgcaggttgcccgcagcatcgccgccaaagcgccgctggctgtgcgcctggccaaggaggcgttactgaaggccggtgataccgacctggccagcggcGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCAt < 1:1183390‑M2/32‑1 (MQ=255) gcgGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGcgcg > 2:444191/1‑213 (MQ=255) tGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATc < 1:980221/236‑1 (MQ=255) atgcaggttgcccgcagcatcgccgccaaagcGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGtt < 1:1183390‑M1/119‑1 (MQ=255) atgcaggttgcccgcagcatcgccgccaaagcGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCa < 1:1223322‑M1/143‑1 (MQ=255) cagGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCg > 2:1170446/1‑166 (MQ=255) gTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAgg < 2:970076/171‑1 (MQ=255) aGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCAGGCct > 1:1130727/1‑174 (MQ=255) ggCATGGGGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGGATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGc < 2:1240435/211‑1 (MQ=255) gCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGgcggcgc > 2:24790/1‑99 (MQ=255) aTGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCa > 1:766059/1‑212 (MQ=255) tGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCCGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGGGGAgg > 2:993250/1‑183 (MQ=255) cgcTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCt < 1:1067980/211‑1 (MQ=255) tcgccgccaaagcGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCAt > 2:1223319‑M1/14‑214 (MQ=255) gcTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGgcggcg > 2:81189/1‑92 (MQ=255) gcTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGAttt > 2:909885/1‑147 (MQ=255) aGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGt < 2:859462/233‑1 (MQ=255) CCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTa > 2:185376‑M1/1‑109 (MQ=255) CCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTg > 1:1271777‑M1/1‑236 (MQ=255) ggcgggCCAGGTCGGTATCCCCGGCCTTCAGTGACGTCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCCGCGGCGCTGTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGAcc < 2:182112/136‑1 (MQ=255) CGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTCCGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGa < 1:489385‑M1/162‑1 (MQ=255) CGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTg < 2:872811‑M1/235‑1 (MQ=255) tggctgtgcgcctggccaaggaggcgttactgaaggccggtgataccgacctggccagcggcGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTAc < 1:1044405‑M2/44‑1 (MQ=255) GGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCa < 1:1035722‑M1/188‑1 (MQ=255) GCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTGGGTGcc < 1:1237983‑M1/236‑1 (MQ=255) GCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTGGGTGc > 1:1145332‑M1/1‑235 (MQ=255) ggTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCGTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACa > 1:639760/1‑215 (MQ=255) gccaaggaggcgttactgaaggccggtgataccgacctggccagcggcGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTGGGTGCCGCCAGCACCggg < 1:969392‑M2/188‑1 (MQ=255) aaggcggcgttactgaaggccggtgataccgacctggccagcggcGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGc < 2:196396‑M2/30‑1 (MQ=255) ggCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGGGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGGTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGa < 1:224443/194‑1 (MQ=255) gCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTAcc > 1:464531/1‑191 (MQ=255) gCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTGGGTGCCGCCAGCACCgg > 1:754213/1‑229 (MQ=255) tCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTGGGTGCCGCCAGCACCGGGGatgatg < 1:775529/233‑1 (MQ=255) cAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGCCCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCCTCTGCATGGCCACCGGCTTaac > 2:25773/1‑184 (MQ=255) cAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCt < 1:386367/148‑1 (MQ=255) cAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCt > 2:386364/1‑148 (MQ=255) cAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTGGGTGCCGCCAGCACCGGGGATGATGCCaa < 1:872814/236‑1 (MQ=255) cAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGCGATTTCGCTGAACAGGCCGGCCTGCGGGGCGCGGAGGGCAGTg > 1:189896/1‑142 (MQ=255) cAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTCGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTTAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGCCCAGGCCGGCCTGCTGGGCCCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCCCCCTCCGc > 2:82311/1‑169 (MQ=255) gTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCGGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCGCCAGCTGCATgcc > 2:178742/1‑170 (MQ=255) ctcctTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGAt > 2:488861/1‑135 (MQ=255) tGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGt > 2:465024/1‑182 (MQ=255) gCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTGGGTGCCGCCAGCACCGGGGATGATGCCAAGGTTGATTTCCGGc < 2:1070746/234‑1 (MQ=255) tgcggaccgggccagcgggGCGTCGGCGTCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAgg < 1:1096007‑M2/78‑1 (MQ=255) gcgcACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGc < 1:1047441/46‑1 (MQ=255) cacaGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCGGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTc > 2:153425/1‑126 (MQ=255) acaGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTGGGTGCCGCCAGCACCGGGGATGATGCCAAGGTTGATTACCGGCTGGCCGAAACg > 1:635006/1‑236 (MQ=255) acaGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGGGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGGGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCCTGGCCAACGGcg > 2:339131/1‑156 (MQ=255) cagcggcGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTGGGTGCCGCCAGCACCGGGGATGATGCCAAGGTTGATTTCCGGCTGGCCGAAACGGGc > 2:753938‑M2/8‑234 (MQ=255) gcggcGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACg < 1:297884‑M2/142‑1 (MQ=255) ggcGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTGGGTGCCGCCAGCACCGGGGATGATGCCAAGGTTGATTTCCGGCTGGCCGAAACGGGCGTCGGt > 1:794228‑M2/4‑236 (MQ=255) gcTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTGCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTGGGTGCCGCCAg < 2:289422/181‑1 (MQ=255) | GTGCTGGAAAGTCATGACAGACTCGCTCCGTCAGTCGAGAGAATGAAGTTCAGCGCCCTTGGAAGCGGGCCTGGCGCTTTTCCTGGAAGGCGCGGATGCCTTCATCGCGGTCGGCGGTGCCCGCCAGCAGGGTGAAGGCATGGCGCTCGAAGCGCAGGCCGCTGGCCAGGTCGGTATCACCGGCCTTCAGTAACGCCTCCTTGGCCAGGCGCACAGCCAGCGGCGCTTTGGCGGCGATGCTGCGGGCAACCTGCATGGCGCGTTCTACGGTGAGTTCGGGCTGGGTGATTTCGCTGACCAGGCCGGCCTGCTGGGCGCGGAGGGCAGTGATGGCTTCCCCCGTCAGCACCATCTGCATGGCCAACGGCTTACCGACGGCACGTAACAGGCGCTGGGTGCCGCCAGCACCGGGGATGATGCCAAGGTTGATTTCCGGCTGGCCGAAACGGGCGTCGGT > AE015451/3718578‑3719034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |