New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 424959 | 34 (0.780) | 4 (0.100) | 3/324 | NT | 11.1% | coding (351/1113 nt) | PP_0349 | putative Membrane protein |
? | AE015451 | = 425012 | 32 (0.770) | coding (298/1113 nt) | PP_0349 | putative Membrane protein |
GGTTGTGCAGGTCGAGCCAGCGCAGGCGGCGGGATTTCTTGTGGCGTACGGTGCCGAATTCCAGGCGGCGCATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTCACGCAGTTCAGGGGCGTCGCCTAGCAGGTGTTCGAGTT > AE015451/424727‑425194 | gggtgtgCAGGTCGAGCCAGCGCAGGCGGCGGGATTTCTTGTGGCGTACGGTGCCGAATTCCAGGCGGCGCATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTc < 1:199754/232‑1 (MQ=255) tgtgCAGGTCGAGCCAGCGCAGGCGGCGGGATTTCTTGTGGCGTACGGTGCCGAATTCCAGGCGGCGCATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGcc < 1:569120/235‑1 (MQ=255) cAGGTCGAGCCAGCGCAGGCGGCGGGATTTCTTGTGGCGTACGGTGCCGAATTCCAGGCGGCGCATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCccgc > 2:409012‑M1/1‑226 (MQ=255) tCGAGCCAGCGCAGGCGGCGGGATTTCTTGTGGCGTACGGTGCCGAATTCCAGGCGGCGCATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGgtgcgtgc < 1:422378/236‑1 (MQ=255) aGCGCAGGCGGCGGGATTTCTTGTGGCGTACGGTGCCGAATTCCAGGCGGCGCATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGc > 1:408086/1‑236 (MQ=255) gggATTTCTTGTGGCGTACGGTGCCGAATTCCAGGCGGCGCATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGgtgcgtgc < 1:279196/217‑1 (MQ=255) gCGTACGGTGCCGAATTCCAGGCGGCGCATAAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGgtgcgt < 1:229570/202‑1 (MQ=255) tGCCGAATTCCAGGCGGCGCATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTg > 1:387129‑M2/1‑235 (MQ=255) ttCCAGGCGGCGCATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGgtgcgtgc < 2:776393/189‑1 (MQ=255) cgcATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAAt < 1:743537/236‑1 (MQ=255) aaCGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGa < 1:539818/235‑1 (MQ=255) tAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTggcggtgg > 1:8475‑M2/1‑203 (MQ=255) agCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTgg < 1:223616/235‑1 (MQ=255) gCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTggg > 1:452336/1‑235 (MQ=255) cACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTggcggtggccatgccgg > 1:409014‑M2/1‑198 (MQ=255) aTGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTggcggcgggg < 1:204642‑M2/183‑11 (MQ=255) aTGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCAAATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCAt > 2:213553/1‑136 (MQ=255) tGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGcggcgg > 2:710759/1‑171 (MQ=255) tGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCgggg < 1:568831/236‑1 (MQ=255) aaGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCg < 1:313887/236‑1 (MQ=255) aGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGt > 2:693537/1‑151 (MQ=255) cagcagcTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAg > 2:332967/1‑205 (MQ=255) tGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGt > 2:439302/1‑198 (MQ=255) ggCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGgtgcgtg > 1:781008/1‑90 (MQ=255) gAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCCCCATTGGCGGCGGGCATGGCCCCCGCCTCGCCGgtgcgtgc < 2:98927/84‑1 (MQ=255) cacaGGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCCCCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAg < 1:238418/166‑1 (MQ=255) cgcAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGGGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTggg > 2:725885/1‑140 (MQ=255) gcagcaTCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCagccccgacccccacctgtcgcacaccttcatgctcgatgcacgcaccggccagg > 1:566375‑M1/1‑50 (MQ=255) cagcaTCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGAc < 1:217734/126‑1 (MQ=255) aTCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCt > 2:421053/1‑169 (MQ=255) aTCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCt < 1:421055/169‑1 (MQ=255) aTCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGtgc > 2:288949/1‑229 (MQ=255) catcatGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCAtt < 1:744859/235‑1 (MQ=255) ttcatGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTc < 2:614728/235‑1 (MQ=255) tGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCg < 2:587015/161‑1 (MQ=255) aaTCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCagcaccgaccccaacctgtcgcacaccttcatgctcgatgcacgcaccggcgaggcggtggccatgccggccgc > 2:278586‑M1/1‑33 (MQ=255) tCCACCAGTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTc < 2:614145/228‑1 (MQ=255) accaTTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCagcaccgaccccaacctgtcgcacaccttcatgccc > 2:659598‑M1/1‑28 (MQ=255) accaTTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTAGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTCACGCAGTTCAg > 1:762997/1‑236 (MQ=255) ccaTTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTCACGCAGTTCAgg > 1:546731/1‑236 (MQ=255) gcggcCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTggcggtggccatgccggccgccaatggtggatt > 2:278586‑M2/1‑74 (MQ=255) ggccggcATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCg < 1:346571/163‑1 (MQ=255) ccggcATGGCCACCGCCagcaccgaccccaacctgtcgcacaccttcatgctcgatgcacgcaccggcgaggcggtggccatgccggccgccaatggtggattcatgatggtgatgctgcgcctgcatgtggacatgttcgcaggcctgccgggcaagctgctgctggccttcatgggcgtattgttcattgtcgcgattgtctccggcaccgtg > 1:409014‑M1/1‑17 (MQ=255) cggcATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTCACGCAGTTCAGGGGCGTCGCCTa > 1:420078/1‑236 (MQ=255) aTGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGgtgt < 2:175365/43‑1 (MQ=255) ggCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTc < 2:408084/207‑1 (MQ=255) ccccgccgccagcaccgaccccaacctgtcgcacaccttcatgctcgatgcacgcaccggcgaggcggtggccatgccggccgccaatggtggattcatgatggtgatgctgcgcctgcatgtggacatgttcgcaggcctgccgggcaagctgctgctggccttcatgggcgtattgttcat < 1:204642‑M1/178‑174 (MQ=255) ccACCGCCagcaccgaccccaacctgtcgcacaccttcatgctcgatgcacgcaccggcgaggcggtggccatgccggccgccaatggtggattcatgatggtgatgctgcgcctgcatgtggacatgttcgcaggcctgccgggcaagctgctgctggccttcatgggcgtattgttcattgtcgcgattgtctccggcaccgtgctcta > 1:8475‑M1/1‑8 (MQ=255) ccTGGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTGGGGGTCGGGGCTggcggtggccatgccggccgccaatggtggattcatgatggtgatgctgc > 1:566375‑M2/1‑55 (MQ=255) ccTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTc < 2:445325/199‑1 (MQ=255) cagcaccgaccccaacctgtcgcacaccttcatgctcgatgcacgcaccggcgaggcggtggccatgccggccgccaatggtggattcatgatggtgatgctgcgcctgcatgtggacatgttcgcaggcctgccgggcaagctgctgctggccttcatgggcgtattgttcattgtcgcgattgtctccggcaccgtgctctatgcgccgttcatgcgccgcctggaattcggca > 1:387129‑M1/1‑1 (MQ=255) | GGTTGTGCAGGTCGAGCCAGCGCAGGCGGCGGGATTTCTTGTGGCGTACGGTGCCGAATTCCAGGCGGCGCATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTCACGCAGTTCAGGGGCGTCGCCTAGCAGGTGTTCGAGTT > AE015451/424727‑425194 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |