New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 424959 | 34 (0.780) | 4 (0.100) | 3/324 | NT | 11.1% | coding (351/1113 nt) | PP_0349 | putative Membrane protein |
? | AE015451 | = 425012 | 32 (0.770) | coding (298/1113 nt) | PP_0349 | putative Membrane protein |
TGCCGAATTCCAGGCGGCGCATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTCACGCAGTTCAGGGGCGTCGCCTAGCAGGTGTTCGAGTTCGTGGTGGAAGATAAGGGGCAGGCCGGTGACT > AE015451/424778‑425226 | tGCCGAATTCCAGGCGGCGCATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTg > 1:387129‑M2/1‑235 (MQ=255) cgcATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAAt < 1:743537/236‑1 (MQ=255) aaCGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGa < 1:539818/235‑1 (MQ=255) tAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTggcggtgg > 1:8475‑M2/1‑203 (MQ=255) agCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTgg < 1:223616/235‑1 (MQ=255) gCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTggg > 1:452336/1‑235 (MQ=255) cACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTggcggtggccatgccgg > 1:409014‑M2/1‑198 (MQ=255) aTGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTggcggcgggg < 1:204642‑M2/183‑11 (MQ=255) tGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGcggcgg > 2:710759/1‑171 (MQ=255) tGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCgggg < 1:568831/236‑1 (MQ=255) aaGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCg < 1:313887/236‑1 (MQ=255) cagcagcTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAg > 2:332967/1‑205 (MQ=255) tGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGt > 2:439302/1‑198 (MQ=255) cacaGGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCCCCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAg < 1:238418/166‑1 (MQ=255) cgcAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGGGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTggg > 2:725885/1‑140 (MQ=255) cagcaTCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGAc < 1:217734/126‑1 (MQ=255) aTCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCt < 1:421055/169‑1 (MQ=255) aTCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCt > 2:421053/1‑169 (MQ=255) aTCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGtgc > 2:288949/1‑229 (MQ=255) catcatGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCAtt < 1:744859/235‑1 (MQ=255) ttcatGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTc < 2:614728/235‑1 (MQ=255) tGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCg < 2:587015/161‑1 (MQ=255) tCCACCAGTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTc < 2:614145/228‑1 (MQ=255) accaTTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTAGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTCACGCAGTTCAg > 1:762997/1‑236 (MQ=255) ccaTTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTCACGCAGTTCAgg > 1:546731/1‑236 (MQ=255) gcggcCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTggcggtggccatgccggccgccaatggtggatt > 2:278586‑M2/1‑74 (MQ=255) ggccggcATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCg < 1:346571/163‑1 (MQ=255) cggcATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTCACGCAGTTCAGGGGCGTCGCCTa > 1:420078/1‑236 (MQ=255) ggCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTc < 2:408084/207‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTGGGGGTCGGGGCTggcggtggccatgccggccgccaatggtggattcatgatggtgatgctgc > 1:566375‑M2/1‑55 (MQ=255) ccTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTc < 2:445325/199‑1 (MQ=255) ggTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATg > 1:102202/1‑67 (MQ=255) tgcgtgcATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTTGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGTCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTc < 2:762783/190‑1 (MQ=255) gggcaTGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTggcggtggccatgccggccgccaatggt > 2:659598‑M2/3‑36 (MQ=255) gAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTtgc < 2:738193/145‑1 (MQ=255) gCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTc < 1:542414/178‑1 (MQ=255) aaGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTCACGCAGTTCAGGGGCGTCGCCTAGCAGGTGTTCGAGTTCgtgg < 1:77071/216‑1 (MQ=255) gACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTCACGCAGTTCAGGGGCGTCGCCTAGCAGGTGTTCGAGTTCGTGGTGGAAGATAAGGGGCAGGCCGGTGACt > 2:383390/1‑234 (MQ=255) gTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTc < 2:176659/159‑1 (MQ=255) gTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGtt < 2:214563/42‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGCTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTCACGCAGTTCAGGGGCGTCGCCTAGCAGGTGTTCGAGtac > 1:442078/1‑183 (MQ=255) | TGCCGAATTCCAGGCGGCGCATGAACGGCGCATAGAGCACGGTGCCGGAGACAATCGCGACAATGAACAATACGCCCATGAAGGCCAGCAGCAGCTTGCCCGGCAGGCCTGCGAACATGTCCACATGCAGGCGCAGCATCACCATCATGAATCCACCATTGGCGGCCGGCATGGCCACCGCCTCGCCGGTGCGTGCATCGAGCATGAAGGTGTGCGACAGGTTGGGGTCGGTGCTGGCGGTGGCGGCGGTAATGGCGACCACGCCGTTGGGCTCGTCTTCATCGTAGCCGAAGTACTGCATGACCTCGCCGGGGCGATGTTGTTCGGCCTTGAGCACCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTGCGGGGTGCCTGCCGGCATTTCACGCAGTTCAGGGGCGTCGCCTAGCAGGTGTTCGAGTTCGTGGTGGAAGATAAGGGGCAGGCCGGTGACT > AE015451/424778‑425226 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |