New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 519036 | 29 (0.660) | 5 (0.120) | 4/328 | NT | 15.9% | coding (425/1035 nt) | argC | N‑acetyl‑gamma‑glutamyl‑phosphate reductase 1 |
? | AE015451 | = 519107 | 25 (0.600) | coding (496/1035 nt) | argC | N‑acetyl‑gamma‑glutamyl‑phosphate reductase 1 |
TGTGGTGTTCTTCGCCACTCCGCATGGTGTTGCACACGCCCTGGCCGGTGAGCTGCTGGCGGCTGGCACCAAGGTGATCGACCTGTCGGCCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGACTGCAAGTCGGGTGTCAGCGGCGCTGGTCGTGGTGCGGCAGTGGGCTCGCTGTTCTGCGAGGCCGGCGAAAGCATGAAAGCCTACGCGGTAAAGGGCCATCGC > AE015451/518821‑519241 | tgtgGTGTTCTTCGCCACTCCGCATGGTGTTGCACACGCCCTGGCCGGTGAGCTGCTGGCGGCTGGCACCAAGGTGATCGACCTGTCGGCCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCtgt < 1:180040/231‑1 (MQ=255) cGCATGGTGTTGCACCCGCCATGGCCGGTGAGCTGCTGGCGGCTGGCACCAAGGTGATCGACCTGTCGGCCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCt < 1:183026/222‑1 (MQ=255) tGGTGTTGCACACGCCCTGGCCGGTGAGCTGCTGGCGGCTGGCACCAAGGTGATCGACCTGTCGGCCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCtgt < 1:470064/207‑1 (MQ=255) ttGCACACGCCCTGGCCGGTGAGCTGCTGGCGGCTGGCACCAAGGTGATCGACCTGTCGGCCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCCCTGTGCCGGGtt > 1:575156/1‑210 (MQ=255) cacaCGCCCTGGCCGGTGAGCTGCTGGCGGCTGGCACCAAGGTGATCGACCTGTCGGCCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGcttc > 1:217041/1‑236 (MQ=255) cccTGGCCGGTGAGCTGCTGGCGGCTGGCACCAAGGTGATCGACCTGTCGGCCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCa < 2:652401/186‑1 (MQ=255) cTGGCCGGTGAGCTGCTGGCGGCTGGCACCAAGGTGATCGACCTGTCGGCCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCt > 2:465615/1‑189 (MQ=255) cTGGCCGGTGAGCTGCTGGCGGCTGGCACCAAGGTGATCGACCTGTCGGCCGACTTCCGTCTACAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCAt > 2:366138/1‑185 (MQ=255) aGCTGCTGGCGGCTGGCACCAAGGTGATCGACCTGTCGGCCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCCGCGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTc > 2:135754/1‑173 (MQ=255) tgGCGGCTGGCACCAAGGTGATCGACCTGTCGGCCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCtgtg > 2:629690/1‑176 (MQ=255) ggCACCAAGGTGATCGACCTGTCGGCCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGAcc < 1:770143/235‑1 (MQ=255) aggtcGACCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGgcctggcggatcttctcgcggttgacttcg > 1:591808‑M2/3‑205 (MQ=255) cGGCCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGACTg > 1:690903/1‑235 (MQ=255) gCCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGgcctggcggatcttctcgcggttgacttcg > 1:697757‑M2/1‑199 (MQ=255) gTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGgccttgcggatcttctcgcggttgacttcg < 2:591806‑M2/219‑31 (MQ=255) cACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGgcctgg > 2:804959‑M2/1‑176 (MQ=255) ggggCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGACTGCAAGTCGGGTGTCAGCGGCGCt < 2:705730/224‑1 (MQ=255) gggCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGACTGCAAGTCGGGTGTCAGCGGCGCTGGTCGTGGTGCg < 1:348203/235‑1 (MQ=255) gTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGACTGCAAGTCGGGTGTCAGCGGCGCTGGTCGTGGTGCGGCAGTgg > 1:358406/1‑236 (MQ=255) aCGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGAc > 2:36464/1‑188 (MQ=255) tCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGACTGCAAGTCGGGTGTCAGCGGCGCTGGTCgtg > 2:422874/1‑215 (MQ=255) cAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGACTGCAAGTCGGGTGTCAGCGGCGCTGGTCGTGGTGCGGCAGTGGGCTCGCTGTTCTGCGAGGCCGGCGaa > 1:604440/1‑236 (MQ=255) agagCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGACTGCAAGTCGGGTGTCAgc > 1:699241/1‑184 (MQ=255) ctCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGATTGCAAGTCGGGTGTCAGCGGCGCTGGTCGTGGTGCGGCAGTGGGCTCGCTGTTCTGCGAGGCCGGCGAAAGCATGaa > 1:445000/1‑236 (MQ=255) tCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGCGAAGATCCGCCAGGCccgcctccagcagcggaaggaagcccagctgggttgcagtcgggtagcaacccg < 2:673804‑M1/97‑55 (MQ=255) tCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCccgcctccagcagcggaaggaagcccagctgggttgcagtcgggtagcaacccg > 1:673806‑M1/1‑43 (MQ=255) tCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTg > 1:175332/1‑137 (MQ=255) tCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGACTGCAAGTCGGGTGTCAGCGGCGCTGGTCGTGGTGCGGCAGTGGGCTCGCTGTTCTGCGAGGCCGGCGAAAGCATGAAAGCCTACGCgg > 2:726370/1‑234 (MQ=255) ggCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCTGGCACGCGTCATCGCTGTGCCGGGTTGCGACCCGACTGCCAGCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAg > 2:383813/1‑105 (MQ=255) ccTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGACTGCAAGTCGGGTGTCAGCGGCGCTGGTCGTGGTGCGGCAGTGGGCTCGCTGTTCTGCGAGGCCGGCGAAAGCATGAAAGCCTACGCGGTAAAGGGc > 1:686880/1‑235 (MQ=255) cGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCccgcctccagcagcggaaggaagcccagctgggttgcagtcgggtagcaacccggcacagcgatgaggcgtgcctggcggatcttctcgcggttgacttcgggcaggccatagactgcgtccttgagcagctctggcgcgccatggggctgaccgtaccacttgccccactcagtggcatcctgcagacggaagtcggtcgacct > 1:591808‑M1/1‑30 (MQ=255) cGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCccgcctccagcagcggaaggaagcccagctgggttgcagtcgggtagcaacccggcacagcgatgaggcgtgcctggcggatcttctcgcggttgacttcgggcaggccatagactgcgtccttgagcagctctggcgcgccatggggctgaccgtaccacttgccccactcagtggcatcctgcagacggaagtcggc > 1:697757‑M1/1‑30 (MQ=255) cGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGAccccccg > 2:125074/1‑114 (MQ=255) cGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGACTGCAAGTCGGGTGTCAGCGGCGCTGGTCGTGGTGCg > 2:681374/1‑169 (MQ=255) cGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGACTGCAAGTCGGGTGTCAGCGGCGCTGGTCGTGGTGCGGCAGTGGGCTCGCTGTTCTGCGAGGCCGGCGAAAGCATGAAAGCCTACGCGGTAAAGGGCCATc > 2:455236/1‑233 (MQ=255) cGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGCCGGGCCTGGCTGACCCGt > 2:26783/1‑116 (MQ=255) cGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCAAGGCccgcctccagcagcggaaggaagcccagctgggttgcagtcgggtagcaacccggcacagcgatgaggcgtgcctggcggatcttctcgcggttgacttcgggcaggccatagactgcgtccttgagcagctctggcgcgccatggggctgaccgtaccacttgccccactcagtggcatcctgcagac < 2:591806‑M1/219‑190 (MQ=255) aaCCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGACTGCAAGTCGGGTGTCAGCGGCGCTGGTCGTGGTGCGGCAGTGGGCTCGCTGTTCTGCGAGGCCGGCGAAAGCATGAAAGCCTACGCgg < 1:759216/214‑1 (MQ=255) ccAGGCccgcctccagcagcggaaggaagcccagctgggttgcagtcgggtagcaacccggcacagcgatgaggcgtgcctggcggatcttctcgcggttgacttcgggcaggccatagactgcgtccttgagcagctctggcgcgccatggggctgaccgtaccacttgccccactcagtg > 2:804959‑M1/1‑6 (MQ=255) | TGTGGTGTTCTTCGCCACTCCGCATGGTGTTGCACACGCCCTGGCCGGTGAGCTGCTGGCGGCTGGCACCAAGGTGATCGACCTGTCGGCCGACTTCCGTCTGCAGGATGCCACTGAGTGGGGCAAGTGGTACGGTCAGCCCCATGGCGCGCCAGAGCTGCTCAAGGACGCAGTCTATGGCCTGCCCGAAGTCAACCGCGAGAAGATCCGCCAGGCACGCCTCATCGCTGTGCCGGGTTGCTACCCGACTGCAACCCAGCTGGGCTTCCTTCCGCTGCTGGAGGCGGGCCTGGCTGACCCGTCGCGCCTGATCGCCGACTGCAAGTCGGGTGTCAGCGGCGCTGGTCGTGGTGCGGCAGTGGGCTCGCTGTTCTGCGAGGCCGGCGAAAGCATGAAAGCCTACGCGGTAAAGGGCCATCGC > AE015451/518821‑519241 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |