New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1161986 | 34 (0.780) | 3 (0.070) | 3/324 | NT | 8.3% | coding (949/1155 nt) | gtsD | mannose/glucose ABC transporter ‑ ATP binding subunit |
? | AE015451 | = 1162087 | 34 (0.820) | coding (1050/1155 nt) | gtsD | mannose/glucose ABC transporter ‑ ATP binding subunit |
CCAGGCAGGATGGCCGCTTGCTGGCGCTGCTCGACAGCGGCCAGGCGCGCTGCGAACTGCCCTTGGGGGAGGCTGCTGACGCGCTTGAGGGGCGCGAGATCATCCTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGA > AE015451/1161783‑1162214 | ccAGGCAGGATGGCCGCTTGCTGGCGCTGCTCGACAGCGGCCAGGCGCGCTGCGAACTGCCCTTGGGGGAGGCTGCTGACGCGCTTGAGGGGCGCGAGATCATCCTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGa < 2:442036/234‑1 (MQ=255) aggcaggATGGCCGCTTGCTGGCGCTGCTCGACAGCGGCCAGGCGCGCTGCGAACTGCCCTTGGGGGAGGCTGCTGACGCGCTTGAGGGGCGCGAGATCATCCTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCaa < 1:526171/236‑1 (MQ=255) tgctCGACAGCGGCCAGGCGCGCTGCGAACTGCCCTTGGGGGAGGCTGCTGACGCGCTGGAGGGGCGCGAGATCATCCTCGGCATCCGCCCTGGGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGCCGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTc < 1:364135/200‑1 (MQ=255) cGGCCAGGCGCGCTGCGAACTGCCCTTGGGGGAGGCTGCTGACGCGCTTGAGGGGCGCGAGATCATCCTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCa < 2:22225/185‑1 (MQ=255) aGGCGCGCTGCGAACTGCCCTTGGGGGAGGCTGCTGACGCGCTTGAGGGGCGCGAGATCATCCTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACctgctg > 2:544572/1‑170 (MQ=255) aGGCGCGCTGCGAACTGCCCTTGGGGGAGGCTGCTGACGCGCTTGAGGGGCGCGAGATCATCCTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCCGCTGgtgt > 2:186930/1‑174 (MQ=255) ttGGGGGAGGCTGCTGCCGCGCTTGAGGGGCGCGAGATCATCCTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCt < 2:186787/191‑1 (MQ=255) ctgctgACGCGCTTGAGGGGCGCGAGATCATCCTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTg > 2:393431/1‑182 (MQ=255) tgctgACGCGCTTGAGGGGCGCGAGATCATCCTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCgggtgggg > 1:165835/1‑207 (MQ=255) aGGGGCGCGAGATCATCCTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGtt < 1:703477/130‑1 (MQ=255) gaTCATCCTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAAc < 2:666279/196‑1 (MQ=255) gaTCATCCTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAAc > 1:666281/1‑196 (MQ=255) gtCGGCATCCTCCCTGAGCAGAGCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCGATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCAc < 2:200670/118‑1 (MQ=255) cTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACccggcccgg > 2:755733‑M2/1‑201 (MQ=255) tCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCa < 2:739343/111‑1 (MQ=255) gCAGATCGCCCTGCGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACcc > 2:465668‑M2/1‑184 (MQ=255) cAGATCGCCCTGGGCGCTGCGGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGgcgc < 2:6705/136‑1 (MQ=255) aGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGCTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGAGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGAGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTgctgct > 1:188208/1‑199 (MQ=255) tGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCATCCAGAcc < 2:174460/104‑1 (MQ=255) gggCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTc < 2:418578/169‑1 (MQ=255) gggCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTg > 2:697803/1‑233 (MQ=255) gggCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGCGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGGGCTGCTGTTCgccgcccc > 1:219070/1‑199 (MQ=255) tgACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGgtcgaattgcaggttgagggtgtcacccacc < 1:378364‑M1/93‑32 (MQ=255) tgACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGgtcgaattgcaggttgagggtgtcacccacc > 2:378362‑M1/1‑62 (MQ=255) tgACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGt < 1:544574/220‑1 (MQ=255) aTGGTTGGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCgggtgg < 2:21096/129‑1 (MQ=255) tttGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCCCAACCGCAAAGGACAACGt > 2:290723/1‑234 (MQ=255) agccGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCCCCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGc < 2:85592/175‑1 (MQ=255) cgcgCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACccggcccggtgggctctgtcacctgca > 1:644647‑M2/1‑138 (MQ=255) ccGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGt < 1:197533/236‑1 (MQ=255) tGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGgtcgaattgcaggttgagggtgtcacccacccggcacgccacatctggcgccaggcggcagcacaccttggtctggttgagcgtgacgaacaccagcaggtccggcccggtgggctctgtcacctgcacctcggcgcg > 1:644647‑M1/1‑27 (MQ=255) cAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTaca < 1:694826/234‑1 (MQ=255) agCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATc > 1:58856/1‑236 (MQ=255) gCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCg > 1:738098/1‑216 (MQ=255) ccACCGGGCCGGACCTGCTGGGGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAAtt > 2:44212/1‑109 (MQ=255) cACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCaaa < 1:366718/186‑1 (MQ=255) ccgggccgggtcgaattgcaggttgagggtgtcacccacccggcacgccacatctggcgccaggcggcagcacaccttggtctggttgagcgtgacgaacaccagcaggtccggcccggtgggctctgtcacctgcacctcggcgcggatagccggcaaaccattgccgtcagcagcgcccagggcgatctgctcagggcggatgccgag > 2:755733‑M1/1‑9 (MQ=255) ccGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGt > 1:715522/1‑212 (MQ=255) ccGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGt < 2:715520/212‑1 (MQ=255) gggCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAgg > 2:802028/1‑184 (MQ=255) gggCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGa > 2:367964/1‑235 (MQ=255) gggtcgaattgcaggttgagggtgtcacccacccggcacgccacatctggcgccaggcggcagcacaccttggtctggttgagcgtgacgaacaccagcaggtccggcccggtgggctctgtcacctgcacctcggcgcggatagccggcaaaccattgccgtcagcagcgcgcagggcgatctgc > 2:465668‑M1/1‑2 (MQ=255) | CCAGGCAGGATGGCCGCTTGCTGGCGCTGCTCGACAGCGGCCAGGCGCGCTGCGAACTGCCCTTGGGGGAGGCTGCTGACGCGCTTGAGGGGCGCGAGATCATCCTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGA > AE015451/1161783‑1162214 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |