New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1161986 | 34 (0.780) | 3 (0.070) | 3/324 | NT | 8.3% | coding (949/1155 nt) | gtsD | mannose/glucose ABC transporter ‑ ATP binding subunit |
? | AE015451 | = 1162087 | 34 (0.820) | coding (1050/1155 nt) | gtsD | mannose/glucose ABC transporter ‑ ATP binding subunit |
CTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACGCAAAGGGATGGAACAGCGCAAACGCATCAAGACACTGGGATCGTTGGCCTTGCTTGCACTTGTAGGCAGCAGCGGTACACAGGCTGCCG > AE015451/1161887‑1162314 | cTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACccggcccgg > 2:755733‑M2/1‑201 (MQ=255) gCAGATCGCCCTGCGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACcc > 2:465668‑M2/1‑184 (MQ=255) aGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGCTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGAGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGAGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTgctgct > 1:188208/1‑199 (MQ=255) gggCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTg > 2:697803/1‑233 (MQ=255) gggCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGCGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGGGCTGCTGTTCgccgcccc > 1:219070/1‑199 (MQ=255) tgACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGt < 1:544574/220‑1 (MQ=255) tttGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCCCAACCGCAAAGGACAACGt > 2:290723/1‑234 (MQ=255) agccGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCCCCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGc < 2:85592/175‑1 (MQ=255) cgcgCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACccggcccggtgggctctgtcacctgca > 1:644647‑M2/1‑138 (MQ=255) ccGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGt < 1:197533/236‑1 (MQ=255) cAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTaca < 1:694826/234‑1 (MQ=255) agCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATc > 1:58856/1‑236 (MQ=255) gCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCg > 1:738098/1‑216 (MQ=255) cACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCaaa < 1:366718/186‑1 (MQ=255) ccGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGt > 1:715522/1‑212 (MQ=255) ccGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGt < 2:715520/212‑1 (MQ=255) gggCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAgg > 2:802028/1‑184 (MQ=255) gggCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGa > 2:367964/1‑235 (MQ=255) tgctgGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACg < 1:367966/236‑1 (MQ=255) tgctgGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACg < 1:697805/236‑1 (MQ=255) ggggtTCGTCACGCTCAACCAGCCCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACg < 2:339852/229‑1 (MQ=255) cGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTgg > 2:299019/1‑173 (MQ=255) cGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACGCAAAg > 2:731418/1‑226 (MQ=255) tCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGGGACACCCTCCACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGGTCGACGCCGCCAATGGCGGGCGccc > 2:107336/1‑123 (MQ=255) tCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGAGGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCCACCCGGCCCGGCTGCTGCTGTTCGGGGCCGCCACTAGCg > 2:291706/1‑117 (MQ=255) acccAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACGCAAAGGGATGGAACAgcgc < 1:166154/233‑1 (MQ=255) tgtgCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACGCAAAGGGATGGAACAGCGCAAACGCATCAAGa > 1:476584/1‑235 (MQ=255) gccgccTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAAcc > 2:127583/1‑128 (MQ=255) gccgccTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAAcc < 1:127585/128‑1 (MQ=255) cAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACGCAAAGGGATGGAACAGCGCAAACGCATCAAGACACTGGGATCGTTGGCctt < 1:523262/236‑1 (MQ=255) ccGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACGCAAAGGGATgg < 2:738096/183‑1 (MQ=255) gggtggttGACACCCTCAACCTGCAATTCGCCCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGCCGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAg < 2:442579/129‑1 (MQ=255) ggtgggtgACACCCTCAACCTGCAATTCGACccggcccggtgggctctgtcacctgcacctcggcgcggatagccggcaaaccattgccgtca > 2:378362‑M2/1‑31 (MQ=255) ggtgggtgACACCCTCAACCTGCAATTCGACccggcccggtgggctctgtcacctgcacctcggcgcggatagccggcaaaccattgccgtca < 1:378364‑M2/93‑63 (MQ=255) ggtgggtgACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACg < 1:199537/169‑1 (MQ=255) cttCGACCCGGCCCGGGGGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACGCAAAGGGATg < 2:252647/154‑1 (MQ=255) aTTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACGCAAAGGGATGGAACAGCGCAAACGCATCAAGACACTGGGATCGTTg < 1:232749/191‑1 (MQ=255) ttCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACGCAAAGGGATGGAACAGCGCAAACGCATCAAGACACTGGGATCGTTGGCCTTGCTTGCACTTGTAGGCAGCAGCGGTACACAGGCTGCCg > 2:370361/1‑233 (MQ=255) ttCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCCCACTTCAAAGGCCGTTGACGCGTCTACAccct > 2:36184/1‑123 (MQ=255) cGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACGCAAAGGGATGGAACAGCGCAAACGCATCAAGACACTGGTATCGTTGGCCTTGCTTGCACTTGTAgg < 1:423192/208‑1 (MQ=255) gACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACGCAAAGGGATGGAACAGCGCAAACGCATCAAGACACTGGGATCGTTGGCCTTGCTTGCAc < 1:121186/200‑1 (MQ=255) | CTCGGCATCCGCCCTGAGCAGATCGCCCTGGGCGCTGCTGACGGCAATGGTTTGCCGGCTATCCGCGCCGAGGTGCAGGTGACAGAGCCCACCGGGCCGGACCTGCTGGTGTTCGTCACGCTCAACCAGACCAAGGTGTGCTGCCGCCTGGCGCCAGATGTGGCGTGCCGGGTGGGTGACACCCTCAACCTGCAATTCGACCCGGCCCGGGTGCTGCTGTTCGACGCCGCCAATGGCGAGCGCCTGCACCTGGCCAGTACTGGCGCAACCGCAAAGGACAACGTGGCTCACTTCAAAGGCCGTTGACTCGTCTACACCATCAATAAGAAAAAGAGGACGCAAAGGGATGGAACAGCGCAAACGCATCAAGACACTGGGATCGTTGGCCTTGCTTGCACTTGTAGGCAGCAGCGGTACACAGGCTGCCG > AE015451/1161887‑1162314 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |