| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 1260838 = | 37 (0.850) | 3 (0.070) | 3/326 | NT | 8.1% | coding (613/2451 nt) | PP_1103 | ATP‑dependent helicase, DEAD box family |
| ? | AE015451 | 1260901 = | 33 (0.790) | coding (550/2451 nt) | PP_1103 | ATP‑dependent helicase, DEAD box family | |||||
GCCCGGCCCAGTCCGGGCGGGCCTCAAGCAGGGCCTGATACCAGATTTCTGCCTGGGCGCGGGTGTTGGTGAACACCAGGCTACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCGGGG > AE015451/1260610‑1261067 | gCCCGGCCCAGTCCGGGCGGGCCTCAAGCAGGGCCTGATACCAGATTTCTGCCTGGGCGCGGGTGTTGGTGAACACCAGGCTACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTgggg > 1:751416/1‑235 (MQ=255) acgccagcagtgccgagcgcgcccgacaggcccggcggctacccagtgtgctgatcaccacccccgaaagcctgaccctgctgctgacccgggcaaaggcacgtgaggatttcgccacgctgcaactggtggtggtggatgaatggcacgagctgcttggcaacaagcgcggggtacaactgagctggccttggcgcgcctgcggcattggcacccgggcctaccgaCCTgggg > 1:203860‑M1/228‑234 (MQ=255) ccgagcgcgcccgacaggcccggcggctacccagtgtgctgatcaccacccccgaaagcctgaccctgctgctgacccgggcaaaggcacgtgaggatttcgccacgctgcaactggtggtggtggatgaatggcacgagctgcttggcaacaagcgcggggtacaactgcagctggctttggcgcgcctgcggcattggcacccgggcctaccgaCCTgggg > 1:792821‑M1/217‑223 (MQ=255) ggcCTCAAGCAGGGCCTGATACCAGATTTCTGCCTGGGCGCGGGTGTTGGTGAACACCAGGCTACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCcgt > 2:587816/1‑232 (MQ=255) cAAGCAGGGCCTGATACCAGATTTCTGCCTGGGCGCGGGTGTTGGTGAACACCAGGCTACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCcgtgcgt > 1:94401/1‑231 (MQ=255) aGATTTCTGCCTGGGCGCGGGTGTTGGTGAACACCAGGCTACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGcc < 1:587818/236‑1 (MQ=255) aTTTCTGCCTGGGCGCGGGTGTTGGTGAACACCAGGCTACTGTCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGACGGCCTTGCACCATCAGGCCGCCCTGGGgcag > 2:755935/1‑194 (MQ=255) tCTGCCTGGGCGCGGGTGTTGGTGAACACCCGGCTACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGa < 1:144883/233‑1 (MQ=255) gtTGGTGAACACCAGGCTACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGGGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGc > 1:20652/1‑236 (MQ=255) aaagcctgaccctgctgctgacccgggcaaaggcacgtgaggatttcgccacgctgcaactggtggtggtggatgaatggcacgagctgcttggcaacaagcgcggggtacaactgcagctggccttggcgcgcctgcggcattggcacccgggcctaccgac < 2:553009‑M1/1‑1 (MQ=255) acacCAGGCTACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGc < 1:558452/236‑1 (MQ=255) ccAGGCTACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATcc < 2:704787/173‑1 (MQ=255) tACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGTGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACac > 1:213747/1‑201 (MQ=255) ctggcactggcaTCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGcc < 2:286384/203‑1 (MQ=255) cactggcaTCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCgg > 1:595692/1‑217 (MQ=255) cactggcaTCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGgc > 1:406326/1‑234 (MQ=255) cactggcaTCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGGGCGTGGTGCCGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTc > 1:93507/1‑206 (MQ=255) tCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCcgcg > 1:485859/1‑236 (MQ=255) gAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCCAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGCGGGGTGccc > 2:181473/1‑160 (MQ=255) tgggggtggtggatgaatggcacgagctgcttggcaacaagcgcggggtacaactgccgctggccttggcgcgcctgcggcattggcacccgggcctaccgaCCTg < 2:500363‑M1/4‑1 (MQ=255) cgggCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAg < 2:452533/205‑1 (MQ=255) ccATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAagcagc < 1:23040/236‑1 (MQ=255) aTGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTGTTGGCAGCAGGGTGTCGACGTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAg < 2:164441/200‑1 (MQ=255) gtCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGcc < 1:23437/223‑1 (MQ=255) tCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGt < 2:751414/233‑1 (MQ=255) aaGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGACGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCcgc > 1:403011/1‑204 (MQ=255) ggAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGgcagc > 2:8548/1‑89 (MQ=255) gcttggcaacaagcgcggggtacaactgcagctggccttggcgcgcctgcggcattggcacccgggcctaccgcCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCgacacgc < 1:429602‑M1/57‑4 (MQ=255) cTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCCGGTCGGTAGGCCCGGGTGc > 2:713629/1‑151 (MQ=255) tCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTGGTCTGGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTggg < 2:34959/76‑1 (MQ=255) cGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGGTGc > 1:103063/1‑201 (MQ=255) cagcagGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTGGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTg < 2:644093/232‑1 (MQ=255) ggTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATc > 2:689908/1‑234 (MQ=255) ggTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGGGTTGCAGGTTGCCGGGGGGTGCCGACAAGcccccg > 2:94772/1‑110 (MQ=255) tCGACTTGCAGTGCCTGGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTGGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCcgc < 2:45144/169‑1 (MQ=255) ggccttggcgcgcctgcggcattggcacccgggcctaccgaCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGcc < 1:553011‑M1/133‑1 (MQ=255) tGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATc < 2:595690/194‑1 (MQ=255) cttggcgcgcctgcggcattggcacccgggcctaccgaCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAgg < 1:263391‑M1/44‑1 (MQ=255) ccTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCgg < 1:242907/236‑1 (MQ=255) ccTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCg < 1:402027/235‑1 (MQ=255) ggCCTTGCACCAGCAGGCCGccc < 2:465358/23‑1 (MQ=255) cagcagGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCttt < 1:423669/236‑1 (MQ=255) cagcagGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCttt < 1:286705/236‑1 (MQ=255) ggCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTg < 1:381683/198‑1 (MQ=255) ggCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGACGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTg < 2:403009/198‑1 (MQ=255) gccCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGGTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCgggg < 1:92788/232‑1 (MQ=255) | GCCCGGCCCAGTCCGGGCGGGCCTCAAGCAGGGCCTGATACCAGATTTCTGCCTGGGCGCGGGTGTTGGTGAACACCAGGCTACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCGGGG > AE015451/1260610‑1261067 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |