New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 1260838 = | 37 (0.850) | 3 (0.070) | 3/326 | NT | 8.1% | coding (613/2451 nt) | PP_1103 | ATP‑dependent helicase, DEAD box family |
? | AE015451 | 1260901 = | 33 (0.790) | coding (550/2451 nt) | PP_1103 | ATP‑dependent helicase, DEAD box family |
GTTGGTGAACACCAGGCTACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCGGGGGTGGTGATCAGCACACTGGGTAGCCGCCGGGCCTGTCGGGCGCGCTCGGCACTGTTGGTGT > AE015451/1260674‑1261128 | gtTGGTGAACACCAGGCTACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGGGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGc > 1:20652/1‑236 (MQ=255) acacCAGGCTACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGc < 1:558452/236‑1 (MQ=255) cactggcaTCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCgg > 1:595692/1‑217 (MQ=255) cactggcaTCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGgc > 1:406326/1‑234 (MQ=255) cactggcaTCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGGGCGTGGTGCCGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTc > 1:93507/1‑206 (MQ=255) tCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCcgcg > 1:485859/1‑236 (MQ=255) cgggCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAg < 2:452533/205‑1 (MQ=255) ccATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAagcagc < 1:23040/236‑1 (MQ=255) aTGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTGTTGGCAGCAGGGTGTCGACGTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAg < 2:164441/200‑1 (MQ=255) gtCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGcc < 1:23437/223‑1 (MQ=255) tCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGt < 2:751414/233‑1 (MQ=255) aaGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGACGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCcgc > 1:403011/1‑204 (MQ=255) cTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCCGGTCGGTAGGCCCGGGTGc > 2:713629/1‑151 (MQ=255) ggcaacaagcgcggggtacaactgcagctggccttggcgcgcctgcggcattggcacccgggcctaccgacctggggcttgtcggcaaccctcggcaacctgcaacacgcacgggatgtcttgctgccccaggTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGcc < 1:553011‑M2/41‑1 (MQ=255) cGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGGTGc > 1:103063/1‑201 (MQ=255) cagcagGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTGGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTg < 2:644093/232‑1 (MQ=255) ggTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATc > 2:689908/1‑234 (MQ=255) tCGACTTGCAGTGCCTGGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTGGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCcgc < 2:45144/169‑1 (MQ=255) ggccttggcgcgcctgcggcattggcacccgggcctaccgaCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGcc < 1:553011‑M1/133‑1 (MQ=255) tGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATc < 2:595690/194‑1 (MQ=255) ccTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCgg < 1:242907/236‑1 (MQ=255) ccTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCg < 1:402027/235‑1 (MQ=255) cagcagGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCttt < 1:423669/236‑1 (MQ=255) cagcagGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCttt < 1:286705/236‑1 (MQ=255) ggCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTg < 1:381683/198‑1 (MQ=255) ggCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGACGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTg < 2:403009/198‑1 (MQ=255) gccCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGGTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCgggg < 1:92788/232‑1 (MQ=255) cgGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCGGGGGTGGTGa > 1:181475‑M1/3‑236 (MQ=255) CTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGcc > 2:436314‑M1/1‑103 (MQ=255) gcgtgtcggcaaccctcggcaacctgcaacacgcacgggatgtcttgctgccccaggGCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAagc < 1:429602‑M2/74‑1 (MQ=255) GCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGa > 2:691819‑M1/1‑174 (MQ=255) CAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTc < 2:381681‑M1/180‑1 (MQ=255) cgaGACAGCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGGCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGcc < 2:34872/121‑1 (MQ=255) caAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCttt < 1:737732/215‑1 (MQ=255) cctcggcaacctgcaacacgcacgggatgtcttgctgccccaggTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAg < 1:263391‑M2/38‑1 (MQ=255) tgtTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCggggg > 1:346150/1‑205 (MQ=255) gtTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCt > 2:280132/1‑168 (MQ=255) ggTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCGGGGGTGGTGATCAGCACACTGGGTAGCCGCCGGGCCTGTCg < 1:689910/235‑1 (MQ=255) gCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCGGGGGTGGTGATCAGCACACTGGGTAGCCGCCGGGCCTGTCggg > 2:506635/1‑233 (MQ=255) gCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCGGGGGTGGTGATCAGCACACTGGGTAGCCGCCGGGCCTGTCGGgc < 2:485857/234‑1 (MQ=255) ccGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCGGGGGTGGTGATCAGCACACTGGGTAGCCGCCGGGCCTGTCGGgcgc < 1:344464/235‑1 (MQ=255) ccGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCGGGGGTGGTGATCAGCACACTGGGTAGCCGCCGGGCCTGTCGGgc < 2:20652/223‑1 (MQ=255) aCAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCGGGGGTGGTGATCAGCACACTGGGTAGCCGCCGGGCCTGTCGGGCGCGCTCg > 1:223532/1‑227 (MQ=255) aGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTcag > 1:383139/1‑154 (MQ=255) aGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTcag < 2:383137/154‑1 (MQ=255) ccccaggTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCT‑CAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCGGGGGTGGTGATCAGCACACTGGGTAGCCGCCGGGCCTGTCGGGCGCGCTCGGCACTGCTGgcgt > 1:203860‑M2/8‑234 (MQ=255) ccccaggTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAAGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCGGGGGTGGTGATCAGCACACTGGGTAGCCGCCGGGCCTGTCGGGCGCGCTCgg > 1:792821‑M2/8‑223 (MQ=255) caggTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCGGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATccaccaccccca < 2:500363‑M2/102‑1 (MQ=255) gTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCttt < 2:553009‑M2/162‑1 (MQ=255) | GTTGGTGAACACCAGGCTACTGGCACTGGCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCATCCACCACCACCAGTTGCAGCGTGGCGAAATCCTCACGTGCCTTTGCCCGGGTCAGCAGCAGGGTCAGGCTTTCGGGGGTGGTGATCAGCACACTGGGTAGCCGCCGGGCCTGTCGGGCGCGCTCGGCACTGTTGGTGT > AE015451/1260674‑1261128 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |