New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2776095 = | 35 (0.800) | 3 (0.070) | 3/318 | NT | 9.3% | coding (442/1227 nt) | sotB | Probable sugar efflux transporter |
? | AE015451 | 2776128 = | 26 (0.640) | coding (475/1227 nt) | sotB | Probable sugar efflux transporter |
ATCTACGCCTGGATCGTGGCACTGGCCTCGTTGCCCATGATGTTGCTGACCCGCAACATCGAACGGCGGCGTCTGCTGCTGTTCGTGTTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGCCACCATGCTTTGCCTGATCAAATCGCTGCCGCTGCTGCCCAGCCAGAACTCCGGTTCGTTGCGCAGC > AE015451/2775864‑2776301 | aTCTACGCCTGGATCGTGGCACTGGCCTCGTTGCCCATGATGTTGCTGACCCGCAACATCGAACGGCGGCGTCTGCTGCTGTTCGTGTTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCca > 1:474782/1‑236 (MQ=255) tACGCCTGGATCGTGGCACTGGCCTCGTTGCCCATGATGTTGCTGACCCGCAACATCGAACGGCGGCGTCTGCTGCTGTTCGTGTTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCca < 2:681146/233‑1 (MQ=255) ggATCGTGGCACTGGCCTCGTTGCCCATGATGTTGCTGACCCGCAACATCGAACGGCGGCGTCTGCTGCTGTTCGTGTTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAg > 1:396293/1‑236 (MQ=255) cTCGTTGCCCATGATGTTGCTGACCCGCAACATCGAACGGCGGCGTCTGCTGCTGTTCGTGTTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCctgctt > 1:365553/1‑234 (MQ=255) tCGTTGCCCATGATGTTGCTGACCCGCAACATCGAACGGCGGCGTCTGCTGCTGTTCGTGTTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGc < 1:610737/236‑1 (MQ=255) gCTGACCCGCAACATCGAACGGCGGCGTCTGCTGCTGTTCGTGTTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTgg < 1:501657/236‑1 (MQ=255) tGACCCGCAACATCGAACGGCGGCGTCTGCTGCTGTTCGTGTTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGc > 1:38065/1‑235 (MQ=255) cGCAACATCGAACGGCGGCGTCTGCTGCTGTTCGTGTTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGc > 1:183513/1‑212 (MQ=255) tCGAACGGCGGCGTCTGCTGCTGTTCGTGTTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCca < 2:800094/178‑1 (MQ=255) cgTCTGCTGCTGTTCGTGTTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTc > 1:24996/1‑219 (MQ=255) tgctgctgTTCGTGTTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGc < 1:395914/190‑1 (MQ=255) gctgctgTTCGTGTTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATc < 1:271469/223‑1 (MQ=255) tgtTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGGTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGc < 1:294157/178‑1 (MQ=255) tGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTa > 1:781403/1‑236 (MQ=255) ccACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTgg < 2:413233/173‑1 (MQ=255) cTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCGGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTgg < 2:762049/128‑1 (MQ=255) cGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGcc < 1:510278/235‑1 (MQ=255) aTGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGc > 1:627197/1‑177 (MQ=255) cTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGGATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGCCACCATGCTTTGCCTGATCACATcgctgccg > 1:97705/1‑231 (MQ=255) cATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATc > 2:282191/1‑162 (MQ=255) cATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATc < 1:282193/162‑1 (MQ=255) ggTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGc > 1:633518/1‑60 (MQ=255) ggTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGc < 2:633516/60‑1 (MQ=255) ggTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGCCACCATGCTTTGCCTGATCAAATCGCTGCCGCTGCTGCccagcc > 2:507315/1‑233 (MQ=255) ggTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGCGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTgtggtg > 2:645735/1‑133 (MQ=255) tCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGCCACCATGCTTTGCCTGATCAAATCGCTGCCgctgct > 2:764510/1‑220 (MQ=255) ccagcgggatgcccaggaccatggccagggtagtaccggtGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCgg < 1:373174‑M1/128‑1 (MQ=255) ccagcgggatgcccaggaccatggccagggtagtaccggtGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCgg > 2:373172‑M1/41‑168 (MQ=255) cATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGCCACCATGCTTTGCCTGATc > 2:647384/1‑196 (MQ=255) aCCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTgg < 2:183511/82‑1 (MQ=255) ccGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGc < 1:100776/172‑1 (MQ=255) ccGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGCCACCATGCTTTGCCTGATCAAATCGCTGCCGCTGCTGCCCCGCCAGAACTCCGGTTCGTTgcgc > 1:64792/1‑236 (MQ=255) ccGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGATGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGCCCCCATGCTTTGCCTGATCAAATcgc > 1:65255/1‑198 (MQ=255) cGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCCAGCGCCTTGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTgg < 2:188824/92‑1 (MQ=37) ccaggaccatggccagggtagtaccggtGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTCGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTc < 2:36227‑M1/114‑1 (MQ=255) tCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGtactac > 2:512827/1‑71 (MQ=255) tCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGtactac < 1:512829/71‑1 (MQ=255) gCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGCCACCATGCTTTGCCTGATCAAATcgctgcc < 1:89439/195‑1 (MQ=255) ggCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGCCACCATGCTTTGCCTGATCAAATCGCTGCCGCTGCTGCCCAGCCAGaa > 1:102082/1‑210 (MQ=255) cGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGCCACCATGCTTTGCCTGATCAAATCGCTGCCGCTGCTGCCCAGCCAGAACTCCGGTTCGTTGCGCAGc < 1:453824/222‑1 (MQ=255) ggccgccGGGCCAGCAGGCCAAGCCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGCCACCATGCTTTGCCTGATCAAATcgctgccgctgc < 2:102081/182‑1 (MQ=255) GGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGCCACCATGCTTTGCctgct < 2:657335‑M1/158‑3 (MQ=255) | ATCTACGCCTGGATCGTGGCACTGGCCTCGTTGCCCATGATGTTGCTGACCCGCAACATCGAACGGCGGCGTCTGCTGCTGTTCGTGTTCCTGGTGTTCATTGTCAGCCACTTGCTGTCCTGGCTTTCGCAAAGCTTCGCCATGCTGCTGGTCAGCCGCATCGGCATTGCCCTGGCGCATGCGGTGTTCTGGTCCATCACCGCCTCGCTGGCGGTGCGTGTGGCGCCGCCGGGCCAGCAGGCCAAGGCGCTGGGCCTGCTGGCCACCGGTACTACCCTGGCCATGGTCCTGGGCATCCCGCTGGGCCGTGTGGTGGGCGAGGCACTGGGCTGGCGTATCACGTTCCTGAGCATTGCCGGGGTAGCGCTAGCCACCATGCTTTGCCTGATCAAATCGCTGCCGCTGCTGCCCAGCCAGAACTCCGGTTCGTTGCGCAGC > AE015451/2775864‑2776301 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |