New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3298848 = | 28 (0.640) | 3 (0.070) | 3/322 | NT | 10.1% | coding (1065/2319 nt) | pvdQ | Acyl‑homoserine lactone acylase |
? | AE015451 | 3298880 = | 27 (0.660) | coding (1097/2319 nt) | pvdQ | Acyl‑homoserine lactone acylase |
TTCAACCAGCACCTGGCGTGGACGCACACCGTCGACACCTCCAAGCACTTCACGCTCTACCGCCTGCAACTCGACCCCAAAGACCCGACCCGCTATGTGCTCGATGGCAAGTCGCTGCCTATGGCCCGGCAAACCATCCGTGTCGCGGTAAAAGGCACGGATGGCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCGAGCAGTTGCAAGGTATCCCTTGGGTCAACACGCTGGCCGTGGATCAGGGAGGGCGGGCCTTGTACCTGAACCAGTCGGTAGTGCCCTATGTCGACCAGC > AE015451/3298621‑3299077 | ctgcgggttgctgcaggtatccaacagttgctggtcgacatagggcactaccgactggttcaggtacaaggcccgccctccctgatccacggccagcgtgttgacccaagggataccttgcaactgctcgaccgatcccttcaatgccgccaggctgtcggctcggttgatctggtaccactgctgcaacacccgtgagttctcgaggttggcgtctcgcacgctgtAGGCCGCCt > 1:366629‑M1/228‑236 (MQ=255) ctgcgggttgctgcaggtatccaacagttgctggtcgacatagggcactaccgactggttcaggtacaaggcccgccctccctgatccacggccagcgtgttgacccaagggataccttgcaactgctcgaccgatcccttcaatgccgccaggctgtcggctcggttgatctggtaccactgctgcaacacccgtgagttctcgaggttggcgtctcgcacgctgtAGGCCGCCt > 1:415234‑M1/228‑236 (MQ=255) aCCGCCTGCAACTCGACCCCAAAGACCCGACCCGCTATGTGCTCGATGGCAAGTCGCTGCCTATGGCCCGGCAAACCATCCGTGTCGCGGTAAAAGGCACGGATGGCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCa < 1:372381/193‑1 (MQ=255) cGCCTGCAACTCGACCCCAAAGACCCGACCCGCTATGTGCTCGATGGCAAGTCGCTGCCTATGGCCCGGCAAACCATCCGTGTCGCGGTAAAAGGCACGGATGGCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGgc < 1:268893/171‑1 (MQ=255) cccAAAGACCCGACCCGCTATGTGCTCGATGGCAAGTCGCTGCCTATGGCCCGGCAAACCATCCGTGTCGCGGTAAAAGGCACGGATGGCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAggc < 2:375622/179‑1 (MQ=255) gCAAGTCGCTGCCTATGGCCCGGCAAACCATCCGTGTCGCGGTAAAAGGCACGGATGGCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTggcggc > 1:666068/1‑235 (MQ=255) gCTGCCTATGGCCCGGCAAACCATCCGTGTCGCGGTAAAAGGCACGGATGGCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGgtgt < 2:714082/185‑1 (MQ=255) gCCTATGTCCCGGCAAACCATCCGTGTCGCGGTAAAAGGCACGGCTGGCAGCCTGAGCCAGATTGCGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCCCCt < 2:542076/120‑1 (MQ=255) gCCCGGCAAACCATCCGTGTCGCGGTAAACGGCACGGATGGCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATgcgc < 2:218064/127‑1 (MQ=255) ccATCCGTGTCGCGGTAAGAGGCACGGATGGCAGCCTGAGCCAGATGGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTc < 1:186912/224‑1 (MQ=255) cgGTAAAAGGCACGGATGGCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTc > 1:708917/1‑212 (MQ=255) cgGTAAAAGGCACGGATGGCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTc < 2:708915/212‑1 (MQ=255) aaaGGCACGGATGGCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTgcagc > 1:511022/1‑154 (MQ=255) aaaGGCACGGATGGCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTgcagc < 2:511020/154‑1 (MQ=255) aaaGGCACGGATGGCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACACCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAgg < 2:481271/199‑1 (MQ=255) gagggCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTCCAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCGAGCAGTTGCAAGGTATCCCTTGGGTCAACACGCTGGc < 1:183229/233‑1 (MQ=255) gCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCGAGCAGTTGCAAGGTATCCCTTGGGTCAACACGCTGGCCGTg > 1:600049/1‑236 (MQ=255) gAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGGGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGAGGCGCCggccgc > 2:88340/1‑77 (MQ=255) aGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGACCGCCTGGACTGGGATTCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTgcag < 2:77810/122‑1 (MQ=255) caacacccgtgagttctcgaggttggagtctcgcacgctgtAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGGGCGAGAc < 2:126049‑M1/46‑1 (MQ=255) aacacccgtgagttctcgaggttggcgtctcgcacgctgtAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGAc < 1:668409‑M1/46‑1 (MQ=255) cagttcgcagttcgGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGGTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCg > 1:316862/1‑164 (MQ=255) agttcgcagttcgGCCCGGTGGTGCAATTGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCGAGCAGTTGCAAGGTATCCCTTGGGTCAACACGCTg < 1:23882/198‑1 (MQ=255) gcagttcgGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCGAGCAGTTGCAAGGTATCCCTTGGGTCAACACGCTGGCCGTGGATCAGGGAGGGCGGGCCTTGTACCTGAACCAGTCg < 1:369665/235‑1 (MQ=255) agttcgGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCGAGCAGTTGCAAGGTATCCCTTGGGTCAACACGCTGGCCGTGGATCAGGGAGGGCGGGCCTTGTACCTGAACCAGTCg > 2:415089/1‑233 (MQ=255) agttcgGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCGAGCAGTTGCAAGGTATCCCTTGGGTCAACACGCTGGCCGTGGATCAGGGAGGGCGGGCCTTGTACCTGAACCAGTCGGtc > 1:108797/1‑235 (MQ=255) agttcgGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGAACGGGCGAg > 2:73940/1‑158 (MQ=255) ttcgGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCGAGCAGTTGCAAGGTATCCCTTGGGTCAACACGCTGGCCGTGGATCAGGGAGGGCGGGCCTTGTACCTGAACCAGTCg < 2:600047/231‑1 (MQ=255) aggttggcgtctcgcacgctgtAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGCACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCGAGCAGTTGCAAGGGATCCCTTGGGTCAACACg < 1:146507‑M1/163‑1 (MQ=255) ggCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTggcg > 2:717939/1‑132 (MQ=255) ccGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCGAGCAGTTGCAAGGTATCCCTTGGGTCAACACGCTGGCCGTGGATCAGGGAGGGCGGGCCTTGTACCTGAACCAGTCGGTAGTGCCCTa > 1:631139/1‑236 (MQ=255) ggtggtGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCGAGCAGTTGCAAGGTATCCCTTGGGTCAACACGCTGGCCGTGGATCAGGGAgggcggg > 2:695249/1‑203 (MQ=255) ggtggtGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCGAGCAGTTGCAAGGTATCCCTTGGGTCAACACGCTGGCCGTGGATCAGGGAgggcggg < 1:695251/203‑1 (MQ=255) aTGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCGAGCAGTTGCAAGGTATCCCTTGGGTCAACACGCTGGCCGTGGATCAGGGAGGGCGGGCCTTGTACCTGAACCAGTCGGTAGTGCCCTATGTCGACCAGc < 1:526374/236‑1 (MQ=255) cAGGCCGCCTGGCCTGGGAGGCGCCGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCGCGAGAACCCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGGTCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGCAGGGATCGGTCGAg < 2:287732/134‑1 (MQ=255) | TTCAACCAGCACCTGGCGTGGACGCACACCGTCGACACCTCCAAGCACTTCACGCTCTACCGCCTGCAACTCGACCCCAAAGACCCGACCCGCTATGTGCTCGATGGCAAGTCGCTGCCTATGGCCCGGCAAACCATCCGTGTCGCGGTAAAAGGCACGGATGGCAGCCTGAGCCAGATTGAGCGGCAGGTTTACAGTTCGCAGTTCGGCCCGGTGGTGCAATGGCCAGGCCGCCTGGACTGGGATGCGCAGGCGGCCTACAGCGTGCGAGACGCCAACCTCGAGAACTCACGGGTGTTGCAGCAGTGGTACCAGATCAACCGAGCCGACAGCCTGGCGGCATTGAAGGGATCGGTCGAGCAGTTGCAAGGTATCCCTTGGGTCAACACGCTGGCCGTGGATCAGGGAGGGCGGGCCTTGTACCTGAACCAGTCGGTAGTGCCCTATGTCGACCAGC > AE015451/3298621‑3299077 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |