New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 3550927 | 29 (0.660) | 5 (0.120) | 5/324 | NT | 14.8% | coding (79/957 nt) | PP_3135 | putative Glycosyl transferase |
? | AE015451 | = 3550994 | 30 (0.730) | coding (146/957 nt) | PP_3135 | putative Glycosyl transferase |
CCGAACAGTTGATCAAGCGGGTCGAGGCACGTTGCGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAAC > AE015451/3550702‑3551156 | ccGAACAGTTGATCAAGCGGGTCGAGGCACGTTGCGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGa > 1:291851/1‑236 (MQ=255) aaGCGGGTCGAGGCACGTTGCGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCt < 1:680196/234‑1 (MQ=255) aaGCGGGTCGAGGCACGTTGCGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTg > 1:486936/1‑235 (MQ=255) aCGTTGCGAAGCCTCCCCATGGATCGATCTGGCGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACagcgagcg < 1:251445/217‑1 (MQ=255) cATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTAc > 2:354755/1‑214 (MQ=255) cATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGC > 1:717507‑M1/1‑181 (MQ=255) tcgatcTGGTGGAGCAGCGCAACGGTGCCTACGTCCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATg < 1:270795/235‑1 (MQ=255) gatcTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATg < 2:291849/233‑1 (MQ=255) cTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTcgcgcg > 1:129233/1‑227 (MQ=255) gcagcGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagc > 2:748875‑M2/1‑229 (MQ=255) cAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTGCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGtt < 2:15416/186‑1 (MQ=255) ccGGAAGTGGAACCGGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAg < 1:354757/236‑1 (MQ=255) gcgcAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgaccacc > 1:583928‑M2/1‑183 (MQ=255) gcAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAAc > 1:368664/1‑236 (MQ=255) aaaGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGcaa > 1:112035/1‑224 (MQ=255) gTCAGTATGTCTGCGGGGACAGCTGAAATGGCGAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGt < 1:429/173‑1 (MQ=255) ttcGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCa > 1:715769/1‑213 (MQ=255) ggACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCca > 1:459155/1‑231 (MQ=255) gAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagc > 2:225913‑M2/1‑149 (MQ=255) gAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagc < 1:225915‑M2/154‑6 (MQ=255) gCTAGCAACCCTGTGGATGTCTTGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCggg < 2:504839/214‑1 (MQ=255) aGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCtggtg > 2:213715/1‑111 (MQ=255) aaCCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCaa < 1:798952/235‑1 (MQ=255) aTGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGcc > 1:657170/1‑195 (MQ=255) aTGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCAc < 2:790794/221‑1 (MQ=255) aTGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCAc > 1:790796/1‑221 (MQ=255) tCATGGTGGGCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgc < 2:483946‑M1/112‑56 (MQ=255) ggtggtCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgaccaccatgacatccacaggtttgctagccatttcagctgtccccgaagaaatactgacgtctttgcgc > 1:583928‑M1/1‑53 (MQ=255) aaCTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCa > 1:361024/1‑235 (MQ=255) ttCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATa < 1:698816/235‑1 (MQ=255) tACCGCTGGACTATTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAggg < 1:500981/207‑1 (MQ=255) ccGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcg > 1:109624‑M1/1‑36 (MQ=255) ccGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcg < 2:109623‑M1/96‑61 (MQ=255) gACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcg > 2:449632‑M1/1‑30 (MQ=255) aCTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGcc < 1:153201/208‑1 (MQ=255) tGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGcc < 2:453858/203‑1 (MQ=255) cAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCg > 2:556205/1‑226 (MQ=255) cAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGa > 1:299889/1‑236 (MQ=255) cgctgcgcCGGGCCGACagcg > 2:656612/1‑21 (MQ=255) cgctgcgcCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtc > 2:449632‑M2/1‑73 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgaccaccatgacatccacaggtttgctagccatttcagctgtccccgaagaaatactgacgtctttgcgccatcagtaacggttccacttccgggtcgtaggcaccgttgcgctgc > 2:748875‑M1/1‑5 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgaccaccatgacatccacaggtttgctagccatttc > 2:225913‑M1/1‑5 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgaccaccatgacatccacaggtttgctagccatttc < 1:225915‑M1/154‑150 (MQ=255) gcgcCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCtg > 1:310922/1‑37 (MQ=255) gcgcCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCtg < 2:310920/37‑1 (MQ=255) | CCGAACAGTTGATCAAGCGGGTCGAGGCACGTTGCGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAAC > AE015451/3550702‑3551156 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |