New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 3550927 | 29 (0.660) | 5 (0.120) | 5/324 | NT | 14.8% | coding (79/957 nt) | PP_3135 | putative Glycosyl transferase |
? | AE015451 | = 3550994 | 30 (0.730) | coding (146/957 nt) | PP_3135 | putative Glycosyl transferase |
GCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAACGCTCGACTACATGGACGCCCACCCGGAGTGCGGCGTACTGGGGGTG > AE015451/3550766‑3551202 | gcagcGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagc > 2:748875‑M2/1‑229 (MQ=255) ccGGAAGTGGAACCGGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAg < 1:354757/236‑1 (MQ=255) gcgcAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgaccacc > 1:583928‑M2/1‑183 (MQ=255) gcAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAAc > 1:368664/1‑236 (MQ=255) aaaGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGcaa > 1:112035/1‑224 (MQ=255) gTCAGTATGTCTGCGGGGACAGCTGAAATGGCGAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGt < 1:429/173‑1 (MQ=255) ttcGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCa > 1:715769/1‑213 (MQ=255) ggACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCca > 1:459155/1‑231 (MQ=255) gAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagc > 2:225913‑M2/1‑149 (MQ=255) gAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagc < 1:225915‑M2/154‑6 (MQ=255) gCTAGCAACCCTGTGGATGTCTTGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCggg < 2:504839/214‑1 (MQ=255) aaCCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCaa < 1:798952/235‑1 (MQ=255) aTGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGcc > 1:657170/1‑195 (MQ=255) aTGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCAc < 2:790794/221‑1 (MQ=255) aTGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCAc > 1:790796/1‑221 (MQ=255) aaCTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCa > 1:361024/1‑235 (MQ=255) ttCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATa < 1:698816/235‑1 (MQ=255) tACCGCTGGACTATTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAggg < 1:500981/207‑1 (MQ=255) aCTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGcc < 1:153201/208‑1 (MQ=255) tGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGcc < 2:453858/203‑1 (MQ=255) cAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCg > 2:556205/1‑226 (MQ=255) cAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGa > 1:299889/1‑236 (MQ=255) cgctgcgcCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtc > 2:449632‑M2/1‑73 (MQ=255) gcCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCaa < 2:518385/166‑1 (MQ=255) gCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAACGCTCGACTACAt < 1:128357/236‑1 (MQ=255) cGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcgg > 1:109624‑M2/1‑60 (MQ=255) cGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcgg < 2:109623‑M2/96‑37 (MQ=255) aCAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAACg < 2:361022/221‑1 (MQ=255) gcgagcgGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgcccaccatga < 2:483946‑M2/112‑58 (MQ=255) cgagcgGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCAc < 2:123837/148‑1 (MQ=255) gCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCCGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAACGCTCGACTACATGGACGCCCAccc < 2:432837/234‑1 (MQ=255) gCTGGCCAGGTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAACGCt < 1:157544/213‑1 (MQ=255) ccAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAACGCTCGACTACATGGACGCCCACCCGGa < 2:368662/232‑1 (MQ=255) ttACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCt < 2:561867/173‑1 (MQ=255) gACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAACGCTCGACTACATGGACGCCCACCCGGAGTGCGGCGTACTgggg > 1:510435/1‑231 (MQ=255) gACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAACGCTCGACTACATGGACGCCCACCCGGAGTGCGGCGTACTGGGGGTg > 2:304460/1‑234 (MQ=255) aaTGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAACGCTCGACTACATGGACGCCCACCCGGAGt < 1:467952/214‑1 (MQ=255) ccTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGttgttg < 2:690758/107‑1 (MQ=255) gcgcgATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAACGcg > 2:646513/1‑179 (MQ=255) | GCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACC‑GTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAACGCTCGACTACATGGACGCCCACCCGGAGTGCGGCGTACTGGGGGTG > AE015451/3550766‑3551202 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |