New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 4703277 | 30 (0.690) | 4 (0.100) | 4/324 | NT | 13.0% | coding (183/2055 nt) | kdpB | K+ transporting ATPase, KdpB subunit |
? | AE015451 | = 4703801 | 25 (0.600) | coding (1363/1695 nt) | kdpA | potassium‑transporting ATPase A chain |
GTACCACGTCGTCCTTGCGCAGCGCGCTGGCAGCCACCGTCTCGTAGCTGCCATCACGCAGACGACGCTGGGCGGTCAGGCCCTGGCTGCCGGCCTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGATCGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGG > AE015451/4703051‑4703509 | gTACCACGTCGTCCTTGCGCAGCGCGCTGGCAGCCACCGTCTCGTAGCTGCCATCACGCAGACGACGCTGGGCGGTCAGGCCCTGGCTGCCGGCCTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGc < 1:690269/236‑1 (MQ=255) tACCACGTCGTCCTTGCGCAGCGCGCTGGCAGCCACCGTCTCGTAGCTGCCATCACGCAGACGACGCTGGGCGGTCAGGCCCTGGCTGCCGGCCTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGc < 1:545964/235‑1 (MQ=255) gcgcTGGCCGCCACCGTCTCGTAGCTGCCATCGCGCAGACGACGCTGGGCGGTCAGGCCCTGGCTGCCGGCCTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAg < 1:122393/236‑1 (MQ=255) gcgcTGGCAGCCACCGTCTCGTAGCTGCCATCACGCAGACGACGCTGGGCGGTCAGGCCCTGGCTGCCGGCCTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAac < 2:559773/208‑1 (MQ=255) cACCGTCTCGTAGCTGCCATCACGCAGACGACGCTGGGCGGTCAGGCCCTGGCTGCCGGCCTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCgg < 1:330430/221‑1 (MQ=255) gTAGCGGCCATCACGCAGACGACGCTGGGCGGTCAGGCCCTGGCTGCCGGCCTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGc < 2:667215/193‑1 (MQ=255) cTGCCATCACGCAGACGACGCTGGGCGGTCAGGCCCTGGCTGCCGGCCTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGa > 1:674998/1‑236 (MQ=255) ccATCACGCAGACGACGCTGGGCGGTCAGGCCCTGGCTGCCGGCCTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGa > 2:741176/1‑178 (MQ=255) cGCAGACGACGCTGGGCGGTCAGGCCCTGGCTGCCGGCCTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGaa < 1:647774/173‑1 (MQ=255) aGGCCCTGGCTGCCGGCCTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAg < 1:91393/207‑1 (MQ=255) gCCGGCCTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAg > 2:91392/1‑147 (MQ=255) ccGGCCTGGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGgcgtgag < 1:223240‑M1/145‑8 (MQ=255) gggtcTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCGCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAg < 1:21690/190‑1 (MQ=255) ggCCTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCa < 1:207754/236‑1 (MQ=255) gTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGaa < 1:397691/126‑1 (MQ=255) gcgcGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGTCCACCACCAGCAt > 2:569508/1‑167 (MQ=255) ccAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGcatggtttcagccagttg < 2:781009‑M1/113‑19 (MQ=255) ccAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGcatggtttcagccagttg > 1:781011‑M1/1‑95 (MQ=255) cAACGCCTCGGCGAAGTTAGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCggg > 1:625617/1‑202 (MQ=255) ccTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTg > 1:14491/1‑184 (MQ=255) ccTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTg < 2:14491/184‑1 (MQ=255) gcGGCGAAGGTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACggt < 2:11301/100‑1 (MQ=255) cacGGTGAACCACAGCCGCAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTg < 1:256261/208‑1 (MQ=255) ggTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATg < 1:699702/235‑1 (MQ=255) agccacagGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTGGGCACTGTGCCgg > 1:252277/1‑207 (MQ=255) agccacagGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGGCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCAt > 1:458219/1‑236 (MQ=255) cacagGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGAt > 1:215093/1‑236 (MQ=255) cAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGcatggtttcagccagttgctgtacgcctatacctcgg > 2:797716‑M1/1‑44 (MQ=255) cAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGcatggtttcagccagttgctgtacgcctatacctcgg < 1:797718‑M1/81‑38 (MQ=255) tCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGATCGGTCCTCaa > 1:547640/1‑236 (MQ=255) cTGCACCGCGACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGa < 1:241998/164‑1 (MQ=255) cTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATg < 1:169405/211‑1 (MQ=255) gCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGATCGGTCCTCaaa > 2:305733/1‑234 (MQ=255) cACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCt < 1:631528/192‑1 (MQ=255) cGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGATCGGTCCTCAAAAACCCAAGCTa > 1:448975/1‑236 (MQ=255) aTGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCGTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACg > 2:82373/1‑111 (MQ=255) aCGCCGCCGCCGGGGGGGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGGCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATg < 2:743685/189‑1 (MQ=255) aCGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGATCGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGc < 1:298135/236‑1 (MQ=255) cgccgGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGATCGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGc < 1:803385/236‑1 (MQ=255) ggCGcatggtttcagccagttgctgtacgcctatacctcgggctcggccaacaacggctcggcctttgccgggtttggcgccaacaccgtgtaccacaacctgatgatcggcctggccatgctcatcggccgcttcggctacatcctgccgatactggcgttggccggcagcctggcggcgaaaaaaagcgcgccgctggggcagaacagcttcccgactcacggcccgctgttca > 1:725326‑M1/1‑4 (MQ=255) | GTACCACGTCGTCCTTGCGCAGCGCGCTGGCAGCCACCGTCTCGTAGCTGCCATCACGCAGACGACGCTGGGCGGTCAGGCCCTGGCTGCCGGCCTTGAGGCTGTCGGCGCGGGCCTTGCCACGGCCTTCGGCCAACGCCTCGGCGAAGTTGGCGAACAACACGGTGAACCACAGCCACAGGGCAATCTGCACCGCAACGCCGATGCTCACGCCGCCGCCGGGGGCGAAACACAGCACGGTGGTCAGCACCGCGGTCAGGGCCACCACCAGCATTACCGGGGAGCGCTTGAGCTGACGCGGGTCGAGCTTGACGAACGCCTGCACCAGCGCCGGGCGCCACAGCGCGGCGAAGCGGGTCTGGTCCTTGGCACTGTGCCGGCTATTCACTTCAGGAATGGGCATGTTCATGATCGGTCCTCAAAAACCCAAGCTAAGGTGTTCGGCGATTGGCCCAAGGG > AE015451/4703051‑4703509 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |