New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 5141269 | 38 (0.870) | 3 (0.070) | 3/326 | NT | 6.6% | coding (293/894 nt) | PP_4525 | Transcriptional regulator, LysR family |
? | AE015451 | = 5141314 | 49 (1.180) | coding (248/894 nt) | PP_4525 | Transcriptional regulator, LysR family |
ATCGCACAGCGGCACGCCATCCAGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGATGGCACCCGGTGCAGGCGCTCTGCGGCGCGGGTAACCGAGCCCTCCTCGG > AE015451/5141082‑5141524 | aTCGCACAGCGGCACGCCATCCAGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACgc > 1:692823‑M2/1‑233 (MQ=255) tCGCACAGCGGCACGCCATCCAGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACgca < 1:348192‑M2/235‑4 (MQ=255) cGCCATCCAGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCAGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAgc < 2:492663/233‑1 (MQ=255) gCCATCCAGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCt < 1:411007/235‑1 (MQ=255) tCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACg < 1:188925‑M2/199‑2 (MQ=255) ggTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACg > 1:285652/1‑236 (MQ=255) caTCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCAc < 1:433747/235‑1 (MQ=255) aTCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCt < 1:617828/236‑1 (MQ=255) gtgtGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGa < 2:502750/200‑1 (MQ=255) gtgtGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGa > 1:502752/1‑200 (MQ=255) ttCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCCGACATACGGTTGGCATAGTCcag > 1:377530/1‑215 (MQ=255) aGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTg > 1:506896/1‑236 (MQ=255) cccTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAg > 2:536842/1‑202 (MQ=255) cAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCAt > 2:721097/1‑195 (MQ=255) cAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCg > 2:385906/1‑222 (MQ=255) cTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGAc < 2:777125/233‑1 (MQ=255) ggCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCATGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGcc > 2:742522/2‑233 (MQ=255) ccTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCctgct < 1:449602/176‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCctgct > 2:449600/1‑176 (MQ=255) tGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGAc < 1:483071/196‑1 (MQ=255) tGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGAc > 2:483069/1‑196 (MQ=255) tGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGtt > 2:295278/1‑199 (MQ=255) tGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGgc < 1:65427/235‑1 (MQ=255) ggTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGAc < 1:57740/183‑1 (MQ=255) tAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGgc > 2:388104/1‑172 (MQ=255) tAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGa > 1:457505/1‑236 (MQ=255) tAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGAACGGCGCCCAGCGCAtcgt > 2:334484/1‑106 (MQ=255) cgcCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGccc < 1:295280/199‑1 (MQ=255) gcCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGt > 1:136528/1‑235 (MQ=255) cAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTg < 1:420885/236‑1 (MQ=255) gCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACgcacggcggcgacccacttgccggcgttgctggcgcgctatcaccagtcttacccgcagg > 1:643414‑M2/1‑70 (MQ=255) gCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACgcacggcggcgacccacttgccggcgttgctggcgcgctatcaccagtcttacccgcagg < 2:643412‑M2/130‑61 (MQ=255) gCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGATGGc < 2:752758/234‑1 (MQ=255) cGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGCTCAACGCCCAGCTGctcctc > 1:231805/1‑198 (MQ=255) tGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGATGGCACCCGGTGCAg < 1:575611/236‑1 (MQ=255) gggTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATAc > 2:163708/1‑99 (MQ=255) ggTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGt < 1:536844/207‑1 (MQ=255) gcccccGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAACTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGAc < 2:721563/148‑1 (MQ=255) tGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGATGGCACCCGGTGCAGGCGCTCTGCGGCGCGGGTAAcc < 1:15813/236‑1 (MQ=255) gTCCCCAGCCCGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGATGGCACCCGGTGCAGGCGCTCTGCGGCGCGGGTAAcc < 2:567160/234‑1 (MQ=255) ccccAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGATGGCACCCGGTGCAGGCGCTCTGCGGCGCGGGTAACCGAGc > 1:280342/1‑236 (MQ=255) ccAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACgcacggcggcgacccacttgccggcgttgctggcgcgctatcaccagtcttacccgcaggtgaacct > 1:476517‑M2/1‑33 (MQ=255) ccAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTg > 1:255288/1‑182 (MQ=255) ccAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGAGGGCACCCGGTGCAGGCGCTCTGCGGCGCGGGCAACCGAGcc > 1:175670/1‑235 (MQ=255) gCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCCGGCGCTGACGTTCGCGCAGGCACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCCAGTTGGCGCAGGCGCGTGGACAGGt > 2:37522/1‑186 (MQ=255) gCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGATGGCACCCGGTGCAGGCGCTCTGCGGCGCGGGTAACCGAGCcctc > 1:369885/1‑235 (MQ=255) aCGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGATGGCACCCGGTGCAGGCGCTCTGCGGCGCGGGTAACCGAGCCctcctc > 1:714948/1‑236 (MQ=255) gAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGATGGCACCCGGTGCAGGCGCTCTGCGGCGCGGGTAACCGAGCCCTCCTCgg < 1:141750/236‑1 (MQ=255) aaGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGa > 2:292618/1‑185 (MQ=255) aGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCCCCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCa < 1:94196/137‑1 (MQ=255) ccccAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACAt > 2:218567/1‑58 (MQ=255) ccccAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGGTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGATgg > 1:130442/1‑184 (MQ=255) gCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGac > 1:696141/1‑167 (MQ=255) gACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGATGGCACCCGGTGCAGGCGCTCTGCGGCGCGAGTAACCGAGCcctc > 2:477026/1‑214 (MQ=255) cGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGATGGCACCCGGTGCAGGCGCTCTgc < 2:136526/190‑1 (MQ=255) | ATCGCACAGCGGCACGCCATCCAGCCCGGCAAGGCTCGGTGGCCCGTCCACAAGAGCAGCATCCAGGGTGTGGTTCAACAGCCCTTCAAGCAACTCGCCGCTGGGTGCTGCACGCACTTGCAGGTTCACCTGCGGGTAAGACTGGTGATAGCGCGCCAGCAACGCCGGCAAGTGGGTCGCCGCCGTGCTGTACATGGTCCCCAGCACGAAGTCCCCAGCCGGCTGACCGCCACGCACGGCGCCCAGCGCTTCGTCGCGCAAGGCGGACATACGGTTGGCATAGTCCAGCAGCACCTTGCCTGCTGGCGACAGTTGCAGGCGCTGACGTTCGCGCAGGAACAGTTCAACGCCCAGCTGCTCCTCGAGTTGGCGCAGGCGCGTGGAAAGGTTTGATGGCACCCGGTGCAGGCGCTCTGCGGCGCGGGTAACCGAGCCCTCCTCGG > AE015451/5141082‑5141524 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |