New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 5819873 | 45 (1.030) | 3 (0.070) | 3/324 | NT | 6.6% | coding (313/591 nt) | PP_5096 | putative factor involved in shape determination |
? | AE015451 | = 5819909 | 42 (1.020) | coding (349/591 nt) | PP_5096 | putative factor involved in shape determination |
CCGCTGTGCCAGTTCGCCGTTCGTGCCACCCAACCGCTGCTCAAGCCGATCCGCCGGATCATCCCTAGCGTTGGCGGGCTGGATACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCGTTTGTCATGCCCCCGCTGGCCGCCTACGCCGGCATGC > AE015451/5819675‑5820125 | ccGCTGTGCCAGTTCGCCGTTCGTGCCACCCAACCGCTGCTCAAGCCGATCCGCCGGATCATCCCTAGCGTTGGCGGGCTGGATACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCGTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGc > 1:436672‑M2/1‑235 (MQ=255) tCGCCGTTCGTGCCACCCAACCGCTGCTCAAGCCGATCCGCCGGATCATCCCTAGCGTTGGCGGGCTGGATACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCa < 1:346018/234‑1 (MQ=255) gcccACCCGCTGCTCAAGCCGATCCGCCGGATCATCCCTGGCGGTGGCGGGCTGGATACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGCTTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTg < 2:634284/224‑1 (MQ=255) ccGCTGCTCAAGCCGATCCGCCGGATCATCCCTAGCGTTGGCGGGCTGGATACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTg < 1:349904/235‑1 (MQ=255) cGCTGCTCAAGCCGATCCGCCGGATCATCCCTAGCGTTGGCGGGCTGGATACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGGGATCGTTTCCTGGGTTGCa > 1:240126/1‑236 (MQ=255) tCCGCCGGATCATCCCTATCGTTGGCGGGCTGGTTACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTTTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTg < 2:446329/203‑1 (MQ=255) cgGATCATCCCTAGCGTTGGCGGGCTGGATACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCcgg < 1:613883/235‑1 (MQ=255) ccTAGCGTTGGCGGGCTGGATACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCGCCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGcga > 1:138465‑M2/1‑172 (MQ=255) gggCTGGATACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGcgatgatcg < 1:722390‑M2/169‑10 (MQ=255) gggCTGGATACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACGCAACAGACACAACCCGGCGGCCGCACTgg > 1:166777/1‑226 (MQ=255) gggCTGGATACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGAt > 1:143695/1‑236 (MQ=255) gggCTGGATACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGAGGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTAGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAGACCGGCGTCCGAACTGGCCTACCAg > 2:760587/1‑234 (MQ=255) gATACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACAGCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGt > 2:346139/1‑164 (MQ=255) tcgtggCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTGTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCGGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTggg < 2:234030/178‑1 (MQ=255) cgtcgCTCCGGCGGGCGGGTGTCATCCAGGCCTGGCTGATGGACTTTGGGCTGATGGTCGCCTACGGTACCTTCGGCGCCGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGt < 2:221765/169‑1 (MQ=255) ggcgCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTGGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGttt < 2:104078/168‑1 (MQ=255) gCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGt > 2:297602/1‑231 (MQ=255) ttGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATc < 1:613218/235‑1 (MQ=255) tGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTccgccg > 1:60676/1‑220 (MQ=255) ggCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCCCCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTg < 1:241564/223‑1 (MQ=255) tGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGCTCAg > 2:4189/1‑190 (MQ=255) tGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGt > 1:8051/1‑236 (MQ=255) tGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTCGCCTAcac > 1:729455/1‑182 (MQ=255) gATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATg > 2:763511/1‑124 (MQ=255) cTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCgggg > 2:478633/1‑191 (MQ=255) tgtgCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGcgatgatcgcccacatcagcaggtgcaggacgtcgccgaaggtaccgtaggtgaccatcagcaca > 1:426973‑M2/1‑101 (MQ=255) tGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGCCGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATc < 2:640303/216‑1 (MQ=255) cTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGcgatgatcgcccacatcagcaggtgcaggacgtcgccgaaggaaccgtaggtgacatcagcacaaagcccatcagcaaggcctggatgaccaccgc < 1:757811‑M2/182‑97 (MQ=255) cTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCg > 1:703761/1‑236 (MQ=255) ttCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGc < 1:622382/236‑1 (MQ=255) tCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTggg > 1:590273/1‑199 (MQ=255) ggCGACGTCCTGCGCCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGCGCTGGCGCCGTTCCGCAGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGAt > 1:494333/1‑236 (MQ=255) ggCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGc < 1:758381/233‑1 (MQ=255) ggCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGc > 2:758379/1‑233 (MQ=255) ggCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGc > 2:622380/1‑233 (MQ=255) cGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCCGGCggt > 1:19306/1‑232 (MQ=255) gTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCAGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCATCCTGGCGATCCAgg > 1:759531/1‑235 (MQ=255) ccTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCGggtg > 1:207013/1‑235 (MQ=255) cTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCt > 2:769983/1‑221 (MQ=255) ccTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGcgatgatcgcccacatcagcaggtgcaggacgtcgccgaaggaaccgtaggtgacatcagcacaaagcccatcagcaaggcctggatgaccaccgccagcagtagcgacgaggtatccagccc > 2:757809‑M2/1‑59 (MQ=255) gATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGTACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGTCCTACCAGAt > 2:435115/1‑129 (MQ=255) gATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCGCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCGTTTg > 1:560633/1‑236 (MQ=255) gATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGCTTCCTGGGTTGCACCCAACACCcacacc > 2:728775/1‑101 (MQ=255) tcatcGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCGCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCg > 1:593233/1‑221 (MQ=255) tcGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAg > 2:348112/1‑206 (MQ=255) cACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGt < 2:1326/144‑1 (MQ=255) cGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCGTTTGTCATGCCCCCGCTGGCCGCCTACGc > 1:394031/1‑235 (MQ=255) ttCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCGTTTGTCATGCCCCCGCTGGCCGCCTACGCCGGCa > 1:661508/1‑235 (MQ=255) cTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCGTTTGTCATGCCCCCGCTGGCCGCCTACGCCGGCATGc > 1:531483/1‑235 (MQ=255) gAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGCTCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGt > 2:210264/1‑194 (MQ=255) aaGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGAt < 2:17378/35‑1 (MQ=255) | CCGCTGTGCCAGTTCGCCGTTCGTGCCACCCAACCGCTGCTCAAGCCGATCCGCCGGATCATCCCTAGCGTTGGCGGGCTGGATACCTCGTCGCTACTGCTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCGTTTGTCATGCCCCCGCTGGCCGCCTACGCCGGCATGC > AE015451/5819675‑5820125 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |