New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2748791 = | 26 (1.010) | 3 (0.120) | 3/300 | NT | 12.4% | coding (66/276 nt) | PP_2404 | conserved exported protein of unknown function |
? | AE015451 | 2748910 = | 18 (0.740) | coding (185/276 nt) | PP_2404 | conserved exported protein of unknown function |
CCCTTGCCTGCGGGAGTTTGTATTGCAGTGTATCTGGCACGGGTAGGGATACAGCAGGAGGCACATCACAACGTTGGGCGACACATGCGGGATACCTGGCTGACGTGAAATGGTTCTCGACCGGGGAGCAACACTCCTCACACCCAAGTGTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGA > AE015451/2748558‑2748982 | aggggcggcgaattcaaccactggctggcgcccgccagcgatggcatggcgccgtagctgtcgcgtgccttcaggtgcccagccaacccaagccccgtcagcgccagcgcaaaaccaccggccttgagcatccggcgccgatcagttttcatggcaaccgtccgtggcataggtgaggtactgcacgctttgccgctggccatgggagtcaaggtagtccattcgggtattcaCCa < 1:126513‑M1/3‑1 (MQ=255) aGTGTAGCTGGCACGGGTAGGGATACAGCAGGAGGCACATCACAACGTTGGGCGACCCATGCGGGATACCTGGCTGACGTGAAATGGTTCTCGACCGGGGAGCAACACTCCTCACACCCAAGTGTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATg < 1:78420/236‑1 (MQ=255) tACAGCAGGAGGCACATCACAACGTTGGGCGACACATGCGGGATACCTGGCTGACGTGAAATGGTTCTCGACCGGGGAGCAACACTCCTCACACCCAAGTGTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTAc < 1:129279/236‑1 (MQ=255) aggaggCACATCACAACGTTGGGCGACACATGCGGGATACCTGGCTGACGTGAAATGGTTCTCGACCGGGGAGCAACACTCCTCACACCCAAGTGTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACt > 1:318078/1‑191 (MQ=255) aggaggCACATCACAACGTTGGGCGACACATGCGGGATACCTGGCTGACGTGAAATGGTTCTCGACCGGGGAGCAACACTCCTCACACCCAAGTGTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCa > 2:338475/1‑202 (MQ=255) acaACGTTGGGCGACACATGCGGGATACCTGGCTGACGTGAAATGGTTCTCGACCGGGGAGCAACACTCCTCACACCCAAGTGTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTAc < 1:451552/218‑1 (MQ=255) acaACGTTGGGCGACACATGCGGGATACCTGGCTGACGTGAAATGGTTCTCGACCGGGGAGCAACACTCCTCACACCCAAGTGTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGAtgt > 1:337580/1‑235 (MQ=255) caTGCGGGATACCTGGCTGACGTGAAATGGTTCTCGACCGGGGAGCAACACTCCTCACACCCAAGTGTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTc < 2:337576/234‑1 (MQ=255) aCGTGAAATGGTTCTCGACCGGGGAGCAACACTCCTCACACCCAAGTGTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCaa < 1:509730/236‑1 (MQ=255) cGTGAAATGGTTCTCGACCGGGGAGCAACACTCCTCACACCCAAGTGTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGa < 2:419123/201‑1 (MQ=255) ggggAGCAACACTCCTCACACCCAAGTGTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTg > 1:375442/1‑229 (MQ=255) aGCAACACTCCTCACACCCAAGTGTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGGCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTg > 1:42462/1‑171 (MQ=255) gtTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATg < 2:318074/124‑1 (MQ=255) gtTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCCGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCAt < 1:485216/235‑1 (MQ=255) gtTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGAAGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGACg > 2:375404/1‑169 (MQ=255) gCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCg < 1:338479/235‑1 (MQ=255) aaCCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCgg > 2:304918/1‑148 (MQ=255) aaCCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGc > 1:297491/1‑170 (MQ=255) aaGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAgc < 2:406446/157‑1 (MQ=255) tATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGGTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATg < 2:44038/73‑1 (MQ=255) cgctttgccgctggccatgggagtcaaggtagtccattcgggtattcaCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATa < 1:470310‑M1/125‑1 (MQ=255) ccagcgccagcCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTg < 1:441760/60‑1 (MQ=255) ccagcgccagcCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTg > 2:441756/1‑60 (MQ=255) gcgccagcCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCacgga > 1:422680/1‑235 (MQ=255) cgccagcCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGa < 1:292236/69‑1 (MQ=255) cgctggccatgggagtcaaggtagtccattcgggtattcaCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATg < 1:232976‑M1/152‑1 (MQ=255) accGTGCTGGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATAcc < 2:370675/155‑1 (MQ=255) gTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCCGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGc < 2:402142/121‑1 (MQ=255) tGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTCCGGTGAGCCTCTGGATGGGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGCTGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTgg > 2:27911/1‑131 (MQ=255) ggtattcaCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCacgga < 2:126509‑M1/192‑1 (MQ=255) | CCCTTGCCTGCGGGAGTTTGTATTGCAGTGTATCTGGCACGGGTAGGGATACAGCAGGAGGCACATCACAACGTTGGGCGACACATGCGGGATACCTGGCTGACGTGAAATGGTTCTCGACCGGGGAGCAACACTCCTCACACCCAAGTGTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGA > AE015451/2748558‑2748982 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |