New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2748791 = | 26 (1.010) | 3 (0.120) | 3/300 | NT | 12.4% | coding (66/276 nt) | PP_2404 | conserved exported protein of unknown function |
? | AE015451 | 2748910 = | 18 (0.740) | coding (185/276 nt) | PP_2404 | conserved exported protein of unknown function |
GTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCTCAAGGCCGGTGGTTTTGCGCTGGCGCTGACGGGGCTTGGGTTGGCTGGGCACCTGAAGGCACGCGACAGCTACGGCGCCATGCCATCGCTGGCGGGCGCCAGCCAGTGGTTGAATTCGCCGCCCCT > AE015451/2748707‑2749142 | gtTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCCGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCAt < 1:485216/235‑1 (MQ=255) tccgtggcataggtgaggtactgcacgctttgccgctggccatgggagtcaaggtagtccattcgggtattcaccaggccgcaggcattgcgctgatcatcctgcaccgacagcactctcttcacatccagaggctcaccgtagcggtactgcatgaccccgccatcctgcatcggggcagtggcggcctggTGAATAcc < 2:126509‑M2/8‑1 (MQ=255) gCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCg < 1:338479/235‑1 (MQ=255) cgctttgccgctggccatgggagtcaaggtagtccattcgggtattcaCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATa < 1:470310‑M1/125‑1 (MQ=255) gcgccagcCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCacgga > 1:422680/1‑235 (MQ=255) cgctggccatgggagtcaaggtagtccattcgggtattcaCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATg < 1:232976‑M1/152‑1 (MQ=255) catgggagtcaaggtagtccattcgggtattcaccaggccgcaggcattgcgctgatcatcctgcaccgacagcactctcttcacatccagaggctcaccgtagcggtactgcatgaccccgccatcctgcatcggggcagtggcggcctggTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCg < 1:232976‑M2/40‑1 (MQ=255) accGTGCTGGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATAcc < 2:370675/155‑1 (MQ=255) ggtattcaCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCacgga < 2:126509‑M1/192‑1 (MQ=255) tattcaccaggccgcaggcattgcgctgatcatcctgcaccgacagcactctcttcacatccagaggctcaccgtagcggtactgcatgaccccgccatcctgcatcggggcagtggcggcctggTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCg < 1:470310‑M2/48‑1 (MQ=255) CAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGcc > 2:375438‑M1/1‑218 (MQ=255) CGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCCCAAGGCCggtgg < 1:514063‑M1/232‑1 (MQ=255) gATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCg < 2:345172/149‑1 (MQ=255) gaGGATGGCGGGGTCATGCAGGACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCg < 1:266479/144‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCTCAAGGCCGGTGGTTTTGCGCTGGCGCTGACgg > 1:454281/1‑236 (MQ=255) ggTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCTCAAGGCCGGTGGTTTTgcgct > 2:425292/1‑214 (MQ=255) cTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCTCAAGGCCGGTGGTTTTGCGCTGGCGCTGACGGGGCTTGGGTTGGCTGGGCACCTGa < 2:454277/234‑1 (MQ=255) aGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCTCAAGGCCggtg > 1:328148/1‑181 (MQ=255) gtgAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCTCAAGGCCGGTGGTTTTGCGCTGGCGCTGACGGGGCTTGGGTTGGCTGGGCACCTGAAGGCACGCGACAGCTACgg > 1:130577/1‑234 (MQ=255) tGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCTCAAGGCCGGTGGTTTTGCGCTGGCGCTGACGGGGCTTGGGTTGGCTGGGc > 2:169764/1‑199 (MQ=255) gCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCTCAAGGCCGGTGGTTTTGCGCTGGCGCTGACGGGGCTTGGGTTGGCTGGGCACCTGAAGGCACGCGACAGCTACGGCGCCATGCCATCg > 1:267941/1‑236 (MQ=255) cGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCTCAAGGCCGGTGGTTTTGCGCTGGCGCTGACGGGGCTTGGGTTGGCTGGGCACCTGAAGGCACGCGACAGCTACGGCGCCATGCCATCGCTgg > 1:332630/1‑235 (MQ=255) gatCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCTCAAGGCCGGTGGTTTTGCGCTGGCGCTGACGGGGCTTGGGTTGGCTGGGCACCTGAAGGCACGCGACAGCTACGGCGCCATGCCATc > 1:508133/1‑219 (MQ=255) gcgcAATGCCTGCGGCCTGGTGAATAccc > 2:468767/1‑29 (MQ=255) gcgcAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCTCAAGGCCGGTGGTTTTGCGCTGGCGCTGACGGGGCTTGGGTTGGCTGGGCACCTGAAGGCACGCGACa > 1:274435/1‑195 (MQ=255) aaTGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCACACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCTCAAGGCCGGTGGTTTTGCGCTGGCGCTGACGGGGCTTGGGTTGGCTGGGCACCTg > 1:13387/1‑178 (MQ=255) tggTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCTCAAGGCCGGTGGTTTTGCGCTGGCGCTGACGGGGCTTGGGTTGGCTGGGCACCTGAAGGCACGCGACAGCTACGGCGCCATGCCATCGCTGGCGGGCGCCAGCCAGTGGTTGAATTCGCCGCCCCt < 1:126513‑M2/233‑1 (MQ=255) | GTTACCCAGGAGAGAAGCCATGAACCTCAAGACTATCGCCAGCGCCAGCCTGTTCGCCGTGCTCGGCTTCGGTGCCATCGCCGCCCAGGCCGCCACTGCCCCGATGCAGGATGGCGGGGTCATGCAGTACCGCTACGGTGAGCCTCTGGATGTGAAGAGAGTGCTGTCGGTGCAGGATGATCAGCGCAATGCCTGCGGCCTGGTGAATACCCGAATGGACTACCTTGACTCCCATGGCCAGCGGCAAAGCGTGCAGTACCTCACCTATGCCACGGACGGTTGCCATGAAAACTGATCGGCGCCGGATGCTCAAGGCCGGTGGTTTTGCGCTGGCGCTGACGGGGCTTGGGTTGGCTGGGCACCTGAAGGCACGCGACAGCTACGGCGCCATGCCATCGCTGGCGGGCGCCAGCCAGTGGTTGAATTCGCCGCCCCT > AE015451/2748707‑2749142 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |