New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 4535670 = | 24 (0.930) | 3 (0.120) | 3/302 | NT | 13.1% | intergenic (+197/‑618) | PP_4022/PP_4024 | conserved protein of unknown function/transposase |
? | AE015451 | 4535721 = | 17 (0.690) | intergenic (+248/‑567) | PP_4022/PP_4024 | conserved protein of unknown function/transposase |
AACAAATTAACCAGAACGCAAAAGGGAAACTGAAGCACGCAATCGGGCATATCGGACACTGACAGTGGCTGCTTGATGGCATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCGT > AE015451/4535441‑4535852 | ccgaacaacaggtagatgccacaggcgaagacgatcactggcagcatcttgttcagccattcggctggcatgtagtgggcgatgacggcgccgagcgacgccccggtcagggtggcgaacaatgccgggcgccactgcgccggatggaacagtttgcgtttgtagtaggtgaaacctgcagtggccgagccgaaggtggaactgagcttgttggtgcccagtaccaggtgcggcg < 1:309906‑M1/6‑1 (MQ=255) ttAACCAGAACGCAAAAGGGAAACTGAAGCACGCAATCGGGCATATCGGACACTGACAGTGGCTGCTTGATGGCATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCt < 1:263580/236‑1 (MQ=255) aaaaGGGAAACTGAAGCACGCAATCGGGCATATCGGACACTGACAGTGGCTGCTTGATGGCATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCt < 2:368221/223‑1 (MQ=255) aGGGAAACTGAAGCACGCAATCGGGCATATCGGACACTGACAGTGGCTGCTTGATGGCATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTcacca < 2:314437/225‑1 (MQ=255) aGCACGCAATCGGGCATATCGGACACTGACAGTGGCTGCTTGATGGCATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACt < 1:432681/216‑1 (MQ=255) tggcagcatcctgtccagccattcggctggcatgtagtgggcgatgacggcgccgagcgacgccccggtcagggtggcgaacaatgccgggcgccactgcgccggatggaacagtttgcgtttgtagtaggtgaaacctgcagtggccgagccgaaggtggaactgagcttgttggtgcccagtaccaggtgcgg > 2:435826‑M1/192‑195 (MQ=255) tCGGGCATATCGGACACTGACAGTGGCTGCTTGATGGCATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTggcggcg < 1:328520/193‑1 (MQ=255) tCGGGCATATCGGACACTGACAGTGGCTGCTTGATGGCATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTggcggcg > 2:328516/1‑193 (MQ=255) tgttcagccattcggctggcatgtagtgggcgatgacggcgccgagcgacgccccggtcagggtggcgaacaatgccgggcgccactgcgccggatggaacagtttgcggttgtagtaggtgaaacctgcagtggccgagccgaaggtggaactgagcttgttggtgcccagtaccaggtGcggcgg < 1:72686‑M1/7‑1 (MQ=255) ggACACTGACAGTGGCTGCTTGATGGCATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGt < 2:349345/234‑1 (MQ=255) ttGATGGCATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTAACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTTGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTggctgcgg > 2:201684/1‑164 (MQ=255) ctGATGGTATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATgcc < 1:237441/202‑1 (MQ=255) gATGGCATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGCTGGCGGCGGCCTGc > 2:74032/1‑167 (MQ=255) agcCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATgcc < 1:517748/162‑1 (MQ=255) aaCTGCCTGAAGCCTCCCAGGCTCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTGACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATGCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGccc < 2:35590/136‑1 (MQ=255) gCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCa < 2:124332/197‑1 (MQ=255) aTGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGgcg > 1:345829/1‑234 (MQ=255) cGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCCCCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGgcg > 1:16538/1‑226 (MQ=255) aCCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCa > 1:385084/1‑236 (MQ=255) aCCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGt < 1:514464/223‑1 (MQ=255) aCCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGt > 2:514460/1‑223 (MQ=255) tcATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGc > 2:388011/1‑220 (MQ=255) aaccTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCTCTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTtcggctc > 2:287662/3‑146 (MQ=255) aTCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTg < 1:62495/81‑1 (MQ=255) aTCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTg > 2:62492/1‑81 (MQ=255) aTCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCGt > 1:329833/1‑235 (MQ=255) gtggccgagccgaaggtggaactgagcttgttggtgcccagtaccaggtGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTGCGGCTCGGCCACTGCAGGGTTCACCTACTACAAACGCAAAc < 2:280542‑M1/129‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCg > 1:11506/1‑231 (MQ=255) tggccgagccgaaggtggaactgagcttgttggtgcccagtaccaggtGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCCCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCCCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTg < 2:207422‑M1/102‑1 (MQ=255) accaggtGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCttcggcc < 2:475547‑M1/93‑2 (MQ=255) | AACAAATTAACCAGAACGCAAAAGGGAAACTGAAGCACGCAATCGGGCATATCGGACACTGACAGTGGCTGCTTGATGGCATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCGT > AE015451/4535441‑4535852 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |