New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 4535670 = | 24 (0.930) | 3 (0.120) | 3/302 | NT | 13.1% | intergenic (+197/‑618) | PP_4022/PP_4024 | conserved protein of unknown function/transposase |
? | AE015451 | 4535721 = | 17 (0.690) | intergenic (+248/‑567) | PP_4022/PP_4024 | conserved protein of unknown function/transposase |
GGACACTGACAGTGGCTGCTTGATGGCATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCGTCGCTCGGCGCCGTCATCGCCCACTACATGCCAGCCGAATGGCTGAACAAGATGCTGCCAGTGATCGTCTTCGCCTGTGGCATCTACCTGTTGTTCGG > AE015451/4535494‑4535949 | ggACACTGACAGTGGCTGCTTGATGGCATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGt < 2:349345/234‑1 (MQ=255) gCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCa < 2:124332/197‑1 (MQ=255) aTGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGgcg > 1:345829/1‑234 (MQ=255) cGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCCCCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGgcg > 1:16538/1‑226 (MQ=255) gtttgcgtttgtagtaggtgaaccctgcagtggccgagccgcaggtggaactgagcttgttggtgcccagtaccaggtgcggcggcatgccggcagtgagcagggccggagtggtgagcaggccgccgcACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCAc < 2:280542‑M2/49‑1 (MQ=255) aCCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCa > 1:385084/1‑236 (MQ=255) aCCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGt > 2:514460/1‑223 (MQ=255) aCCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGt < 1:514464/223‑1 (MQ=255) tcATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGc > 2:388011/1‑220 (MQ=255) aaccTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCTCTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTtcggctc > 2:287662/3‑146 (MQ=255) aTCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCGt > 1:329833/1‑235 (MQ=255) cagtggccgagccgaaggtggaactgggcttgttggtgcccagtaccaggtgcggcggcatgccggcagtgggcagggccggagtggtgagcaggccgccgcACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCa < 2:207422‑M2/48‑1 (MQ=255) gtggccgagccgaaggtggaactgagcttgttggtgcccagtaccaggtGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTGCGGCTCGGCCACTGCAGGGTTCACCTACTACAAACGCAAAc < 2:280542‑M1/129‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCg > 1:11506/1‑231 (MQ=255) tggccgagccgaaggtggaactgagcttgttggtgcccagtaccaggtGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCCCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCCCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTg < 2:207422‑M1/102‑1 (MQ=255) ggccgaaggtggaactgagcttgttggtgcccagtaccaggtgcggcggcatgccggcagtgagcagggccggagtggtgagcaggccgccgcACCTGGt < 2:475547‑M2/7‑1 (MQ=255) accaggtGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCttcggcc < 2:475547‑M1/93‑2 (MQ=255) GCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCGTCGCTCGGCGCCGTCATCGCCCACTACATGCCAGCCGAATGGCTGAACAAGAtgctg < 2:418158‑M1/233‑1 (MQ=255) cacTCCGGCCCGGCTCACGGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGATCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGc < 2:5914/141‑1 (MQ=255) tCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTgg > 2:109366/1‑38 (MQ=255) ccGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGcc > 2:261056/1‑147 (MQ=255) aCTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCGTCg > 2:346587/1‑153 (MQ=255) aCTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCGTCGCTCGGCGCCGTCATCGcc > 2:329929/1‑171 (MQ=255) cTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCGTCGCTCGGCGCCGTCATCGCCCACTACATGCCAGCCGAATGGCTGAACAAGATGCTGCCAGTGATCGTCTTCGc < 1:201620/223‑1 (MQ=255) ccgccgcACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAACCGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCGTCGCTCGGCGCCGTCATCGCCCACTACATGCCAGCCGAATGGCTGAACa < 1:72686‑M2/180‑1 (MQ=255) cgccgcACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCGTCGCTCGGCGCCGTCATCGCCCACTACATGCCAGCCGAATGGCTGAACAAGATGCTGCCAGTGATCGTCTTCGCCTGTGGCATCTACCTGTTGTTcgg < 1:309906‑M2/229‑1 (MQ=255) ccgcACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCGTCGCTCGGCGCCGTCATCGCCCACTACATGCCAGCCGAATGGCTGGACAGGATGCTGCCa > 2:435826‑M2/5‑195 (MQ=255) | GGACACTGACAGTGGCTGCTTGATGGCATTACCATAGCCGCTAACTGTAGCGTTTGTGCTGCCGACCAACTGCCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGGGCGTCGCTCGGCGCCGTCATCGCCCACTACATGCCAGCCGAATGGCTGAACAAGATGCTGCCAGTGATCGTCTTCGCCTGTGGCATCTACCTGTTGTTCGG > AE015451/4535494‑4535949 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |