New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 204045 | NA (NA) | 4 (0.070) | 3/326 | NT | 18.1% | coding (9551/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
? | AE015451 | = 204062 | 19 (0.330) | coding (9568/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
CTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGACGTCGGTAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACTACCGTCACCGACGAGCCTGGTACCCCAGGCAACCCGGGCGGCAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCtcacgacc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AE015451/203814‑204045 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTGCCTGGGGTACCAGGCTCGTCGGTGACGGTAGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTG < AE015451/204062‑203821 CTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGACGTCGGTAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACTCCGGTCAGCACTACCGTCACCGACGAGCCTGGTACCCCAGGCAACCCGGGCGGCAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCAC < 1:660104/236‑1 GTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGACGTCGGTAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACTACCGTCACCGACGAGCCTGGTACCCCAGGCAACCCGGGCGGCAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGA > 1:296927/1‑236 GTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGACGTCGGTAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACTACCGTCACCGACGAGCCTGGTACCCCAGGCAACCCGGGCGGCAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCAC < 2:636381/234‑1 GATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGACGTCGGTAAGCTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACTACCGTCACCGACGAGCCTGGTACCCCAGGCAACCCGGGCGGCAGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACTATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACG < 2:574176/233‑1 ATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGACGTCGGTAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACTACCGTCACCGACGAGCCTGGTACCCCAGGCAACCCGGGCGGCAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTTACGA < 2:588710/233‑1 AACCGTTGAAGGTGCGGACGTCGGTAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACTACCGTCACCGACGAGCCTGGTACCCCAGGCAACCCGGGCGGCAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGATCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCAC < 2:555760/217‑1 TTGAAGGTGCGGACGTCGGTAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACTACCGTCACCGACGAGCCTGGTACCCCAGGCAACCCGGGCGGCAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGA < 1:245309/214‑1 GGACGTCGGTAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACTACCGTCACCGACGAGCCTGGTACCCCAGGCAACCCGGGCGGCAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACC > 2:109602/1‑206 gGCCGGGTACCCCAGGCAAGCCGGGCGGCAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCAC < 2:2325/136‑1 GCAACCCGGGCGGCAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGCTCACGTCCACCAGCCGCTGGCCCACGAC > 2:27117/1‑125 gaGCGGCAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGTACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTC > 2:667222/3‑173 GGGCGGCAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGATCAACATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACG < 2:86870/116‑1 gAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACG < 1:475219/109‑1 CAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGA < 2:768192/108‑1 CCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTGCCTGGGGTACCAGGCTCGTCGGTGACGGTAGTGCTGA < 1:667225/234‑1 CACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTG < 2:517506/106‑1 CACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTG > 1:517509/1‑106 gggCACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTGCCTGGGGTACCAGGCTCGTCGGTGACGGTAGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTT < 1:1045663/221‑1 CACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTGCCTGGGGTACCAGGCTCGTCGGTGACGGTAGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTTCAACGGTTGCGATC > 1:718706/1‑235 CACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTGCCTGGGGTACCAGGCTCGTCGGTGACGGTAGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGTTGCTC > 2:986178/1‑198 CACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTT > 2:178780/1‑99 CACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTT < 1:178782/99‑1 CGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCAGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTGCCTGGGGGACCAGGCTCGCCGGTGACGGTAGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAG > 1:248408/1‑184 ACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGACGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTGCCGGGGGTACCAGGCTCGg > 2:75081/1‑147 ACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTGCCTGGGGTACCAGGCTCGTCGGTGACGGTAGTGCTGACCGGCGT > 1:367462/1‑173 CCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAGGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTG > 2:610693/1‑113 CCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTGCCTGGGGTACCAGGCTCGTCGGTGACGGTAGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACGTCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTT > 1:748837/1‑235 CCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTGCCTGGGGTACCAGGCTCGTCGGTGACGGTAGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTG < 1:1084347/236‑1 CCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTGCCTGGGGTACCAGGCTCGTCGGTGACGGTAGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTG > 1:523690/1‑236 CCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTGCCTGGGGTACCAGGCTCGTCGGTGACGGTAGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTT > 1:941057/1‑235 CCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGG < 2:1087339/78‑1 CCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGG > 1:1087342/1‑78 CTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGACGTCGGTAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACTACCGTCACCGACGAGCCTGGTACCCCAGGCAACCCGGGCGGCAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCtcacgacc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AE015451/203814‑204045 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCACGACCAGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCCGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCTGCCGCCCGGGTTGCCTGGGGTACCAGGCTCGTCGGTGACGGTAGTGCTGACCGGCGTCTTGTCCAGCGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTG < AE015451/204062‑203821 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |