New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 94636 = | 57 (0.990) | 6 (0.110) | 6/324 | NT | 9.8% | coding (450/489 nt) | PP_0085 | conserved protein of unknown function |
? | AE015451 | 94723 = | 57 (1.040) | coding (363/489 nt) | PP_0085 | conserved protein of unknown function |
TGGCCGGATTGGGCGTGGCGATAGCACCGCAGCCGCTGGTCGCCGATGACCTGCGGGCGGGCCGATTGAGTGCGCCTTGGGGCTTTTCACCTACCCAGGCGGCGCTGGCATTGTGGGTGCCACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGAT > AE015451/94404‑94869 | atccttacagcccatactgcaaaggagagtcaacatgcaccgcaactcgctgcgtaaaacgtccctggaaagcatggaagcggagatcgagagccttctgaaaagcttggaaaacctcaagcatgatgcgtcggaagagtcccagaagtcggtgaaggcaatccgcagcaacgctgaaagcgcactgcgtcattcgcgcagcctactgagcgatgcgtacgaggaagtgaagcag < 1:1061720‑M1/3‑1 (MQ=255) gATAGCACCGCAGCCGCTGGTCGCCGATGACCTGCGGGCGGGCCGATTGAGTGCGCCTTGGGGCTTTTCACCTACCCAGGCGGCGCTGGCATTGTGGGTGCCACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACAcc > 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aTAGCACCGCAGCCGCTGGTCGCCGATGACCTGCGGGCGGGCCGATTGAGTGCGCCTTGGGGCTTTTCACCTACCCAGGCGGCGCTGGCATTGTGGGTGCCACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTGTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACcgg < 1:525998/235‑1 (MQ=255) agagtcaacatgcaccgcaactcgctgcgtaaaacgtccctggaaagcatggaagcggagatcgagagccttctgaaaagcttggaaaacctcaagcatgatgcgtcggaagagtcccagaagtcggtgaaggcaatccgcagcaacgctgaaagcgcactgcgtcattcgcgcagcctactgagcgatgcgtacgaggaagtgaagCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCggtgg > 1:1022747‑M1/208‑236 (MQ=255) caacatgcaccgcaactcgctgcgtaaaacgtccctggaaagcatggaagcggagatcgagagccttctgaaaagcttggaaaacctcaagcatgatgcgtcggaagagtcccagaagtcggtgaaggcaatccgcagcaacgctgaaagcgcactgcgtcattcgcgcagcctactgagcgatgcgtacgaggaagtgaagCAgcgc < 2:522920‑M1/6‑1 (MQ=255) aGCCGCTGGTCGCCGATGACCTGCGGGCGGGCCGATTGAGTGCGCCTTGGGGCTTTTCACCTACCCAGGCGGCGCTGGCATTGTGGGTGCCACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCGAGGGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAg > 1:611893/1‑236 (MQ=255) aGCCGCTGGTCGCCGATGACCTGCGGGCGGGCCGATTGAGTGCGCCTTGGGGCTTTTCACCTACCCAGGCGGCGCTGGCATTGTGGGTGCCACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAg > 1:1082160/1‑236 (MQ=255) aGCCGCTGGTCGCCGATGACCTGCGGGCGGGCCGATTGAGTGCGCCTTGGGGCTTTTCACCTACCCAGGCGGCGCTGGCATTGTGGGTGCCACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAg > 1:528575/1‑236 (MQ=255) 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tCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCtt < 1:62550/223‑1 (MQ=255) aGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGa < 2:145810/150‑1 (MQ=255) gtacgagtaagtgaagCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGGAGGGGTGTTCCTGGGCGTCGTCCCGGGTgg < 2:25744‑M1/62‑1 (MQ=255) aGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTc < 1:539127/236‑1 (MQ=255) cgccAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGCACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAg > 1:581130/1‑216 (MQ=255) gccAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAg > 1:1039075/1‑236 (MQ=255) aggaagtgaagCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAg < 1:640225‑M1/225‑1 (MQ=255) cagcagGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGc > 1:550634/1‑236 (MQ=255) cccAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGAt < 1:126843/236‑1 (MQ=255) ccAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCa > 2:818236/1‑168 (MQ=255) ccAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCa < 1:818239/168‑1 (MQ=255) | TGGCCGGATTGGGCGTGGCGATAGCACCGCAGCCGCTGGTCGCCGATGACCTGCGGGCGGGCCGATTGAGTGCGCCTTGGGGCTTTTCACCTACCCAGGCGGCGCTGGCATTGTGGGTGCCACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGAT > AE015451/94404‑94869 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |