New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 94636 = | 57 (0.990) | 6 (0.110) | 6/324 | NT | 9.8% | coding (450/489 nt) | PP_0085 | conserved protein of unknown function |
? | AE015451 | 94723 = | 57 (1.040) | coding (363/489 nt) | PP_0085 | conserved protein of unknown function |
CCCAGGCGGCGCTGGCATTGTGGGTGCCACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGATCTCCGCTTCCATGCTTTCCAGGGACGTTTTACGCAGCGAGTTGCGGTGCATGTTGACTCTCCTTTGCAGTATGGGCTGTAAGGAT > AE015451/94497‑94954 | cccAGGCGGCGCTGGCATTGTGGGTGCCACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCAc < 2:1082157/232‑1 (MQ=255) cttctgaaaagcttggaaaacctcaagcatgatgcgtcggaagagtcccagaagtcggtgaaggcaatccgcagcaacgctgaaagcgcactgcgtcattcgcgcagcctactgagcgatgcgtacgaggaagtgaagcagcgcacccgccagaccggcaaagccacccgggactacgcccaggaacacccctacaccaccgccggtgtggccattggtgcgctgCTTCACTTCCt < 1:640225‑M2/11‑1 (MQ=255) cggcgCTGGCATTGTGGGTGCCACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTAc < 1:677210/236‑1 (MQ=255) gcgcTGGCATTGTGGGTGCCACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTAc < 2:823300/234‑1 (MQ=255) gcgcTGGCATTGTGGGTGCCACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCAGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACg > 1:79230/1‑235 (MQ=255) gcTGGCATTGTGGGTGCCACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGc < 2:506914/234‑1 (MQ=255) cACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTgcg > 1:854668/1‑235 (MQ=255) cACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTgc > 2:380234/1‑234 (MQ=255) cACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTg > 2:1061717/1‑233 (MQ=255) aCGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTgcgc > 1:398209/1‑235 (MQ=255) gcgcCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAAt > 2:397029/1‑234 (MQ=255) 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gTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGATCTCCGCTTCCATGCTTTCCAGGGACGTTTTACGCAGCGAGTTGCGGTg < 2:451291/224‑1 (MQ=255) gTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGATCTCCGCTTCCATGCTTTCCAGGGACGTTTTACGCAGCGAGTTGCGGTGCATGTTg < 1:896407/231‑1 (MQ=255) ccaccgccggtgtggccattggtgcgctgCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGATCTCCGCTTCCATGCTTTCCAGGGACGTTTTACGCAGCGAGTTGCGGTGCATGTTGActct > 1:1022747‑M2/30‑236 (MQ=255) tGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGATCTCCGCTTCCATGCTTTCCAGGGACGTTTTACGCAGCGAGTTGCGGTGCATGt < 2:708361/228‑1 (MQ=255) ggCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCg > 2:500867/1‑96 (MQ=255) ggCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGATCTCCGCTTCCATGCTTTCCAGGGACGTTTTACGCAGCGAGTTGCGGTg > 2:718059/1‑222 (MQ=255) ttGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGATCTCCGCTTCCATGCTTTCCAGGGACGTTTTACGCAGCGAGTTGCGGTGCATGTTg < 2:977116/225‑1 (MQ=255) ttGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGATCTCCGCTTCCATGCTTTCCAGGGACGTTTTACGCAGCGAGTTGCGGTGCATGTTg < 2:639038/225‑1 (MQ=255) ttGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGATCTCCGCTTCCATGCTTTCCAGGGACGTTTTACGCAGCGAGTTGCGGTGCATGTTg > 1:977119/1‑225 (MQ=255) tGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCCTCGcc > 2:87/1‑45 (MQ=255) tGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGATCTCCGCTTCCATGCTTTCCAGGGACGTTTTACGCAGCggg > 1:544762/1‑207 (MQ=255) ggCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTTGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTcc < 1:318201/137‑1 (MQ=255) gcgctgCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGATCTCCGCTTCCATGCTTTCCAGGGACGTTTTACGCAGCGAGTTGCGGTGCATGTTg < 2:522920‑M2/202‑1 (MQ=255) ctgCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGATCTCCGCTTCCATGCTTTCCAGGGACGTTTTACGCAGCGAGTTGCGGTGCATGTTGACTCTCCTTTGCAGTATGGGCTGTAAGGAt < 1:1061720‑M2/232‑1 (MQ=255) | CCCAGGCGGCGCTGGCATTGTGGGTGCCACGGCGCGCCGCAGACGGGCGCGCCGAGCAGTTGGCGCAGTGGTTAAGGGCGGAACTTGCGCGGCAGAGCGCTTAGTTTCGCTTGCATATCAGGTAGGCCGCCAGCAGGCCCAGCGCACCAATGGCCACACCGGCGGTGGTGTAGGGGTGTTCCTGGGCGTAGTCCCGGGTGGCTTTGCCGGTCTGGCGGGTGCGCTGCTTCACTTCCTCGTACGCATCGCTCAGTAGGCTGCGCGAATGACGCAGTGCGCTTTCAGCGTTGCTGCGGATTGCCTTCACCGACTTCTGGGACTCTTCCGACGCATCATGCTTGAGGTTTTCCAAGCTTTTCAGAAGGCTCTCGATCTCCGCTTCCATGCTTTCCAGGGACGTTTTACGCAGCGAGTTGCGGTGCATGTTGACTCTCCTTTGCAGTATGGGCTGTAAGGAT > AE015451/94497‑94954 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |