New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 689649 = | 59 (1.020) | 3 (0.050) | 3/324 | NT | 5.1% | coding (695/714 nt) | PP_0590 | Transcriptional regulator, ArsR family |
? | AE015451 | 689680 = | 56 (1.030) | intergenic (+12/+9) | PP_0590/PP_0591 | Transcriptional regulator, ArsR family/Adenine deaminase |
GGCCTTGGTCGGGGTGTACATCGATGCCCTGGCGCCACACCAGCAACGAGGTTGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTCATATGGTCGAAC > AE015451/689419‑689884 | ggCCTTGGTCGGGGTGTACATCGATGCCCTGGCGCCACACCAGCAACGAGGTTGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACg < 1:871822/235‑1 (MQ=255) gtACATCGATGCCCTGGCGCCACACCAGCAACGAGGTTGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGa > 1:54754/1‑235 (MQ=255) cGATGCCCTGGCGCCACACCAGCAACGAGGTTGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGa > 2:647895/1‑212 (MQ=255) gttcgaccatatgagccagcacaacatcctcgacatgctcgagcgtggtgtgaaagtcaccgtcaactcggacgacccggcctacttcggtggctacgtcacggagaacttccacgctctgcatacccacttgggcatgaccgaagaccaggcacgtcgcctggcgcagaacagcctggacgcacggctggtttgagtagcatgaCGACGt > 2:560578‑M1/206‑211 (MQ=255) ccTGGCGCCACACCAGCAACGAGGTTGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACgtcgtc < 1:919413/236‑1 (MQ=255) ccTGGCGCCACACCAGCAACGAGGTTGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACgtcgtc < 1:408041/236‑1 (MQ=255) cgaccatatgagccagcacaacatcctcgacatgctcgagcgtggtgtgaaagtcaccgtcaactcggacgacccggcctacttcggtggctacgtcacggagaacttccacgctctgcatacccacttgggcatgaccgaagaccaggcacgtcgcctggcgcagaacagcctggacgcacggctggtttgagtagcatgacg > 1:122818‑M1/203‑204 (MQ=255) tGGCGCCACACCAGCAACGAGGTTGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGt > 2:631200/1‑218 (MQ=255) ccACACCAGCAACGAGGTTGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGt > 2:49350/1‑202 (MQ=255) cAGCAACGAGGTTGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAgc < 1:153361/212‑1 (MQ=255) aacatcctcgacatgctcgagcgtggtgtgaaagtcaccgtcaactcggacgacccggcctacttcggtggctacgtcacggagaacttccacgctctgcatacccacttgggcatgaccgaagaccaggcacgtcgcctggcgcagaacagcctggacgcacggctggtttgagtagcatgaCGACGTTGc < 1:540152‑M1/9‑1 (MQ=255) aacatcctcgacatgctcgagcgtggtgtgaaagtcaccgtcaactcggacgacccggcctacttcggtggctacgtcacggagaacttccacgctctgcatacccacttgggcatgaccgaagaccaggcacgtcgcctggcgcagaacagcctggacgcacggctggtttgagtagcatgaCGACGTTGc > 2:540149‑M1/184‑192 (MQ=255) ttGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACt > 2:1074857/1‑220 (MQ=255) gCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCa > 2:975533/1‑202 (MQ=255) tGATCTGCGGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGa < 1:955523/177‑1 (MQ=255) tGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGt > 1:689769/1‑235 (MQ=255) tGCCGCGGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCa < 2:294032/179‑1 (MQ=255) tcgagcgtggtgtgaaagtcaccgtcaactcggacgacccggcctacttcggtggctacgtcacggagaacttccacgctctgcatacccacttgggcatgaccgaagaccaggcacgtcgcctggcgcagaacagcctggacgcacggctggtttgagtagcatgaCGACGt < 2:549953‑M1/6‑1 (MQ=255) cGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAg > 2:1010635/1‑234 (MQ=255) gACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCACCGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGCCCAGGCTGTTCt > 2:333337/1‑217 (MQ=255) gggCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCCACTCAAACCAGCCGTg > 2:64819/1‑197 (MQ=255) ccGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCgg > 2:744020/1‑235 (MQ=255) cATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCg < 2:1075193/231‑1 (MQ=255) gggTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCCACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGccc < 1:64821/235‑1 (MQ=255) tACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCaa > 1:497742/1‑229 (MQ=255) aCTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGccc < 1:631203/226‑1 (MQ=255) aCTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTAt < 1:73957/236‑1 (MQ=255) 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tCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCCCTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTTGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCa > 2:33681/1‑139 (MQ=255) tCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCaa > 1:121227/1‑211 (MQ=255) tCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGaa > 2:463917/1‑232 (MQ=255) tCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAg > 2:832092/1‑233 (MQ=255) 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cTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTa > 1:549956/1‑236 (MQ=255) tCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTgcgc > 1:816855/1‑161 (MQ=255) ctggATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGaa > 1:805183/1‑210 (MQ=255) ggATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAg > 2:984486/1‑233 (MQ=255) 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ggaccaggcacgtcgcctggcgcagaacagcctggacgcacggctggtttgagtagcatgaCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGAc > 1:513282‑M1/62‑236 (MQ=255) gcgGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGgtc < 2:840822/222‑1 (MQ=255) cgGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGGCCGAGTTGACggg > 1:130915/1‑235 (MQ=255) cgGGCACTGCAGATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCCGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTGCTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGccc > 2:526615/1‑162 (MQ=255) atatTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTGCGTGa > 2:542745/1‑186 (MQ=255) atatTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTcaca < 1:463920/236‑1 (MQ=255) cctggcgcagaacagcctggacgcacggctggtttgagtagcatgaCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGc < 2:513279‑M1/157‑1 (MQ=255) atTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCAcacc < 1:1010638/236‑1 (MQ=255) 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tGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGc > 1:1034219/1‑236 (MQ=255) tGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGc > 1:396018/1‑236 (MQ=255) tCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCa > 1:397639/1‑138 (MQ=255) tCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGAtgtt < 1:49351/235‑1 (MQ=255) aaTCGCATAGCCCGCGGGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAACGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACAAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCAcc > 2:595293/1‑167 (MQ=255) ctggtttgagtagcatgaCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGATCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGa < 2:583334‑M1/169‑1 (MQ=255) tCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGAtgttgt > 2:654629/1‑233 (MQ=255) tAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTg > 2:40652/1‑191 (MQ=255) tAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTc > 1:685711/1‑236 (MQ=255) cccGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTca < 2:940655/195‑1 (MQ=255) cccGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGGGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGGGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGgtg > 1:95376/1‑171 (MQ=255) gTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTCATATGGt < 1:481152/235‑1 (MQ=255) tGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACg < 2:1014116/179‑1 (MQ=255) ggCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGa > 2:233487/1‑182 (MQ=255) ggCGACGGTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGCGGGTATGCAGAGCGCGGAAGt > 2:237945/1‑131 (MQ=255) CGAGGTGGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTCATATGGTCGAac > 1:1083827‑M1/1‑236 (MQ=255) | GGCCTTGGTCGGGGTGTACATCGATGCCCTGGCGCCACACCAGCAACGAGGTTGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTCATATGGTCGAAC > AE015451/689419‑689884 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |