| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 689649 = | 59 (1.020) | 3 (0.050) | 3/324 | NT | 5.1% | coding (695/714 nt) | PP_0590 | Transcriptional regulator, ArsR family |
| ? | AE015451 | 689680 = | 56 (1.030) | intergenic (+12/+9) | PP_0590/PP_0591 | Transcriptional regulator, ArsR family/Adenine deaminase | |||||
CCTGGCGCCACACCAGCAACGAGGTTGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTCATATGGTCGAACACGCAGAGC > AE015451/689446‑689893 | ccTGGCGCCACACCAGCAACGAGGTTGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACgtcgtc < 1:919413/236‑1 (MQ=255)ccTGGCGCCACACCAGCAACGAGGTTGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACgtcgtc < 1:408041/236‑1 (MQ=255) ttGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACt > 2:1074857/1‑220 (MQ=255) tGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGt > 1:689769/1‑235 (MQ=255) cGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAg > 2:1010635/1‑234 (MQ=255) gACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCACCGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGCCCAGGCTGTTCt > 2:333337/1‑217 (MQ=255) gtcaactcggacgacccggcctacttcggtggctacgtcacggagaacttccacgctctgcatacccacttgggcatgaccgaagaccaggcacgtcgcctggcgcagaacagcctggacgcacggctggtttgagtagcatgacgacgttgcgctcaaccgacctgcaacgtcgTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGtcc > 1:513282‑M2/176‑235 (MQ=255) gggCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCCACTCAAACCAGCCGTg > 2:64819/1‑197 (MQ=255) ccGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCgg > 2:744020/1‑235 (MQ=255) tcggacgacccggcctacttcggtggctacgtcacggagaacttccacgatctgcatacccacttgggcatgaccgaagaccaggcacgtcgcctggcgcagaacagcctggacgcacggctggtttgagtagcatgacgacgttgcgctcaaccgacctgcaacgtcgTCATGCTACTCAAACCAg < 2:583334‑M2/18‑1 (MQ=255) cATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCg < 2:1075193/231‑1 (MQ=255) gggTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCCACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGccc < 1:64821/235‑1 (MQ=255) gcctacttcggtggctacgtcacggagaacttccacgctctgcatacccacttgggcatgaccgaagaccaggcacgtcgcctggcgcagaacagcctggacgcacggctggtttgagtagcatgacgacgttgcgctcaaccgacctgcaacgtcgTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAgg < 2:513279‑M2/46‑1 (MQ=255) tACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCaa > 1:497742/1‑229 (MQ=255) aCTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGccc < 1:631203/226‑1 (MQ=255) aCTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTAt < 1:73957/236‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCaga > 1:410739/1‑236 (MQ=255) gCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAAGCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTgcg < 1:532283/184‑1 (MQ=255) cTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTgg > 2:530830/1‑235 (MQ=255) tGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGGGGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAg < 2:897714/157‑1 (MQ=255) tCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCCCTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTTGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCa > 2:33681/1‑139 (MQ=255) tCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCaa > 1:121227/1‑211 (MQ=255) tCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGaa > 2:463917/1‑232 (MQ=255) tCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAg > 2:832092/1‑233 (MQ=255) aGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGCGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGACATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAg > 2:264942/1‑164 (MQ=255) aGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTtctc < 1:1074860/236‑1 (MQ=255) ccTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACGCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGccc < 2:257843/199‑1 (MQ=255) cTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTa > 1:549956/1‑236 (MQ=255) cTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTa > 1:742488/1‑236 (MQ=255) tCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTgcgc > 1:816855/1‑161 (MQ=255) ctggATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGaa > 1:805183/1‑210 (MQ=255) ggATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAg > 2:984486/1‑233 (MQ=255) gggTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATAGTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCATGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTg < 1:545984/180‑1 (MQ=255) gTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGccc < 2:959759/175‑1 (MQ=255) cTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGt > 2:640629/1‑233 (MQ=255) tCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGccc < 1:1029383/165‑1 (MQ=255) ggaccaggcacgtcgcctggcgcagaacagcctggacgcacggctggtttgagtagcatgaCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGAc > 1:513282‑M1/62‑236 (MQ=255) gcgGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGgtc < 2:840822/222‑1 (MQ=255) cgGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGGCCGAGTTGACggg > 1:130915/1‑235 (MQ=255) cgGGCACTGCAGATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCCGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTGCTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGccc > 2:526615/1‑162 (MQ=255) atatTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTGCGTGa > 2:542745/1‑186 (MQ=255) atatTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTcaca < 1:463920/236‑1 (MQ=255) cctggcgcagaacagcctggacgcacggctggtttgagtagcatgaCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGc < 2:513279‑M1/157‑1 (MQ=255) atTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCAcacc < 1:1010638/236‑1 (MQ=255) ttCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCCGCCGTGCGTCCCGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCATGGTCTTCGTTCCTGcccga > 2:150359/1‑148 (MQ=255) ggCGCTGGGTATCCAGAAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCt < 1:116931/236‑1 (MQ=255) 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tCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGAtgttgt > 2:654629/1‑233 (MQ=255) tAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTg > 2:40652/1‑191 (MQ=255) tAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTc > 1:685711/1‑236 (MQ=255) cccGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTca < 2:940655/195‑1 (MQ=255) cccGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGGGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGGGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGgtg > 1:95376/1‑171 (MQ=255) gTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTCATATGGt < 1:481152/235‑1 (MQ=255) tGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACg < 2:1014116/179‑1 (MQ=255) ggCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGa > 2:233487/1‑182 (MQ=255) ggCGACGGTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGCGGGTATGCAGAGCGCGGAAGt > 2:237945/1‑131 (MQ=255) CGAGGTGGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTCATATGGTCGAac > 1:1083827‑M1/1‑236 (MQ=255) ACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTCATATGGTCGAacac > 1:975536‑M1/1‑236 (MQ=255) CGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGaa < 2:404256‑M1/148‑1 (MQ=255) GTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGAtgtt < 2:412478‑M1/210‑1 (MQ=255) GCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTCATATGGTCGAACACGCaga > 1:654632‑M1/1‑236 (MQ=255) gcGGTTGAGCGCAAGGTCGTCGTGCTAGTCAAACCAGTCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTCATATGGTCGAACACGCaga < 2:339395/230‑1 (MQ=255) ttGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGAtgtt < 2:410736/198‑1 (MQ=255) aGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTCATATGGTCGAACACGCAGAGc > 1:380014/1‑226 (MQ=255) gcaacgtcgTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGAtgtt < 1:540152‑M2/183‑1 (MQ=255) gcaacgtcgTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGAtgtt > 2:540149‑M2/10‑192 (MQ=255) acgtcgTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGa < 2:549953‑M2/167‑1 (MQ=255) acgtcgTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTCATATGGTCGAac > 2:560578‑M2/7‑211 (MQ=255) cgTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTCATATGGTCg > 1:122818‑M2/3‑204 (MQ=255) | CCTGGCGCCACACCAGCAACGAGGTTGCGTGATCTGCCGCTGCACCGAATGGAATGACCAGGGCCCGCATCTGGGTGGCGTACTGGGCCAGGCCTTGTTCAGGTTGTTCCTGCAATCTGGCTGGATGCGCGAGTTGGAGGACTCGCGGGCACTGCATATTTCGGCGCTGGGTATCCAGCAGATCAATCGCATAGCCCGCGTGGCGACGTTGCAGGTCGGTTGAGCGCAACGTCGTCATGCTACTCAAACCAGCCGTGCGTCCAGGCTGTTCTGCGCCAGGCGACGTGCCTGGTCTTCGGTCATGCCCAAGTGGGTATGCAGAGCGTGGAAGTTCTCCGTGACGTAGCCACCGAAGTAGGCCGGGTCGTCCGAGTTGACGGTGACTTTCACACCACGCTCGAGCATGTCGAGGATGTTGTGCTGGCTCATATGGTCGAACACGCAGAGC > AE015451/689446‑689893 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |