New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 734319 = | 27 (0.470) | 7 (0.130) | 6/320 | NT | 22.1% | coding (998/1296 nt) | ndh | NADH dehydrogenase |
? | AE015451 | 734381 = | 24 (0.440) | coding (936/1296 nt) | ndh | NADH dehydrogenase |
GGAAGAACCCGTACAGCGCCATCTGGTGCATGCGGTACAGCGACACATAGAACATGCGCGCCAGCCAGCCTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCGGTTGGTTTCCAGGCCATCGATGTCCTTGAGGAAACCTGGCGCGCGGATACCGGCTGCCCACACCTTCAGGCTGGCCTGGA > AE015451/734089‑734532 | tcggggtgaaggtgatgaccaacgccgcagtcagtgaagtgaccgaggacggcctgaaaaccaaggacggtgaagtgatccaggccagcctgaaggtgtgggcagccggtatccgcgcgccaggtttcctcaaggacatcgatggcctggaaaccaaccgcatcaaccagctggtcgtgcgccctaccctgcaaaccacccgcgacgacaacatcttcgccttcggtgacTgcgc > 1:309572‑M1/231‑235 (MQ=255) gcgcCATCTGGTGCATGCGGTACAGCGACACATAGAACATGCGCGCCAGCCAGCCTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCgcgg < 1:873360/235‑1 (MQ=255) tCTGGTGCATGCGGTACAGCGACACATAGAACATGCGCGCCAGCCAGCCTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCAc > 1:564036/1‑235 (MQ=255) cgcCAGCCAGCCTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAg > 1:551747/1‑235 (MQ=255) cgcCAGCCAGCCTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGt > 1:223131/1‑236 (MQ=255) aggccagcctgaaggtgtgggcagccggtatccgcgcgccaggtttcctcaaggacatcgatggcctggaaaccaaccgcatcaaccagctggtcgtgcgccctaccctgcaaaccacccgcgacgacaacatcttcgccttcggtgacTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCggg < 2:81264‑M1/44‑1 (MQ=255) aggccagcctgaaggtgtgggcagccggtatccgcgcgccaggtttcctcaaggacatcgatggcctggaaaccaaccgcatcaaccagctggtcgtgcgccctaccctgcaaaccacccgcgacgacaacatcttcgccttcggtgacTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCggg > 1:81266‑M1/150‑193 (MQ=255) aTCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGa < 2:528480/217‑1 (MQ=255) cATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAgg > 1:627096/1‑235 (MQ=255) cggTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAgcgatc < 2:940414/184‑6 (MQ=255) cACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGCtgttg > 1:213567/1‑202 (MQ=255) cACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGa > 1:177838/1‑236 (MQ=255) aaGCGCGGCAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGGACTCGTCCGTCGGCAGCGCCGTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCGGTGCGCgcgg < 2:348670/128‑1 (MQ=255) ggcgcGGCAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCa < 2:702415/172‑1 (MQ=255) cagcgacaCCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGgc > 2:314495/1‑212 (MQ=255) agcgacaCCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGa < 1:314498/229‑1 (MQ=255) cGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCg < 2:744638/130‑1 (MQ=255) cGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGTTGGTTGATGCGGTTGGTTTCCAGGc > 1:250206/1‑212 (MQ=255) cGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCGGTTGGTTTCCAGGCCATCGATg > 1:989030/1‑220 (MQ=255) cGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAg > 2:446594/1‑139 (MQ=255) cGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCggttggtt > 2:654791/1‑202 (MQ=255) cTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAgg < 2:523936/107‑1 (MQ=255) cTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAgg > 1:523939/1‑107 (MQ=255) cAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCATCTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCGGTTGGTTTCCAGGCCATCGATGTCCTCGAGGAAACCTGGCGCGCGGATACCGGCTGc < 1:600050/234‑1 (MQ=255) ccTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCGGTTGGTTTCCAGGCCATCGATGTCCTTGAGGAAACCTGGCGCGCGGATACCGGCTGCCCACACCtt > 1:193777/1‑235 (MQ=255) ccTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGGTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCGGTTGGTTTCCAGGCCATCGATGTCCTTGAGGAAACCTGGcgcgcg > 1:209342/1‑214 (MQ=255) cTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCGGTTGGTTTCCAg > 2:837852/1‑180 (MQ=255) acccgcgacgacaacatcttcgccttcggtgacTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCGGTTGGTTTCCAGGCCATCGATGTCCTTGAGGAAACCTGGCGCGCGGATAcc < 2:76443‑M1/185‑1 (MQ=255) acccgcgacgacaacatcttcgccttcggtgacTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGACCGCTGc < 2:308682‑M1/40‑1 (MQ=255) cgcgacgacaacatcttcgccttcggtgacTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTGAcc < 2:560294‑M1/68‑1 (MQ=255) tGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCGGTTGGTTTCCAGGCCATCGATGTCCTTGAGGAAACCTGGCGCGCGGATACCGGCTGCCCACACCTTCAGGCTGGCCt < 2:564033/235‑1 (MQ=255) caacatcttcgccttcggtgacTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCGGTTGGTTTCCAGGCCATCGATGTCCTTGAGGAAACCTGGCGCGCGGATACCGGCTGCCCACACCTTc > 1:76445‑M1/23‑223 (MQ=255) gcCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGGGCGCGCGGCGGCCCGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCGGTTGGTTTCCAGGCCATCGATGTCCTTGAGGAAAcc < 2:273732/191‑1 (MQ=255) cttcggtgacTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTCGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCGGTTGGTTTc < 1:1031522‑M1/143‑1 (MQ=255) ccTGCTGGGGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGAGCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCGGTTGGTTTCCAGGCCATCGATGTCCTTGAGGAAACCTGGCGCGCGGATACCGGCTGCCCACACCTTCAGGCTGGCCTGGa < 1:148952/222‑1 (MQ=255) gTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCGGTTGGTTTCCAGGCCATCGATGTCCTTGAGGAAACCTGGCGCGCGGATACCGGCTGc < 2:1011735/192‑1 (MQ=255) | GGAAGAACCCGTACAGCGCCATCTGGTGCATGCGGTACAGCGACACATAGAACATGCGCGCCAGCCAGCCTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTAGGGCGCACGACCAGCTGGTTGATGCGGTTGGTTTCCAGGCCATCGATGTCCTTGAGGAAACCTGGCGCGCGGATACCGGCTGCCCACACCTTCAGGCTGGCCTGGA > AE015451/734089‑734532 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |