New junction evidence | |||||||||||
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GGTACGGTCGTCACCGTCCTTGGCCCGACCTTCGGCCTGGGCGATCCAGATCGAGGTGGCATCGTTGCGGATCGAGTGGTTGATGTAAGCCGACAGCAGTTGGTAAGCAGCCAGTTTTTCGCGCCGCCCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCT > AE015451/872445‑872911 | ggTACGGTCGTCACCGTCCTTGGCCCGACCTTCGGCCTGGGCGATCCAGATCGAGGTGGCATCGTTGCGGATCGAGTGGTTGATGTAAGCCGACAGCAGTTGGTAAGCAGCCAGTTTTTCGCGCCGCCCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAgg < 1:965817/235‑1 (MQ=255) ggTACGGTCGTCACCGTCCTTGGCCCGACCTTCGGCCTGGACGATCCAGATCGAGGTGGCATCGTTGCGGATCGAGTGGTTGATGTAAGCCGACAGCAGTTGGTAAGCAGCCAGTTTTTCGCGCCGCCCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAgg < 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tACGGTCGTCACCGTCCTTGGCCCGACCTTCGGCCTGGGCGATCCAGATCGAGGTGGCATCGTTGCGGATCGAGTGGTTGATGTAAGCCGACAGCAGTTGGTAAGCAGCCAGTTTTTCGCGCCGCCCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCg < 1:270759/236‑1 (MQ=255) cGGTCGTCACCGTCCTTGGCCCGACCTTCGGCCTGGGCGATCCAGATCGAGGTGGCATCGTTGCGGATCGAGTGGTTGATGTAAGCCGACAGCAGTTGGTAAGCAGCCAGTTTTTCGCGCCGCCCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCgg > 1:769799/1‑235 (MQ=255) ggTCGTCACCGTCCTTGGCCCGACCTTCGGCCTGGGCGATCCAGATCGAGGTGGCATCGTTGCGGATCGAGTGGTTGATGTAAGCCGACAGCAGTTGGTAAGCAGCCAGTTTTTCGCGCCGCCCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCa < 2:769796/228‑1 (MQ=255) 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agaccatcgatcgcgccaccgacggcgtcacctactcgggtgtggaacagctcaAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGcga < 1:797726‑M1/135‑1 (MQ=255) ccatcgatcgcgccaccgacggcgtcacctactcgggtgtggaacagctcaAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTcacggtggtggc < 2:830865‑M1/64‑4 (MQ=255) aaaGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTg < 2:981670/222‑1 (MQ=255) aaGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGa > 2:132786/1‑158 (MQ=255) ggCTTTTGCAGCAAATTGGCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGcgatcgat < 1:14803/185‑1 (MQ=255) tGCAGCAAATGGTCGCCAATGGCGCTGGGCGGCGTGGGAAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGtt < 2:975947/101‑1 (MQ=255) cGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCgag < 2:992393/209‑1 (MQ=255) cAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGACGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCAACGTAGTACTCg < 1:872018/185‑1 (MQ=255) gCGAGGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCg < 2:263051/180‑1 (MQ=255) gATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATGGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGAAGATGTCACGGTGGTTTGCCAGGAACAgg < 2:969518/91‑1 (MQ=255) tGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTc > 2:119391/1‑55 (MQ=255) ggcgTGGGCAGGCCGGCGTGGTACGCCGCGTAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAAtt < 1:393107/214‑1 (MQ=255) ggcgTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGa < 1:759392/235‑1 (MQ=255) gcgTGGGCGGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGAtggtct < 2:669495/153‑1 (MQ=255) cAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCt < 1:767775/236‑1 (MQ=255) | GGTACGGTCGTCACCGTCCTTGGCCCGACCTTCGGCCTGGGCGATCCAGATCGAGGTGGCATCGTTGCGGATCGAGTGGTTGATGTAAGCCGACAGCAGTTGGTAAGCAGCCAGTTTTTCGCGCCGCCCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCT > AE015451/872445‑872911 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |