New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 872677 = | 57 (0.990) | 3 (0.050) | 3/326 | NT | 5.9% | coding (485/1272 nt) | PP_0756 | conserved protein of unknown function |
? | AE015451 | 872768 = | 42 (0.760) | coding (394/1272 nt) | PP_0756 | conserved protein of unknown function |
CCGACAGCAGTTGGTAAGCAGCCAGTTTTTCGCGCCGCCCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCTTGAGCAACCAGCCGAGAGCGCCGGCCGCCCGTGGAAAGCGGAAGTGGGTGAGGATATCGAGGAATGCCGGGTCGCTGAGCAGGCGTGCCAGA > AE015451/872534‑873003 | ccGACAGCAGTTGGTAAGCAGCCAGTTTTTCGCGCCGCCCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTg < 1:568568/236‑1 (MQ=255) gcagTTGGTAATCAGCCAGTTTTTCGCGCCGCCCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCGTGAGCt > 1:1021264/1‑234 (MQ=255) cagTTGGTAAGCAGCCAGTTTTTCGCGCCGCCCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGtt < 1:830558/236‑1 (MQ=255) gTAAGCAGCCAGTTTTTCGCGCCGCCCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCacac > 1:671690/1‑236 (MQ=255) agcagcCAGGTTTGCGCGCCGCCCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCGCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTcc < 2:524890/229‑1 (MQ=255) gccgccCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCtt < 2:946296/202‑1 (MQ=255) cGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGcgatcgat < 2:671687/233‑1 (MQ=255) tctTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACgtagta > 1:715795/1‑235 (MQ=255) tctTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTAc > 1:730785/1‑236 (MQ=255) ttCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGAc > 1:992396/1‑236 (MQ=255) cAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGa > 2:371329/1‑233 (MQ=255) catcatGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCtt > 1:996644/1‑156 (MQ=255) catcatGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCt > 1:1052332/1‑236 (MQ=255) gtcgaccagaccatcgatcgcgccaccgacggcgtcacctactcgggtgtggaacagctcaAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCt < 2:455849‑M1/97‑1 (MQ=255) tGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAg > 1:741530/1‑236 (MQ=255) tCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAgg < 1:647980/235‑1 (MQ=255) cTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCga > 1:356476/1‑236 (MQ=255) agaccatcgatcgcgccaccgacggcgtcacctactcgggtgtggaacagctcaAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGcga < 1:797726‑M1/135‑1 (MQ=255) aaaGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTg < 2:981670/222‑1 (MQ=255) aaGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGa > 2:132786/1‑158 (MQ=255) ggCTTTTGCAGCAAATTGGCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGcgatcgat < 1:14803/185‑1 (MQ=255) tcgcgccaccgacggcgtcacctactcgggtgtggaacagctcaaggccggcaccgcctacctgttcctggccaaccaccgtgacatcgtcatggacccggccttcgtcaactatgcggtgtaccacgccggcctTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGAtggtct < 1:797726‑M2/54‑1 (MQ=255) cGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCgag < 2:992393/209‑1 (MQ=255) cAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGACGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCAACGTAGTACTCg < 1:872018/185‑1 (MQ=255) gCGAGGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCg < 2:263051/180‑1 (MQ=255) ggcgTGGGCAGGCCGGCGTGGTACGCCGCGTAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAAtt < 1:393107/214‑1 (MQ=255) ggcgTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGa < 1:759392/235‑1 (MQ=255) gcgTGGGCGGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGAtggtct < 2:669495/153‑1 (MQ=255) agctcaaggccggcaccgcctacctgttcctggccaaccaccgtgacatcgtcatggacccggccttcgtcaactatgcggtgtaccacgccggcctTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGAc < 2:455849‑M2/61‑1 (MQ=255) cAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCt < 1:767775/236‑1 (MQ=255) GGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTg > 2:839292‑M1/1‑172 (MQ=255) GGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTg < 1:839295‑M1/172‑1 (MQ=255) ggTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGGCGCCGGCGGGGgcg > 2:108897/1‑122 (MQ=255) ggTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGt > 1:632987/1‑181 (MQ=255) cGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGGGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGcgatcgat < 2:811754/123‑1 (MQ=255) cGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAgg < 2:632984/161‑1 (MQ=255) ttGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACt < 1:191546/141‑1 (MQ=255) tGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCTTGAGCAACCAGCCGAGAGCgccggcc > 1:548166/1‑236 (MQ=255) tGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCTTGAGCAACCAGCCGAGAGCgccggcc > 1:300005/1‑236 (MQ=255) gccaccaccgtgacatcgtcatggacccggccttcgtcaactatgcggtgtaccacgccggcctTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGAtgg < 2:830865‑M2/51‑1 (MQ=255) ggCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCa < 1:749222/143‑1 (MQ=255) ggCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCa > 2:749219/1‑143 (MQ=255) ggCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCTTGAGCAACCAGCCGAGAGCGCCGGCCGCCCGTg > 1:426534/1‑236 (MQ=255) ggTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCTTGAGCAACCAGCCGAGAGCGCCGGCCGCCCGTGGAAAg > 1:512755/1‑236 (MQ=255) ccATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCga > 2:412205/1‑142 (MQ=255) ccATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCga < 1:412208/142‑1 (MQ=255) tCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGGGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCgg < 2:442306/148‑1 (MQ=255) cACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCtt > 2:240643/1‑184 (MQ=255) cACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCTTGAGCAACCAGCCGAGAGCGCCGGCCGCCCGTGGAAAGCGGAAGTGGGTGAg > 1:293849/1‑235 (MQ=255) cACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCTTGAGCAACCAGCCGAGAGCGCCGGCCGCCCGTGGAAAGCGGAAGTGGGTGAg > 1:473338/1‑235 (MQ=255) gCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCTTGAGCAACCAGCCGAGAGCGCCGGCCGCCCGTGGAAAGCGGAAGGGGGTGAGGATATCGAg > 1:200101/1‑233 (MQ=255) ccAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCTTGAGCAACCAGCCGAGAGCGCCGGCCGCCCGTGGaaa < 1:356597/208‑1 (MQ=255) tGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCTTGAGCAACCAGCCGAGAGCGCCGGCCGCCCGTGGAAAGCGGAAGTGGGTGAGGATATCGAGGAATGCCGGGTCGCTGAGCAg > 1:558863/1‑235 (MQ=255) ggcctTGAGCTGTTCCGCACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCTTGAGCAACCAGCCGAGAGCGCCGGCCGCCCGTGGAAAGCGGAAGTGGGTGAGGATATCGAGGAATGCCGGGTCGCTGAGCAGGCGTg > 1:837152‑M2/6‑236 (MQ=255) gcctTGAGCTGTTCCACTCCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGGTGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCgag < 2:680289‑M2/92‑1 (MQ=255) gcctTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCTTGAGCAACCAGCCGAGAGCGCCGGCCGCCCGTGGAAAGCGGAAGTGGGTGAGGATATCGAGGAATGCCGGGTCGCTGAGCAGGCGTGc > 1:493544‑M2/5‑236 (MQ=255) tGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCTTGAGCAACCAGCCGAGAGCGCCGGCCGCCCGTGGAAAGCGGAAGTGGGTGAGGATATCGAGGAATGCCGGGTCGCTGAGCAGGCGTGCCAGa > 1:935398/1‑236 (MQ=255) | CCGACAGCAGTTGGTAAGCAGCCAGTTTTTCGCGCCGCCCGCTGATCGAACGGTGCACGATGAAGCTCTTGTTCAGGCGCATCATGTCGCTGACAAAGGGCTTTTGCAGCAAATTGTCGCCAATGGCGATGCGCGGCGTGGGCAGGCCGGCGTGGTACACCGCATAGTTGACGAAGGCCGGGTCCATGACGATGTCACGGTGGTTGGCCAGGAACAGGTAGGCGGTGCCGGCCTTGAGCTGTTCCACACCCGAGTAGGTGACGCCGTCGGTGGCGCGATCGATGGTCTGGTCGACGTAGTACTCGACTTTGTCCTGCAAGGTCGAGACACAGGTAACACCGGCGAATTCCTTGCGCAGGCGGCGTGCGATCAAGGGCTTGAGCAACCAGCCGAGAGCGCCGGCCGCCCGTGGAAAGCGGAAGTGGGTGAGGATATCGAGGAATGCCGGGTCGCTGAGCAGGCGTGCCAGA > AE015451/872534‑873003 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |