| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AE015451 | = 1947111 | 59 (1.020) | 4 (0.070) | 4/324 | NT | 6.6% | coding (629/1185 nt) | PP_1748 | conserved protein of unknown function |
| ? | AE015451 | = 1947134 | 57 (1.040) | coding (606/1185 nt) | PP_1748 | conserved protein of unknown function | |||||
CCGGCCAGTTTCAGCAGGTGCCGGGACAGGTGGTAGTCGTAAGGCCCCGACGAGTCCTGCATGGCCACACTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGTGGTCCCAGCTGATCGGCATCTGGTCGATCGCCGTGT > AE015451/1946886‑1947342 | ccGGCCAGTTTCAGCAGGTGCCGGGACAGGTGGTAGTCGTAAGGCCCCGACGAGTCCTGCATGGCCACACTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTcc < 2:928797/234‑1 (MQ=255) tGCCGGGACAGGTGGTAGTCGTAAGGCCCCGACGAGTCCTGCATGGCCACACTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTcca < 1:1040069/217‑1 (MQ=255) 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tCCTGCATGGCCACACTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGt < 1:752904/235‑1 (MQ=255) cacTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTg > 2:462786/1‑233 (MQ=255) cacTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCGGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTg < 1:339514‑M2/183‑2 (MQ=255) gACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGAtgctg > 1:524752/1‑232 (MQ=255) 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aGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGTGGTCCCAGCTGATCGGCATCTGGTCGa < 1:30139/235‑1 (MQ=255) gCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCCCAGGCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCa > 2:329610/1‑195 (MQ=255) gCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGTGGTCCCAGCTGATCGGCATCTGGTCGATCGcc > 1:659183/1‑236 (MQ=255) cTGGCGGCactgaaggctgtggtggaaagcggccgccagccgctgatcgactgccacccgctgttcaccatcaccgaggagaccggctcgggtgcagccggcgccctgccctgggacgtcagcgagtgcgtcggcatcgacatcgccccggtggcgcccgggcaggcttccagcgagcatgc < 2:300530‑M1/182‑175 (MQ=255) cTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCa > 2:590163/1‑200 (MQ=255) cTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCa < 1:590166/200‑1 (MQ=255) tGGCGGCactgaaggctgtggtggaaagcggccgccagccgctgatcgactgccacccgctgttcaccatcaccgaggagaccggctcgggtgcagccggcgccctgccctgggacgtcagcgagttcggcggcatcgacatcgccccggtggcgcccgggcaggcttccagcggg > 1:344969‑M1/1‑7 (MQ=255) gcggcCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGTGGTCCCAGCTGATCGGCATCTGGTCGATCGCCgtgt > 1:456507/1‑236 (MQ=255) cactgaaggctgtggtggaaagcggccgcccgccgctgatcgactgccacccgctgttcaccatcaccgaggagaccggctcgggtgcagccggcgccctgccctgggacgtcagcgagttcgtcggcatcgacatcgccccggtggcgcccgggcaggcttccagcgagcatgcggtcagtg < 1:339514‑M1/183‑183 (MQ=255) | CCGGCCAGTTTCAGCAGGTGCCGGGACAGGTGGTAGTCGTAAGGCCCCGACGAGTCCTGCATGGCCACACTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGTGGTCCCAGCTGATCGGCATCTGGTCGATCGCCGTGT > AE015451/1946886‑1947342 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |