New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1947111 | 59 (1.020) | 4 (0.070) | 4/324 | NT | 6.6% | coding (629/1185 nt) | PP_1748 | conserved protein of unknown function |
? | AE015451 | = 1947134 | 57 (1.040) | coding (606/1185 nt) | PP_1748 | conserved protein of unknown function |
GTCGTAAGGCCCCGACGAGTCCTGCATGGCCACACTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGTGGTCCCAGCTGATCGGCATCTGGTCGATCGCCGTGTTGAATGCATGCCCGCTGGCC > AE015451/1946921‑1947362 | gTCGTAAGGCCCCGACGAGTCCTGCATGGCCACACTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACg < 1:685342/235‑1 (MQ=255) tCGTAAGGCCCCGACGAGTCCTGCATGGCCACACTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACg < 2:974614/234‑1 (MQ=255) ggCCCCGACGAGTCCTGCATGGCCACACTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACGGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCt > 1:723361/1‑235 (MQ=255) tCCTGCATGGCCACACTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGt < 1:752904/235‑1 (MQ=255) cacTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTg > 2:462786/1‑233 (MQ=255) cacTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCGGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTg < 1:339514‑M2/183‑2 (MQ=255) gACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGAtgctg > 1:524752/1‑232 (MQ=255) aCCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGAtgt < 1:1030757/232‑1 (MQ=255) cGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGcc < 1:739251/202‑1 (MQ=255) gCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGCACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTgccgccag < 2:300530‑M2/182‑9 (MQ=255) gCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGgc > 2:956426/1‑221 (MQ=255) cccgcTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGCCGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTgccgcca > 1:344969‑M2/3‑169 (MQ=255) cTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCGTTCCACCACCGCCTTCAGTGCCGCCAGCAAt > 2:349542/1‑181 (MQ=255) cGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATggg < 1:910767/236‑1 (MQ=255) gggCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATggg > 1:911881/1‑235 (MQ=255) tGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATg < 1:975535/236‑1 (MQ=255) ccGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGa < 2:1021226/196‑1 (MQ=255) gaACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAAt > 2:748632/1‑228 (MQ=255) cTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGt < 2:524749/154‑1 (MQ=255) tCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATggg < 1:300533/192‑1 (MQ=255) agggcagggcGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGt < 1:652497/104‑1 (MQ=255) agggcagggcGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGt > 2:652494/1‑104 (MQ=255) ggcGCCGGCTGCCCCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGt < 1:93726/137‑1 (MQ=255) agaccGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAg > 2:52170/4‑215 (MQ=255) cgcCGGCTGCACCCGAGCCGGGCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGTAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGcgcgcg < 2:924058/234‑1 (MQ=255) gcCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTgccgccagccgctgatcgactgccacccg < 1:635867‑M2/123‑30 (MQ=255) gcCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTgccgccagccgctgatcgactgccacccg > 2:635864‑M2/1‑94 (MQ=255) gcCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGCTGTGGCCGCTTTCGGCGaa > 2:320020/1‑165 (MQ=255) gcCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAgcgcg > 2:560630/1‑231 (MQ=255) gcCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTg > 1:562185/1‑235 (MQ=255) gcCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTg > 1:692025/1‑235 (MQ=255) gcCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTg > 1:463746/1‑235 (MQ=255) cTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTc > 1:746431/1‑220 (MQ=255) cTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTc < 2:746428/220‑1 (MQ=255) aCCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATc < 1:528687/186‑1 (MQ=255) 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cGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAg < 1:980581/235‑1 (MQ=255) cGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTGCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACggg < 2:3580/123‑1 (MQ=255) cctcGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAgcgcgc < 1:460405/209‑1 (MQ=255) ctcGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCAc < 2:989986/183‑1 (MQ=255) 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cGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGTGGTCCCAGCt < 2:781598/234‑1 (MQ=255) gTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGTGGTCCCAGCTGATCg > 1:268981/1‑236 (MQ=255) ggCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGCGGGCCCAGCTGATCGGc > 1:314562/1‑236 (MQ=255) gCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGTGGTCCCAGCTGATCGGc < 1:956429/235‑1 (MQ=255) gCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGTGGTCCCAGCTGATCGGc < 1:357604/235‑1 (MQ=255) tCGCTCCGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAgcgc < 1:41639/178‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGTGGTCCCAGCTGATCGGCATCTGGTc > 1:786418/1‑236 (MQ=255) 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cGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGTGGTCCCAGCTGATCGGCATCTGGTCGATCGCCGTGTTGAat < 1:555962/236‑1 (MQ=255) tttCCACCACAGCCTTCAGTgccgccagccgctgatcgactgccacccgctgtt < 2:285959‑M2/54‑35 (MQ=255) tttCCACCACAGCCTTCAGTgccgccagccgctgatcgactgccacccgctgtt > 1:285962‑M2/1‑20 (MQ=255) caccacAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGc < 2:58474/131‑1 (MQ=255) cTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGTGGTCCCAGCTGATCGGCATCTGGTCGATCGCCGTGTTGAATGCATGCCCGCTGGcc > 1:256741/1‑235 (MQ=255) | GTCGTAAGGCCCCGACGAGTCCTGCATGGCCACACTGACCGCATGCTCGCTGGAAGCCTGCCCGGGCGCCACCGGGGCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATCCAGGCGCACTTCCACGTGGTCCCAGCTGATCGGCATCTGGTCGATCGCCGTGTTGAATGCATGCCCGCTGGCC > AE015451/1946921‑1947362 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |