| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 2357939 | 53 (0.920) | 3 (0.050) | 3/324 | NT | 5.1% | coding (372/825 nt) | PP_2072 | Transcriptional regulator, AraC family |
| ? | AE015451 | = 2357967 | 61 (1.120) | coding (344/825 nt) | PP_2072 | Transcriptional regulator, AraC family | |||||
GTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCG > AE015451/2357716‑2358168 | gTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGAcgc > 1:1069940/1‑236 (MQ=255) cgGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTc > 2:840565/1‑236 (MQ=255) gCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGAc < 1:391463/227‑1 (MQ=255) tGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGa < 1:247926/235‑1 (MQ=255) cATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGAc < 2:726133/209‑1 (MQ=255) aGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAgg > 1:719928/1‑235 (MQ=255) aGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAgg > 1:922190/1‑235 (MQ=255) aGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAgg > 1:580335/1‑235 (MQ=255) tgtTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCcgccagcgaagcgttcg > 1:923132‑M2/1‑218 (MQ=255) aTGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCaaa < 2:1014299/234‑1 (MQ=255) cccACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCggga > 2:1059338/1‑198 (MQ=255) ccACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGTGCATAGGCTGa > 1:565566/1‑236 (MQ=255) gatgaAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTg < 2:549444/234‑1 (MQ=255) aGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCcgccagcga > 2:380765‑M2/1‑186 (MQ=255) gcgTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCa < 2:1076774/209‑1 (MQ=255) gcgTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCa > 1:1076777/1‑209 (MQ=255) ttCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGc < 2:1005529/196‑1 (MQ=255) tGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGc < 1:1012683/235‑1 (MQ=255) gcCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCg > 2:1044545/1‑233 (MQ=255) gcCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCg < 1:957315/236‑1 (MQ=255) gCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGcc < 1:1044548/236‑1 (MQ=255) gCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGcc < 2:740299/174‑1 (MQ=255) gCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAAGGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGGCGCGGGGCGCTGGACAGcc < 2:121436/117‑1 (MQ=255) cAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCa < 2:351434/149‑1 (MQ=255) gCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCgg < 1:331993/236‑1 (MQ=255) aTCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCAGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTg < 1:840568/236‑1 (MQ=255) tCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCt > 2:366460/1‑132 (MQ=255) cATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCcgccagcgaagcgttcgtacaggcagtggaccacgcgctggaaccattggaagaacagg > 1:71535‑M2/1‑99 (MQ=255) tACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGcc < 2:869306/198‑1 (MQ=255) tCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACGGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCg < 1:171950/235‑1 (MQ=255) ccTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGggctgtccagcgacccgcgtctgtaccacgccagcgaagcgttcgtacaggcagtggaccacgcgctggaaccattggaagaacaggacgccctgtatg > 1:71535‑M1/1‑59 (MQ=255) ccTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCgg > 1:393204/1‑235 (MQ=255) ccTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGt > 1:627047/1‑236 (MQ=255) ccTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGGCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAg > 1:177979/1‑223 (MQ=255) gTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTgg > 2:1055848/1‑128 (MQ=255) ttcttcCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAGCGCTTCGCTGGCGggcggtccagcgacccgcgtctgtacgacgccagcgacgcggtcgtac > 2:477866‑M1/1‑55 (MQ=255) ttcCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGCCGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACg < 2:330062/118‑1 (MQ=255) ttcCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTcc < 2:518683/202‑1 (MQ=255) tGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCa < 1:818000/236‑1 (MQ=255) gTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAg > 2:579803/1‑208 (MQ=255) gTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCa < 1:469492/234‑1 (MQ=255) 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tGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGaa > 1:702217/1‑234 (MQ=255) ccTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTACTGGCAGcct > 2:89847/1‑234 (MQ=255) gTACGACCGCGTCGCTGGCGTCGTACAGACGCGGGTCGCTGGACCGCCcgccagcgaagcgctcgtacaggcagtggaccacgcgctggaaccattggaagaa > 2:477866‑M2/1‑48 (MQ=255) tACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGAGCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCg < 2:116481/139‑1 (MQ=255) aCGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGCTCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTg > 2:53683/1‑141 (MQ=255) cGAACGCTTCGCTGGCGggctgtccagcgacccgcgtctgtaccacgccagcgaagcgttcgtacaggcagtggaccacgcgctggaaccattggaagaacaggacgccctgtatgacctggcgatcgccttgcgggccgtcggcggcaagccgcgcgggcgcaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataaca > 1:923132‑M1/1‑17 (MQ=255) cGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAgg > 1:129694/1‑67 (MQ=255) cGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGa > 1:586207/1‑225 (MQ=255) cGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGcaca > 1:473446/1‑236 (MQ=255) cGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGGAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCCGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCg > 1:166912/1‑192 (MQ=255) gAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCacac > 1:643965/1‑236 (MQ=255) aCGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACAcc < 2:744483/235‑1 (MQ=255) ttCGCTGGCGggctgtccagcgacccgcgtctgtaccacgccagcgaagcgttcgtacaggcagtggaacacgc > 2:484981‑M1/1‑10 (MQ=255) ttCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCa > 1:1062754/1‑236 (MQ=255) ttCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCGTGTAATGGAAGCttt > 2:520708/1‑224 (MQ=255) ttCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGAACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGt > 1:922029/1‑187 (MQ=255) tCGCTGGCGggctgtccagcgacccgcgtctgtaccacgccagcgaagcgttcgtacaggcagtggaccacgcgctggaaccattggaagaacaggacgccctgtatgacctggcgatcgccttgcgggccgtcggcggcaagccgcgcgggcgcaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccgagcct > 2:380765‑M1/1‑9 (MQ=255) cTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCg > 1:646560/1‑235 (MQ=255) | GTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCG > AE015451/2357716‑2358168 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |