| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 2357939 | 53 (0.920) | 3 (0.050) | 3/324 | NT | 5.1% | coding (372/825 nt) | PP_2072 | Transcriptional regulator, AraC family |
| ? | AE015451 | = 2357967 | 61 (1.120) | coding (344/825 nt) | PP_2072 | Transcriptional regulator, AraC family | |||||
AGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGCCGATCGAATAGGTATC > AE015451/2357748‑2358190 | aGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAgg > 1:922190/1‑235 (MQ=255)aGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAgg > 1:719928/1‑235 (MQ=255)aGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAgg > 1:580335/1‑235 (MQ=255) tgtTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCcgccagcgaagcgttcg > 1:923132‑M2/1‑218 (MQ=255) aTGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCaaa < 2:1014299/234‑1 (MQ=255) ccACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGTGCATAGGCTGa > 1:565566/1‑236 (MQ=255) gatgaAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTg < 2:549444/234‑1 (MQ=255) aGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCcgccagcga > 2:380765‑M2/1‑186 (MQ=255) gcgTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCa > 1:1076777/1‑209 (MQ=255) gcgTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCa < 2:1076774/209‑1 (MQ=255) ttCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGc < 2:1005529/196‑1 (MQ=255) tGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGc < 1:1012683/235‑1 (MQ=255) gcCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCg > 2:1044545/1‑233 (MQ=255) gcCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCg < 1:957315/236‑1 (MQ=255) gCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGcc < 1:1044548/236‑1 (MQ=255) gCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGcc < 2:740299/174‑1 (MQ=255) gCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAAGGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGGCGCGGGGCGCTGGACAGcc < 2:121436/117‑1 (MQ=255) cAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCa < 2:351434/149‑1 (MQ=255) gCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCgg < 1:331993/236‑1 (MQ=255) aTCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCAGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTg < 1:840568/236‑1 (MQ=255) tCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCt > 2:366460/1‑132 (MQ=255) cATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCcgccagcgaagcgttcgtacaggcagtggaccacgcgctggaaccattggaagaacagg > 1:71535‑M2/1‑99 (MQ=255) tACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGcc < 2:869306/198‑1 (MQ=255) tCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACGGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCg < 1:171950/235‑1 (MQ=255) ccTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCgg > 1:393204/1‑235 (MQ=255) ccTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGt > 1:627047/1‑236 (MQ=255) ccTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGGCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAg > 1:177979/1‑223 (MQ=255) gTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTgg > 2:1055848/1‑128 (MQ=255) ttcCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGCCGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACg < 2:330062/118‑1 (MQ=255) ttcCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTcc < 2:518683/202‑1 (MQ=255) tGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCa < 1:818000/236‑1 (MQ=255) gTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAg > 2:579803/1‑208 (MQ=255) gTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCa < 1:469492/234‑1 (MQ=255) gTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGc > 1:652957/1‑236 (MQ=255) cAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGt > 1:495704/1‑224 (MQ=255) gcgTGTTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCcgccagcgaa > 2:484981‑M2/1‑64 (MQ=255) gTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCt < 1:941610/148‑1 (MQ=255) tGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGaa > 1:702217/1‑234 (MQ=255) ccTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTACTGGCAGcct > 2:89847/1‑234 (MQ=255) gTACGACCGCGTCGCTGGCGTCGTACAGACGCGGGTCGCTGGACCGCCcgccagcgaagcgctcgtacaggcagtggaccacgcgctggaaccattggaagaa > 2:477866‑M2/1‑48 (MQ=255) tACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGAGCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCg < 2:116481/139‑1 (MQ=255) aCGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGCTCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTg > 2:53683/1‑141 (MQ=255) 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gAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCacac > 1:643965/1‑236 (MQ=255) aCGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACAcc < 2:744483/235‑1 (MQ=255) ttCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCa > 1:1062754/1‑236 (MQ=255) ttCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCGTGTAATGGAAGCttt > 2:520708/1‑224 (MQ=255) ttCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGAACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGt > 1:922029/1‑187 (MQ=255) cTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCg > 1:646560/1‑235 (MQ=255) tGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGcc < 1:1059341/236‑1 (MQ=255) 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aCGCGGGGCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGAGCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGcc < 1:258504/228‑1 (MQ=255) cgcgGGTCGCTCGCCAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGcc < 2:954320/72‑1 (MQ=255) gcgGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCCGCACCAGCGTGTTGCCCGGTa > 2:344984/1‑168 (MQ=255) cgGGGCGCGGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTc < 2:300238/126‑1 (MQ=255) cGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCg < 2:371227/66‑1 (MQ=255) cGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCg > 1:371230/1‑66 (MQ=255) cGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGCCGATCGAATAGGTATc > 1:962109/1‑235 (MQ=255) cGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGCCGATAGAATAgg > 2:846310/1‑231 (MQ=255) gCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGc < 2:663398/199‑1 (MQ=255) aCAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACAcc < 2:634518/199‑1 (MQ=255) | AGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTGGTACAGACGCGGGTCGCTGGACAGCCCGCCAGCGATGAAGGGCAAAGGCTGACCACCCAGCACGTTCTGGATCAGTGCCGGGTCGACGTAGGCCATGCGGTAGCGAAAGCCTGCGTCGGTGCCGGCCATGCCGTCATGCAGTTCGTCCGGGTGCAGCACCAGCGTGTTGCCCGGTATGCCGTGGCGCAGCGAACCCTTGTAATGGAAGCTTTGCACACCGGCCAGCGTACGGCCGATCGAATAGGTATC > AE015451/2357748‑2358190 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |