New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 2792287 | 41 (0.710) | 3 (0.050) | 3/326 | NT | 6.4% | coding (252/894 nt) | PP_2444 | Transcriptional regulator, LysR family |
? | AE015451 | = 2792374 | 48 (0.870) | coding (165/894 nt) | PP_2444 | Transcriptional regulator, LysR family |
GGCTGTAGCACTTGATGTCCAGGTGGTTAGGCATGGGGCTGTCGGATATCACCAGGTCCAGGCGCTGGATAGCCAGGTCTGCCAGTAACCGCTCAAGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATG > AE015451/2792058‑2792517 | ggCTGTAGCACTTGATGTCCAGGTGGTTAGGCATGGGGCTGTCGGATATCACCAGGTCCAGGCGCTGGATAGCCAGGTCTGCCAGTAACCGCTCAAGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACgcag < 1:426122/235‑1 (MQ=255) gTCCAGGTGGTTAGGCATGGGGCTGTCGGATATCACCAGGTCCAGGCGCTGGATAGCCAGGTCTGCCAGTAACCGCTCAAGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGc < 1:666905/236‑1 (MQ=255) ggCATGGGGCTGTCGGATATCCCCAGGTCCAGGCGCTGGATAGCCAGGTCTGCCAGTAACCGCTCAAGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGaaa < 1:102290/236‑1 (MQ=255) gggCTGTCGGATATCACCAGGTCCAGGCGCTGGATAGCCAGGTCTGCCAGTAACCGCTCAAGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACAtctg < 1:170998/236‑1 (MQ=255) cTGTCGGATATCACCAGGTCCAGGCGCTGGATAGCCAGGTCTGCCAGTAACCGCTCAAGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCggt > 1:116042/1‑219 (MQ=255) cTGTCGGATATCACCAGGTCCAGGCGCTGGATAGCCAGGTCTGCCAGTAACCGCTCAAGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACAtctgct > 1:687731/1‑235 (MQ=255) tCGGATATCACCAGGTCCAGGCGCTGGATAGCCAGGTCTGCCAGTAACCGCTCAAGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACAtctgctctg < 1:502802/235‑1 (MQ=255) ggATATCACCAGGTCCAGGCGCTGGATAGCCAGGTCTGCCAGTAACCGCTCAAGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCAt > 1:491162/1‑236 (MQ=255) cAGGCGCTGGATAGCCAGGTCTGCCAGTAACCGCTCAAGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGAc > 1:906368/1‑236 (MQ=255) tAGCCAGGTCTGCCAGTAACCGCTCAAGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACgca > 2:492337/1‑165 (MQ=255) ccGCTCAAGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACAtct < 1:91494/182‑1 (MQ=255) cGCTCAAGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCCTACACCAGGGCCTGACGGCCGGtt > 1:320783/1‑213 (MQ=255) aaGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACAtct > 2:272255/1‑176 (MQ=255) aaGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACAtct < 1:272258/176‑1 (MQ=255) aaGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGATCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATCCACCCggg > 2:332700/1‑194 (MQ=255) aGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTGGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCtgccggccctcaag > 1:665006‑M2/1‑222 (MQ=255) tGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCCGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTg < 1:257827/235‑1 (MQ=255) gTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGaaa < 1:994592/165‑1 (MQ=255) cTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACAtct < 2:647518/167‑1 (MQ=255) cgGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCTGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGtt < 1:756952/235‑1 (MQ=255) aGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAg > 1:729213/1‑235 (MQ=255) aTGCGCAGCACCTCCTCCCGGTCCATGGTCGGTGCCCGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGAc < 2:230420/178‑1 (MQ=255) gTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAgg > 1:146746/1‑225 (MQ=255) gTCGGCGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTc < 2:762774/161‑1 (MQ=255) tCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGcc > 2:932891/1‑234 (MQ=255) gCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTg > 2:14234/1‑209 (MQ=255) ccAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGAGCTGAAACATCTGCTCTGCaca > 2:878718/1‑128 (MQ=255) tAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTg < 2:991638/173‑1 (MQ=255) tAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTg > 1:991641/1‑173 (MQ=255) tAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGgtgt > 1:514381/1‑236 (MQ=255) tAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGgtgt > 1:948082/1‑236 (MQ=255) cacGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCAgctggaactgacagaaaccggccgtcaggccctggtgtatgcagagcagatgtttcagatcggcagcgagcttgaagcca > 1:667334‑M1/1‑49 (MQ=255) gTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCGGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGgcgc > 1:821661/1‑236 (MQ=255) cccACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCAGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGAt > 2:831430/1‑233 (MQ=255) cccACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTCCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCCTACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGCTCCAGCTGCCGGCCACAGCGCTGGCACAGTTCCAGGCCGTAgg > 2:185961/1‑160 (MQ=255) cacaCGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCAgctggaactgacagaaac > 1:394669‑M1/1‑34 (MQ=255) ggAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGc > 2:720257/1‑176 (MQ=255) aGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTCCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTgg > 2:3050/1‑129 (MQ=255) aTCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTgg < 2:491159/232‑1 (MQ=255) cTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTAGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACg < 2:840372/235‑1 (MQ=255) gCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACg < 2:687728/233‑1 (MQ=255) tctTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTtggct < 2:729210/200‑1 (MQ=255) ctTGAGGGCCGGCAgctggaactgacagaaaccggccgtcaggccctggtgtatgcagagcagatgtttcagatcggcagcgagcttgaagccatgctgcgtgccggccctcaagagcagatcctgttccgtgtgggggtggctgacgtggtgcccaaatccattgtctaccgcctgctggcacccaccatggacctggaggaggtgctgcgcatcaactgccgcgaggacaaact > 1:665006‑M1/1‑14 (MQ=255) ctTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAGACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCGGTTCCAGCtgc < 2:673458‑M2/104‑4 (MQ=255) ctTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGAtgctg > 2:718626/1‑215 (MQ=255) tGAGGGCCGGCGCGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCtgccggc > 2:130527‑M2/1‑99 (MQ=255) ggCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACAtctgctc < 1:263196/52‑1 (MQ=255) ggCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACAtctgctc > 2:263193/1‑52 (MQ=255) gCCGGCAgctggaactgacagaaaccggccgtcaggccctggtgtatgcagagcagatgtttcagatcggcagcgagcttgaagccatgctgcgcgccggccctca > 2:130527‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATg < 1:123136/236‑1 (MQ=255) gCAgctggaaccgacagaaaccggccgtcaggccctggtgtatgcagagcagatgtctcagatcggcagcgagcttgaagccatgctgcgtgccggccctcaag < 2:673458‑M1/104‑102 (MQ=255) | GGCTGTAGCACTTGATGTCCAGGTGGTTAGGCATGGGGCTGTCGGATATCACCAGGTCCAGGCGCTGGATAGCCAGGTCTGCCAGTAACCGCTCAAGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATG > AE015451/2792058‑2792517 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |