| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 2792287 | 41 (0.710) | 3 (0.050) | 3/326 | NT | 6.4% | coding (252/894 nt) | PP_2444 | Transcriptional regulator, LysR family |
| ? | AE015451 | = 2792374 | 48 (0.870) | coding (165/894 nt) | PP_2444 | Transcriptional regulator, LysR family | |||||
AGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTGGCGATAGTTAAGCACCGTCGGTCGTTCCGATTCGTAAAAACCGAAGTATATGCCATGAAAATACGAATTTTCCTGAACTAT > AE015451/2792153‑2792604 | aGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTGGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCtgccggccctcaag > 1:665006‑M2/1‑222 (MQ=255) tGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCCGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTg < 1:257827/235‑1 (MQ=255) cgGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCTGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGtt < 1:756952/235‑1 (MQ=255) aGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAg > 1:729213/1‑235 (MQ=255) gTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAgg > 1:146746/1‑225 (MQ=255) tCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGcc > 2:932891/1‑234 (MQ=255) gCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTg > 2:14234/1‑209 (MQ=255) tAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTg < 2:991638/173‑1 (MQ=255) tAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTg > 1:991641/1‑173 (MQ=255) tAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGgtgt > 1:948082/1‑236 (MQ=255) tAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGgtgt > 1:514381/1‑236 (MQ=255) gTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCGGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGgcgc > 1:821661/1‑236 (MQ=255) cccACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCAGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGAt > 2:831430/1‑233 (MQ=255) cccACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTCCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCCTACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGCTCCAGCTGCCGGCCACAGCGCTGGCACAGTTCCAGGCCGTAgg > 2:185961/1‑160 (MQ=255) ggAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGc > 2:720257/1‑176 (MQ=255) aGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTCCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTgg > 2:3050/1‑129 (MQ=255) aTCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTgg < 2:491159/232‑1 (MQ=255) cTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTAGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACg < 2:840372/235‑1 (MQ=255) gCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACg < 2:687728/233‑1 (MQ=255) tctTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTtggct < 2:729210/200‑1 (MQ=255) ctTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAGACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCGGTTCCAGCtgc < 2:673458‑M2/104‑4 (MQ=255) ctTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGAtgctg > 2:718626/1‑215 (MQ=255) tGAGGGCCGGCGCGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCtgccggc > 2:130527‑M2/1‑99 (MQ=255) ccGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATg < 1:123136/236‑1 (MQ=255) gcaTGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTgg < 2:948079/233‑1 (MQ=255) tGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCtgccggccctcaagagcagatcctgttccgtgtgggggtggctgacgtg > 1:667334‑M2/1‑80 (MQ=255) aaGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATg < 1:620178/216‑1 (MQ=255) cTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTGCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTtggct < 1:720260/156‑1 (MQ=255) aaaCATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACgg < 2:514378/185‑1 (MQ=255) gctctgcATACACCAGGGCCTTACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTGGCGATAGTTAAGCACCGTCGGTCGTTCCGATTCGTaaaa < 1:575563/235‑1 (MQ=255) ctctgcATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTGGCGa > 2:531627/1‑199 (MQ=255) ctgcATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTGGCGATAGTTAAGCACCGTCGGTCGTTCCGATTCGTAAAAAcc > 1:635071/1‑235 (MQ=255) acacCAGGGCCTGACGGCCGTTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGt < 2:229004/109‑1 (MQ=255) acacCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGcc > 1:538288/1‑170 (MQ=255) acacCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGcc < 2:538285/170‑1 (MQ=255) acCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTtggct < 2:146744/134‑1 (MQ=255) aGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGgtga > 1:170282/1‑112 (MQ=255) aGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTGGCGATAGTTAAGCACCGTCGGTCGTTCCGATTCGTAAAAACCGa > 1:998018/1‑226 (MQ=255) aGGGCCTGACGGCCGGTTTCTATCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTGGCGATAGTTAAGCACCGTCGGTCGTTCCGATTCGTAAAAACCGAAGTatat > 2:1031384/1‑233 (MQ=255) cTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTGGCGATAGTTAAGCACCGTCGGTCGTTCCGATTCGTAACAACCGAAGTATATGCCATGaa > 1:65503/1‑236 (MQ=255) cTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTGGCGATAGTTAAGCACCGTCGGTCGTTCCGATTCGTAAAAACCGAAGTATATGCCATGaa > 1:366503/1‑236 (MQ=255) cTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATACTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAAc > 2:25074/1‑175 (MQ=255) gACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCggg < 2:278232/132‑1 (MQ=255) gcGGCCGGTTGCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGc < 2:262273/149‑1 (MQ=255) ggCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGttt > 1:196143/1‑96 (MQ=255) ggCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTGGCGATAGTTAAGCACCGTCGGTCGTTCCGCTTCGTAAAAACCGAAGta > 1:270814/1‑220 (MQ=255) ggCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTGGCGATAGTTAAGCACCGTCGGTCGTTCCGATTCGTAAAAACCGAAGTATATGCCATGAAAAt > 2:581865/1‑234 (MQ=255) gCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGGTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTGGCGATAGTTAAGCACCGTCGGTCGTTCCGATTCGTAAAAACCGAAGTATATGCCATGAAAATAc < 1:581868/235‑1 (MQ=255) ccGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTgg < 1:831433/171‑1 (MQ=255) gTTTCTGTCAGTTCCAGCtgccggccctcaagagcagatcctgttccgtgtg > 1:394669‑M2/1‑18 (MQ=255) cAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGACCAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTgg < 2:913293/134‑1 (MQ=255) ttCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTGGCGa < 1:1087181/160‑1 (MQ=255) tCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCGCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTGGCGATAGTTAAGCACCGTCGGTCGTTCCGATTCGTAAAAACCGAAGTATATGCCATGAAAATACGAATTTTCCTGAACTAt < 1:14234/236‑1 (MQ=255) | AGTTTGTCCTCGCGGCAGTTGATGCGCAGCACCTCCTCCAGGTCCATGGTCGGTGCCAGCAGGCGGTAGACAATGGATTTGGGCACCACGTCAGCCACCCCCACACGGAACAGGATCTGCTCTTGAGGGCCGGCACGCAGCATGGCTTCAAGCTCGCTGCCGATCTGAAACATCTGCTCTGCATACACCAGGGCCTGACGGCCGGTTTCTGTCAGTTCCAGCTGCCGGCCAGCGCGCTGGAACAGTTCCAGGCCGTAGGTTTGCTCGAACAGGGTGATCTGCCCGCTGATGGTTTGCGGTGTGAGGTTCAGCTGTTGGCTGGCGCGGGTGATGCTGCCCGTCTTGGCCACGGCCCAGAAGTAATGCAACTGGCGATAGTTAAGCACCGTCGGTCGTTCCGATTCGTAAAAACCGAAGTATATGCCATGAAAATACGAATTTTCCTGAACTAT > AE015451/2792153‑2792604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |