New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 3782714 | 50 (0.870) | 3 (0.050) | 3/326 | NT | 6.5% | coding (651/846 nt) | nikC | nickel ABC transporter permease subunit |
? | AE015451 | = 3782954 | 38 (0.690) | coding (45/771 nt) | nikD | nickel ABC transporter ATP‑binding subunit |
CCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGCGATGCGCTGCGCGACCGCCTGGACCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCA > AE015451/3782483‑3782946 | ccTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCg > 1:784008/1‑235 (MQ=255) gATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCg > 1:558108/1‑236 (MQ=255) ccTGGTATGCGCGCTTGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGggtttctatgcgaaggccacggatttcaagcac < 1:220974‑M1/224‑34 (MQ=255) ccTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGc < 1:836325/236‑1 (MQ=255) cTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCg > 1:890090/1‑236 (MQ=255) ggTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCAcc > 1:641821/1‑221 (MQ=255) ggTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCAcc < 2:641818/221‑1 (MQ=255) ggTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCg > 1:587749/1‑234 (MQ=255) ggTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCg > 1:498838/1‑234 (MQ=255) ggTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGt > 1:468664/1‑235 (MQ=255) cgcATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGATGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTTGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGtg > 2:1054353/1‑228 (MQ=255) gcATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGggtttctatgcgaaggccacggatttcaagcaccgacggactcattcaatggctgt > 1:533848‑M1/1‑179 (MQ=255) gcATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCaa > 1:84838/1‑235 (MQ=255) gcATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTAGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCAGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACCTGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCt > 1:577324/1‑187 (MQ=255) aTGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAacg > 1:378666/1‑235 (MQ=255) ggTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGcc < 2:828654/201‑1 (MQ=255) ccTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAgg > 2:542825/1‑233 (MQ=255) aTTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCa < 1:199165/214‑1 (MQ=255) tGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTg < 2:923410/234‑1 (MQ=255) cAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGc > 1:730568/1‑235 (MQ=255) gCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGggtttctatgcgaaggccacggatttcaagcaccgacg < 2:533845‑M1/184‑39 (MQ=255) cgcgAATACGGATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCAGaa < 2:577664/234‑1 (MQ=255) tATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGtt < 1:1054356/235‑1 (MQ=255) ccGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAacgacg < 2:1001701/177‑1 (MQ=255) cGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGAtcttc > 1:1047824/1‑235 (MQ=255) ggCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCCCCGCCGACTGGGGCGTGATGACCAactc > 2:345545/1‑171 (MQ=255) gcgcGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCtt > 1:379840/1‑236 (MQ=255) gcgcGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCtt > 1:959722/1‑236 (MQ=255) cgcgGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACaa < 2:424007/188‑1 (MQ=255) gcgGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTTATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACaa < 1:748728/187‑1 (MQ=255) cAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACCTGCTGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCAccccc > 2:64348/1‑123 (MQ=255) cAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTc > 1:419484/1‑225 (MQ=255) cAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTc < 2:419481/225‑1 (MQ=255) ccAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGCGAtgcgctgc < 2:468661/234‑1 (MQ=255) aaTATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCgggg < 2:839941/91‑1 (MQ=255) aaTATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCgggg > 1:839944/1‑91 (MQ=255) tatCGCCGGCCCGTTGCTGGGGCGGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTg < 2:80403/147‑1 (MQ=255) cGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCa > 2:652835/1‑140 (MQ=255) cGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTcgcg > 2:125481/1‑185 (MQ=255) gTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTg < 2:760547/135‑1 (MQ=255) gCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGCGATGCGCTGCGCGACCGCCTGGACCCTGCACAGGTgc > 1:412692/1‑232 (MQ=255) aaCCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGCGATGCGCTGCGCGACCGCCt < 2:740047/213‑1 (MQ=255) aaCCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCGTCAAct > 2:919034/1‑184 (MQ=255) aCATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGc > 2:189465/1‑185 (MQ=255) ccACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGCGATGCGCTGCGCGACCGCCTGGACCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCg > 1:80617/1‑235 (MQ=255) caTGAGGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGCATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAActg < 2:213127/118‑1 (MQ=255) gatgCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGCGATGCGCTGCGCGACCGCCTGGACCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTg > 1:682559/1‑236 (MQ=255) gatgCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGCGATGCGCTGCGCGACCGCCTGGACCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTg > 1:469941/1‑236 (MQ=255) gctgcACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGCGATGCGCTGCGCGACCGCCTGGACCCTGCACAg < 1:20870/202‑1 (MQ=255) tgcACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGCGATGCGCTGCGCGACCGCCTGGACCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAAt < 1:85296/235‑1 (MQ=255) tcCGGCCGGTCGTTCCGTGGCCTCGGGGGGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACctgctg < 2:216799/156‑1 (MQ=255) cGGCCTGggtttctatgcgaaggccacggatttcaagcaccgacggactcattcaatggcgctcctgtgcagggtccaggcggtcgcgcagcgcatcgcccagcaggttgaaggccatcaccgagaagaagatcatcagccctggcaacagcagcagttgtggctgcgtccagatgaattccttggcgtcgttgatcat > 2:1036810‑M1/1‑7 (MQ=255) cGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGCGATGCGCTGCGCGACCGCCTGGACCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATc > 1:700941/1‑226 (MQ=255) cGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGCGATGCGCTGCGCGACCGCCTGGACCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATc < 2:700938/226‑1 (MQ=255) ggCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGCGATGCGCTGCGCGACCGCCTGGACCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCg > 1:465361/1‑236 (MQ=255) gTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGCGATGCGCTGCGCGACCGCCTGGACCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCa < 2:682556/233‑1 (MQ=255) | CCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGATCTTCTTCTCGGTGATGGCCTTCAACCTGCTGGGCGATGCGCTGCGCGACCGCCTGGACCCTGCACAGGAGCGCCATTGAATGAGTCCGTCGGTGCTTGAAATCCGTGGCCTTCGCA > AE015451/3782483‑3782946 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |