New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 4290853 | 43 (0.750) | 4 (0.070) | 4/324 | NT | 8.9% | coding (1734/3468 nt) | PP_3761 | Sensor histidine kinase/response regulator |
? | AE015451 | = 4290920 | 41 (0.750) | coding (1667/3468 nt) | PP_3761 | Sensor histidine kinase/response regulator |
GCCGCAATGCCGATGCCGGTGTCACGGACTGCGAACACGATACCGCTGTCAGCCTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTGAGCGG > AE015451/4290635‑4291086 | gCCGCAATGCCGATGCCGGTGTCTCGGACTGCGACCACGATACCGCTGTCAGCCTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCGGGCCACGCTCGGTGAACTTGATAGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCcg < 1:188267/234‑1 (MQ=255) ggTGTCACGGACTGCGAACACGATACCGCTGTCAGCCTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTg > 1:282985/1‑207 (MQ=255) ggTGTCACGGACTGCGAACACGATACCGCTGTCAGCCTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGgc < 1:804579/236‑1 (MQ=255) gtgtCACGGACTGCGAACACGATACCGCTGTCAGCCTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGgc < 1:399173/235‑1 (MQ=255) gAACACGATACCGCTGTCATCCTGGAAGCTGACGGTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGAGCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGGGACCGGCAAGCGGCTGGa > 1:311903/1‑194 (MQ=255) acacGATACCGCTGTCAGCCTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGc > 2:835859/1‑188 (MQ=255) ccGCTGTCAGCCTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGcc > 1:566979/1‑235 (MQ=255) tCAGCCTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTc < 1:781060/236‑1 (MQ=255) cAGCCTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCcg > 2:725551/1‑185 (MQ=255) gCCTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCaa > 2:1006867/1‑235 (MQ=255) cTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACa > 1:304230/1‑176 (MQ=255) cTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTc > 2:781057/1‑204 (MQ=255) cTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgct > 1:675731‑M2/1‑233 (MQ=255) cTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgcttgccgg > 1:1006870‑M2/1‑226 (MQ=255) cGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTc > 1:880113/1‑235 (MQ=255) gTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCgg > 1:691314/1‑209 (MQ=255) gTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCgg < 2:691311/209‑1 (MQ=255) gTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGa > 1:736520/1‑236 (MQ=255) ttCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCCCGAccc > 1:86376/1‑195 (MQ=255) tGCTGGCCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTg < 1:346525/236‑1 (MQ=255) tCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGc < 1:53014/221‑1 (MQ=255) ggCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTTGGGCCGTACTTCAAgcttgcc > 2:441059‑M2/1‑185 (MQ=255) acaacaGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCg > 1:791854/1‑236 (MQ=255) gTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGGTATCGCGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTgccg > 1:940977/1‑235 (MQ=255) ggATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTa > 1:636484/1‑235 (MQ=255) gCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCga < 2:1004345/186‑1 (MQ=255) gCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCga > 1:1004348/1‑186 (MQ=255) tCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCttgaagtacggcccgaaaccacccaggtcgagcgcctggtcgaaggctt > 2:1086821‑M1/1‑87 (MQ=255) tCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCttgaagtacggcccgaaaccacccaggtcgagcgcctggtcgaaggctt < 1:1086824‑M1/136‑50 (MQ=255) ccAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCg > 1:923768/1‑236 (MQ=255) ccAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGGGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgcttgcccg < 1:140537‑M2/162‑10 (MQ=255) tGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAAtgttgt < 2:577374/184‑1 (MQ=255) cggtcggtGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACCTGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTCTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCgaga > 2:41938/1‑174 (MQ=255) cggtcggtGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgctt < 2:1046296‑M2/146‑5 (MQ=255) cggtcggtGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCCGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATg > 1:323231/1‑219 (MQ=255) ggtcggtGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTg < 2:923765/233‑1 (MQ=255) gtcggtGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCt < 1:831593/236‑1 (MQ=255) tGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGAcc > 1:783062/1‑230 (MQ=255) aGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGGTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCgg > 2:131969/1‑159 (MQ=255) tGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGGGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCgag > 1:158090/1‑157 (MQ=255) aCCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCttgaagtacggcccgaaaccacccaggtcgagcgcctggtcgaaggcttgcgcggcatgttccagccgcttgccggtcacaaggggctggcctt > 1:532255‑M1/1‑57 (MQ=255) ccGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgcttgccggtcacaaggggctggccttcgaggtcaa > 1:749124‑M2/1‑123 (MQ=255) ccGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTg > 1:814032/1‑164 (MQ=255) tACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCACCTTGTGACCGGCAGGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCt < 2:8206/137‑1 (MQ=255) cTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGtt > 2:848816/1‑234 (MQ=255) ttGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCttgaagtacggcccgaaaccacccaggtcgagcgcctggtcgaaggcttgcgcggcatgttccagccgcttgccggtcacaaggggctggccttcgaggtcaaggtcgagccgcaggtaccgg > 1:749124‑M1/1‑36 (MQ=255) tCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgct < 2:855875‑M2/100‑4 (MQ=255) tCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgct > 1:855878‑M2/1‑97 (MQ=255) aaGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgcttgccggtcacaaggggctggccttcgaggtcaaggtcgagccgcaggtaccggt > 1:532255‑M2/1‑94 (MQ=255) ggCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTgccggcc > 2:802885/1‑160 (MQ=255) cgCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGgc < 2:230778/54‑1 (MQ=255) gCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGTATGTCGTTGCTCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGTCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGtt > 1:214269/1‑199 (MQ=255) ccccTCGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCtt < 1:118195/225‑1 (MQ=255) cccTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCa < 1:848819/235‑1 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ccGGCAAGCttgaagtacggcccgaaaccacccaggtcgagcgcctggtcgaaggcttgcgcggcatgttccagccgcttgccggtcacaaggggctggccttcgaggtcaaggtcgagccgcaggtaccggtcacgctgttcaccgaccgtcagcgcctggagcagatcctcaagaacctgttgtccaacgccatcaagttcaccgagcgtggccaggtcagcatgaacgtcag > 1:1006870‑M1/1‑9 (MQ=255) ggCAAGCttgaagtacggcccaaaaccacccaggtcgagcgcctggtcgaaggcttgcgcggcatgttccagccgcttgccggtcacaaggggctggccttcgaggtcaaggtcgagccgcaggtaccggtcacgctgttcaccgaccgtcagcgcctggagcagatcctcaagaacctgttgtccaacgcc > 2:441059‑M1/1‑7 (MQ=255) gCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTGa > 1:881281/1‑235 (MQ=255) cAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTg > 2:941431/1‑233 (MQ=255) aaGCttgaagtacggcccgaaaccacccaggtcgagcgcctggtcgaaggcttgcgcggcatgttccagccgcttgccggtcacaaggggctggccttcgaggtcaaggtcgagccgcaggtaccggtcacgctgttcaccgaccg < 2:1046296‑M1/146‑143 (MQ=255) aGCttgaagtacggcccgaaaccacccaggtcgagcgcctggtcgaaggcttgcgcggcatgttccagccgcttgccggtcacaaggggctggccttcgaggtcaaggtcgagccgcaggtaccggtcacgctgttcaccgaccgtcagcgcctggagcagatcctcaagaacctgttgtccaacgccatcaagttcaccgagcgtggccaggtcagcatgaacgtcagcttccag > 1:675731‑M1/1‑3 (MQ=255) aGCttgaagtacggcccgaaaccacccaggtcgagcgcctggtcgaaggcttgcgcggcatgttccagccgcttgccggtcacaaggggctggccttcga > 1:855878‑M1/1‑3 (MQ=255) aGCttgaagtacggcccgaaaccacccaggtcgagcgcctggtcgaaggcttgcgcggcatgttccagccgcttgccggtcacaaggggctggccttcga < 2:855875‑M1/100‑98 (MQ=255) aGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGc > 2:397306/1‑207 (MQ=255) gCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTGAgcgg > 1:757631/1‑235 (MQ=255) | GCCGCAATGCCGATGCCGGTGTCACGGACTGCGAACACGATACCGCTGTCAGCCTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTGAGCGG > AE015451/4290635‑4291086 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |